Quinoa all test code coverage report
Current view: top level - PDE/Integrate - Source.cpp (source / functions) Hit Total Coverage
Commit: Quinoa_v0.3-957-gb4f0efae0 Lines: 35 35 100.0 %
Date: 2021-11-09 15:14:18 Functions: 2 2 100.0 %
Legend: Lines: hit not hit | Branches: + taken - not taken # not executed Branches: 24 34 70.6 %

           Branch data     Line data    Source code
       1                 :            : // *****************************************************************************
       2                 :            : /*!
       3                 :            :   \file      src/PDE/Integrate/Source.cpp
       4                 :            :   \copyright 2012-2015 J. Bakosi,
       5                 :            :              2016-2018 Los Alamos National Security, LLC.,
       6                 :            :              2019-2021 Triad National Security, LLC.
       7                 :            :              All rights reserved. See the LICENSE file for details.
       8                 :            :   \brief     Functions for computing integrals of an arbitrary source term of a
       9                 :            :      for single-material compressible flow, CompFlow using DG methods
      10                 :            :   \details   This file contains functionality for computing integrals of an
      11                 :            :      arbitrary source term for single-material compressible flow, CompFlow with
      12                 :            :      discontinuous Galerkin methods for various orders of numerical
      13                 :            :      representation.
      14                 :            : */
      15                 :            : // *****************************************************************************
      16                 :            : 
      17                 :            : #include <vector>
      18                 :            : 
      19                 :            : #include "Source.hpp"
      20                 :            : #include "Quadrature.hpp"
      21                 :            : 
      22                 :            : void
      23                 :      16320 : tk::srcInt( ncomp_t system,
      24                 :            :             ncomp_t offset,
      25                 :            :             real t,
      26                 :            :             const std::size_t ndof,
      27                 :            :             const std::size_t nelem,
      28                 :            :             const std::vector< std::size_t >& inpoel,
      29                 :            :             const UnsMesh::Coords& coord,
      30                 :            :             const Fields& geoElem,
      31                 :            :             const CompFlowSrcFn& src,
      32                 :            :             const std::vector< std::size_t >& ndofel,
      33                 :            :             Fields& R )
      34                 :            : // *****************************************************************************
      35                 :            : //  Compute source term integrals for DG
      36                 :            : //! \param[in] system Equation system index
      37                 :            : //! \param[in] offset Offset this PDE system operates from
      38                 :            : //! \param[in] t Physical time
      39                 :            : //! \param[in] ndof Maximum number of degrees of freedom
      40                 :            : //! \param[in] nelem Maximum number of elements
      41                 :            : //! \param[in] inpoel Element-node connectivity
      42                 :            : //! \param[in] coord Array of nodal coordinates
      43                 :            : //! \param[in] geoElem Element geometry array
      44                 :            : //! \param[in] src Source function to use
      45                 :            : //! \param[in] ndofel Vector of local number of degrees of freedome
      46                 :            : //! \param[in,out] R Right-hand side vector computed
      47                 :            : // *****************************************************************************
      48                 :            : {
      49                 :            :   const auto& cx = coord[0];
      50                 :            :   const auto& cy = coord[1];
      51                 :            :   const auto& cz = coord[2];
      52                 :            : 
      53         [ +  + ]:    5573700 :   for (std::size_t e=0; e<nelem; ++e)
      54                 :            :   {
      55                 :    5557380 :     auto ng = tk::NGvol(ndofel[e]);
      56                 :            : 
      57                 :            :     // arrays for quadrature points
      58                 :            :     std::array< std::vector< real >, 3 > coordgp;
      59                 :            :     std::vector< real > wgp;
      60                 :            : 
      61         [ +  - ]:    5557380 :     coordgp[0].resize( ng );
      62         [ +  - ]:    5557380 :     coordgp[1].resize( ng );
      63         [ +  - ]:    5557380 :     coordgp[2].resize( ng );
      64         [ +  - ]:    5557380 :     wgp.resize( ng );
      65                 :            : 
      66         [ +  - ]:    5557380 :     GaussQuadratureTet( ng, coordgp, wgp );
      67                 :            : 
