Quinoa all test code coverage report
Current view: top level - Inciter - FluxCorrector.hpp (source / functions) Hit Total Coverage
Commit: Quinoa_v0.3-957-gb4f0efae0 Lines: 16 16 100.0 %
Date: 2021-11-09 15:14:18 Functions: 4 4 100.0 %
Legend: Lines: hit not hit | Branches: + taken - not taken # not executed Branches: 12 16 75.0 %

           Branch data     Line data    Source code
       1                 :            : // *****************************************************************************
       2                 :            : /*!
       3                 :            :   \file      src/Inciter/FluxCorrector.hpp
       4                 :            :   \copyright 2012-2015 J. Bakosi,
       5                 :            :              2016-2018 Los Alamos National Security, LLC.,
       6                 :            :              2019-2021 Triad National Security, LLC.
       7                 :            :              All rights reserved. See the LICENSE file for details.
       8                 :            :   \brief     FluxCorrector performs limiting for transport equations
       9                 :            :   \details   FluxCorrector performs limiting for transport equations. Each
      10                 :            :     FluxCorrector object performs the limiting procedure, according to a
      11                 :            :     flux-corrected transport algorithm, on a chunk of the full load (part of the
      12                 :            :     mesh).
      13                 :            : */
      14                 :            : // *****************************************************************************
      15                 :            : #ifndef FluxCorrector_h
      16                 :            : #define FluxCorrector_h
      17                 :            : 
      18                 :            : #include <utility>
      19                 :            : #include <unordered_map>
      20                 :            : 
      21                 :            : #include "NoWarning/pup.hpp"
      22                 :            : 
      23                 :            : #include "Keywords.hpp"
      24                 :            : #include "Fields.hpp"
      25                 :            : #include "Inciter/InputDeck/InputDeck.hpp"
      26                 :            : 
      27                 :            : namespace inciter {
      28                 :            : 
      29                 :            : extern ctr::InputDeck g_inputdeck;
      30                 :            : 
      31                 :            : //! FluxCorrector is used to perform flux-corrected transport
      32                 :            : //! \see Löhner, R., Morgan, K., Peraire, J. and Vahdati, M. (1987), Finite
      33                 :            : //!   element flux-corrected transport (FEM–FCT) for the Euler and Navier–Stokes
      34                 :            : //!   equations. Int. J. Numer. Meth. Fluids, 7: 1093–1109.
      35                 :            : //!   doi:10.1002/fld.1650071007
      36                 :            : class FluxCorrector {
      37                 :            : 
      38                 :            :   private:
      39                 :            :     using ncomp_t = kw::ncomp::info::expect::type;
      40                 :            : 
      41                 :            :   public:
      42                 :            :     //! Constructor
      43                 :            :     //! \param[in] is Size of the mesh element connectivity vector (inpoel size)
      44                 :       2550 :     explicit FluxCorrector( std::size_t is = 0 ) :
      45                 :            :       m_aec( is, g_inputdeck.get< tag::component >().nprop() ),
      46                 :            :       m_sys( findsys< tag::compflow >() ),
      47 [ +  - ][ +  - ]:       2550 :       m_vel( findvel< tag::compflow >() ) {}
      48                 :            : 
      49                 :            :     //! Collect scalar comonent indices for equation systems
      50                 :            :     //! \tparam Eq Equation types to consider as equation systems
      51                 :            :     //! \return List of component indices to treat as a system
      52                 :            :     template< class... Eq >
      53                 :            :     std::vector< std::vector< ncomp_t > >
      54                 :            :     findsys() {
      55                 :            :       std::vector< std::vector< ncomp_t > > sys;
      56         [ +  - ]:       5196 :       ( ... , [&](){
      57                 :            :         // Access system-FCT variable indices for all systems of type Eq
      58                 :            :         const auto& sv = g_inputdeck.get< tag::param, Eq, tag::sysfctvar >();
      59                 :            :         // Access number of scalar components in all systems of type Eq
      60                 :            :         const auto& ncompv = g_inputdeck.get< tag::component >().get< Eq >();
      61                 :            :         // Assign variable indices for system FCT for each Eq system
      62         [ +  + ]:       3365 :         for (std::size_t e=0; e<ncompv.size(); ++e) {
      63         [ +  + ]:        815 :           if (g_inputdeck.get< tag::param, Eq, tag::sysfct >().at(e)) {
      64                 :            :             auto offset = g_inputdeck.get< tag::component >().offset< Eq >( e );
      65         [ -  + ]:         96 :             sys.push_back( std::vector< ncomp_t >() );
      66         [ +  + ]:        576 :             for (auto c : sv.at(e)) {
      67                 :        480 :               sys.back().push_back( offset + c );
      68                 :            :             }
      69                 :            :           }
      70                 :            :         } }() );
      71                 :            :       for ([[maybe_unused]] const auto& s : sys) {
      72                 :            :         Assert( std::all_of( begin(s), end(s), [&]( std::size_t i ){
      73                 :            :                   return i < g_inputdeck.get< tag::component >().nprop(); } ),
      74                 :            :                 "Eq system index larger than total number of components" );
      75                 :            :       }
      76                 :            :       return sys;
      77                 :            :     }
      78                 :            : 
      79                 :            :     //! Find components of a velocity for equation systems
      80                 :            :     //! \tparam Eq Equation types to consider as equation systems
      81                 :            :     //! \return List of 3 component indices to treat as a velocity
      82                 :            :     //! \warning Currently, this is only a punt for single-material flow: we
      83                 :            :     //!   simply take the components 1,2,3 as the velocity for each system of
      84                 :            :     //!   type Eq
      85                 :            :     template< class... Eq >
      86                 :            :     std::vector< std::array< ncomp_t, 3 > >
      87                 :            :     findvel() {
      88                 :            :       std::vector< std::array< ncomp_t, 3 > > vel;
      89                 :       2550 :       ( ... , [&](){
      90                 :            :         // Access number of scalar components in all systems of type Eq
      91                 :            :         const auto& ncompv = g_inputdeck.get< tag::component >().get< Eq >();
      92                 :            :         // Assign variable indices for system FCT for each Eq system
      93         [ +  + ]:       3365 :         for (std::size_t e=0; e<ncompv.size(); ++e) {
      94                 :            :           auto offset = g_inputdeck.get< tag::component >().offset< Eq >( e );
      95                 :        815 :           vel.push_back( { offset+1, offset+2, offset+3 } );
      96                 :            :         } }() );
      97                 :            :       for ([[maybe_unused]] const auto& v : vel) {
      98                 :            :         Assert( std::all_of( begin(v), end(v), [&]( std::size_t i ){
      99                 :            :                   return i < g_inputdeck.get< tag::component >().nprop(); } ),
     100                 :            :                 "Eq system index larger than total number of components" );
     101                 :            :       }
     102                 :            :       return vel;
     103                 :            :     }
     104                 :            : 
     105                 :            :     //! Resize state (e.g., after mesh refinement)
     106                 :            :     void resize( std::size_t is ) { m_aec.resize( is ); }
     107                 :            : 
     108                 :            :     //! Compute antidiffusive element contributions (AEC)
     109                 :            :     void aec(
     110                 :            :       const std::array< std::vector< tk::real >, 3 >& coord,
     111                 :            :       const std::vector< std::size_t >& inpoel,
     112                 :            :       const std::vector< tk::real >& vol,
     113                 :            :       const std::unordered_map< std::size_t,
     114                 :            :               std::vector< std::pair< bool, tk::real > > >& bcdir,
     115                 :            :       const std::unordered_map< int,
     116                 :            :         std::unordered_set< std::size_t > >& symbcnodemap,
     117                 :            :       const std::unordered_map< int,
     118                 :            :         std::unordered_map< std::size_t, std::array< tk::real, 4 > > >& bnorm,
     119                 :            :       const tk::Fields& Un,
     120                 :            :       tk::Fields& P );
     121                 :            : 
     122                 :            :     //! Verify the assembled antidiffusive element contributions
     123                 :            :     bool verify( std::size_t nchare,
     124                 :            :                  const std::vector< std::size_t >& inpoel,
     125                 :            :                  const tk::Fields& dUh,
     126                 :            :                  const tk::Fields& dUl ) const;
     127                 :            : 
     128                 :            :     //! Compute mass diffusion contribution to the rhs of the low order system
     129                 :            :     tk::Fields diff( const std::array< std::vector< tk::real >, 3 >& coord,
     130                 :            :                      const std::vector< std::size_t >& inpoel,
     131                 :            :                      const tk::Fields& Un ) const;
     132                 :            : 
     133                 :            :     //! \brief Compute the maximum and minimum unknowns of all elements
     134                 :            :     //!   surrounding nodes
     135                 :            :     void alw( const std::vector< std::size_t >& inpoel,
     136                 :            :               const tk::Fields& Un,
     137                 :            :               const tk::Fields& Ul,
     138                 :            :               tk::Fields& Q ) const;
     139                 :            : 
     140                 :            :     //! Compute limited antiffusive element contributions and apply to mesh nodes
     141                 :            :     void lim( const std::vector< std::size_t >& inpoel,
     142                 :            :               const std::unordered_map< std::size_t,
     143                 :            :                       std::vector< std::pair< bool, tk::real > > >& bcdir,
     144                 :            :               const tk::Fields& P,
     145                 :            :               const tk::Fields& Ul,
     146                 :            :               tk::Fields& Q,
     147                 :            :               tk::Fields& A ) const;
     148                 :            : 
     149                 :            :     // Collect mesh output fields from FCT
     150                 :            :     std::tuple< std::vector< std::string >,
     151                 :            :                 std::vector< std::vector< tk::real > > >
     152                 :            :     fields( const std::vector< std::size_t >& inpoel ) const;
     153                 :            : 
     154                 :            :     /** @name Charm++ pack/unpack serializer member functions */
     155                 :            :     ///@{
     156                 :            :     //! \brief Pack/Unpack serialize member function
     157                 :            :     //! \param[in,out] p Charm++'s PUP::er serializer object reference
     158                 :       5688 :     void pup( PUP::er& p ) {
     159                 :       5688 :       p | m_aec;
     160                 :       5688 :       p | m_sys;
     161                 :       5688 :       p | m_vel;
     162                 :       5688 :     }
     163                 :            :     //! \brief Pack/Unpack serialize operator|
     164                 :            :     //! \param[in,out] p Charm++'s PUP::er serializer object reference
     165                 :            :     //! \param[in,out] i FluxCorrector object reference
     166                 :            :     friend void operator|( PUP::er& p, FluxCorrector& i ) { i.pup(p); }
     167                 :            :     //@}
     168                 :            : 
     169                 :            :   private:
     170                 :            :    //! Antidiffusive element contributions for all scalar components
     171                 :            :    tk::Fields m_aec;
     172                 :            :    //! Component indices to treat as a system for multiple systems
     173                 :            :    std::vector< std::vector< ncomp_t > > m_sys;
     174                 :            :    //! Component indices to treat as a velocity vector for multiple systems
     175                 :            :    std::vector< std::array< ncomp_t, 3 > > m_vel;
     176                 :            : };
     177                 :            : 
     178                 :            : } // inciter::
     179                 :            : 
     180                 :            : #endif // FluxCorrector_h

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