      68                 :            :     // Extract the element coordinates
      69                 :            :     std::array< std::array< real, 3>, 4 > coordel {{
      70                 :    5557380 :       {{ cx[ inpoel[4*e  ] ], cy[ inpoel[4*e  ] ], cz[ inpoel[4*e  ] ] }},
      71                 :    5557380 :       {{ cx[ inpoel[4*e+1] ], cy[ inpoel[4*e+1] ], cz[ inpoel[4*e+1] ] }},
      72                 :    5557380 :       {{ cx[ inpoel[4*e+2] ], cy[ inpoel[4*e+2] ], cz[ inpoel[4*e+2] ] }},
      73                 :    5557380 :       {{ cx[ inpoel[4*e+3] ], cy[ inpoel[4*e+3] ], cz[ inpoel[4*e+3] ] }} }};
      74                 :            : 
      75         [ +  + ]:   27115032 :     for (std::size_t igp=0; igp<ng; ++igp)
      76                 :            :     {
      77                 :            :       // Compute the coordinates of quadrature point at physical domain
      78         [ +  - ]:   21557652 :       auto gp = eval_gp( igp, coordel, coordgp );
      79                 :            : 
      80                 :            :       // Compute the basis function
      81                 :            :       auto B =
      82         [ +  - ]:   21557652 :         eval_basis( ndofel[e], coordgp[0][igp], coordgp[1][igp], coordgp[2][igp] );
      83                 :            : 
      84                 :            :       // Compute the source term variable
      85                 :            :       std::array< real, 5 > s;
      86         [ -  + ]:   21557652 :       src( system, gp[0], gp[1], gp[2], t, s[0], s[1], s[2], s[3], s[4] );
      87                 :            : 
      88         [ +  - ]:   21557652 :       auto wt = wgp[igp] * geoElem(e, 0, 0);
      89                 :            : 
      90         [ +  - ]:   21557652 :       update_rhs( offset, ndof, ndofel[e], wt, e, B, s, R );
      91                 :            :     }
      92                 :            :   }
      93                 :      16320 : }
      94                 :            : 
      95                 :            : void
      96                 :   21557652 : tk::update_rhs( ncomp_t offset,
      97                 :            :                 const std::size_t ndof,
      98                 :            :                 const std::size_t ndof_el,
      99                 :            :                 const tk::real wt,
     100                 :            :                 const std::size_t e,
     101                 :            :                 const std::vector< tk::real >& B,
     102                 :            :                 const std::array< tk::real, 5 >& s,
     103                 :            :                 Fields& R )
     104                 :            : // *****************************************************************************
     105                 :            : //  Update the rhs by adding the source term integrals
     106                 :            : //! \param[in] offset Offset this PDE system operates from
     107                 :            : //! \param[in] ndof Maximum number of degrees of freedom
     108                 :            : //! \param[in] ndof_el Number of degrees of freedom for local element
     109                 :            : //! \param[in] wt Weight of gauss quadrature point
     110                 :            : //! \param[in] e Element index
     111                 :            : //! \param[in] B Vector of basis functions
     112                 :            : //! \param[in] s Source terms for each of the 5 components
     113                 :            : //! \param[in,out] R Right-hand side vector computed
     114                 :            : // *****************************************************************************
     115                 :            : {
     116                 :            :   Assert( B.size() == ndof_el, "Size mismatch for basis function" );
     117                 :            : 
     118         [ +  + ]:  129345912 :   for (ncomp_t c=0; c<5; ++c)
     119                 :            :   {
     120                 :  107788260 :     auto mark = c*ndof;
     121         [ +  + ]:  107788260 :     R(e, mark, offset)   += wt * s[c];
     122                 :            : 
     123         [ +  + ]:  107788260 :     if ( ndof_el > 1 )
     124                 :            :     {
     125         [ +  + ]:   91335375 :       R(e, mark+1, offset) += wt * s[c] * B[1];
     126                 :   91335375 :       R(e, mark+2, offset) += wt * s[c] * B[2];
     127                 :   91335375 :       R(e, mark+3, offset) += wt * s[c] * B[3];
     128                 :            : 
     129         [ +  + ]:   91335375 :       if( ndof_el > 4 )
     130                 :            :       {
     131                 :   63553050 :         R(e, mark+4, offset) += wt * s[c] * B[4];
     132                 :   63553050 :         R(e, mark+5, offset) += wt * s[c] * B[5];
     133                 :   63553050 :         R(e, mark+6, offset) += wt * s[c] * B[6];
     134                 :   63553050 :         R(e, mark+7, offset) += wt * s[c] * B[7];
     135                 :   63553050 :         R(e, mark+8, offset) += wt * s[c] * B[8];
     136                 :   63553050 :         R(e, mark+9, offset) += wt * s[c] * B[9];
     137                 :            :       }
     138                 :            :     }
     139                 :            :   }
     140                 :   21557652 : }

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