Quinoa regression test code coverage report
Current view: top level - PDE/MultiMat/Problem - FieldOutput.cpp (source / functions) Hit Total Coverage
Commit: Quinoa_v0.3-957-gb4f0efae0 Lines: 0 64 0.0 %
Date: 2021-11-09 13:40:20 Functions: 0 3 0.0 %
Legend: Lines: hit not hit | Branches: + taken - not taken # not executed Branches: 0 138 0.0 %

           Branch data     Line data    Source code
       1                 :            : // *****************************************************************************
       2                 :            : /*!
       3                 :            :   \file      src/PDE/MultiMat/Problem/FieldOutput.cpp
       4                 :            :   \copyright 2012-2015 J. Bakosi,
       5                 :            :              2016-2018 Los Alamos National Security, LLC.,
       6                 :            :              2019-2021 Triad National Security, LLC.
       7                 :            :              All rights reserved. See the LICENSE file for details.
       8                 :            :   \brief     Field outputs for multi-material equation solver
       9                 :            :   \details   This file defines functions for field quantites to be output to
      10                 :            :     files for compressible multi-material equations.
      11                 :            : */
      12                 :            : // *****************************************************************************
      13                 :            : #include "FieldOutput.hpp"
      14                 :            : #include "MultiMat/MultiMatIndexing.hpp"
      15                 :            : #include "EoS/EoS.hpp"
      16                 :            : #include "Vector.hpp"
      17                 :            : 
      18                 :            : namespace inciter {
      19                 :            : 
      20                 :            : std::vector< std::string >
      21                 :          0 : MultiMatFieldNames( std::size_t nmat )
      22                 :            : // *****************************************************************************
      23                 :            : // Return multi-material field names to be output to file
      24                 :            : //! \param[in] nmat Number of materials in system
      25                 :            : //! \return Vector of strings labelling fields output in file
      26                 :            : // *****************************************************************************
      27                 :            : {
      28                 :            :   std::vector< std::string > n;
      29                 :            : 
      30         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k)
      31 [ -  - ][ -  - ]:          0 :     n.push_back( "volfrac"+std::to_string(k+1)+"_numerical" );
         [ -  - ][ -  - ]
         [ -  - ][ -  - ]
                 [ -  - ]
      32         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k)
      33 [ -  - ][ -  - ]:          0 :     n.push_back( "density"+std::to_string(k+1)+"_numerical" );
         [ -  - ][ -  - ]
         [ -  - ][ -  - ]
                 [ -  - ]
      34         [ -  - ]:          0 :   n.push_back( "density_numerical" );
      35         [ -  - ]:          0 :   n.push_back( "x-velocity_numerical" );
      36         [ -  - ]:          0 :   n.push_back( "y-velocity_numerical" );
      37         [ -  - ]:          0 :   n.push_back( "z-velocity_numerical" );
      38         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k)
      39 [ -  - ][ -  - ]:          0 :     n.push_back( "pressure"+std::to_string(k+1)+"_numerical" );
         [ -  - ][ -  - ]
         [ -  - ][ -  - ]
                 [ -  - ]
      40         [ -  - ]:          0 :   n.push_back( "pressure_numerical" );
      41         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k)
      42 [ -  - ][ -  - ]:          0 :     n.push_back( "soundspeed"+std::to_string(k+1) );
         [ -  - ][ -  - ]
      43         [ -  - ]:          0 :   n.push_back( "total_energy_density_numerical" );
      44         [ -  - ]:          0 :   n.push_back( "material_indicator" );
      45         [ -  - ]:          0 :   n.push_back( "timestep" );
      46                 :            : 
      47                 :          0 :   return n;
      48                 :            : }
      49                 :            : 
      50                 :            : std::vector< std::vector< tk::real > >
      51                 :          0 : MultiMatFieldOutput(
      52                 :            :   ncomp_t,
      53                 :            :   std::size_t nmat,
      54                 :            :   ncomp_t offset,
      55                 :            :   std::size_t nunk,
      56                 :            :   std::size_t rdof,
      57                 :            :   const std::vector< tk::real >&,
      58                 :            :   const std::array< std::vector< tk::real >, 3 >&,
      59                 :            :   const tk::Fields& U,
      60                 :            :   const tk::Fields& P )
      61                 :            : // *****************************************************************************
      62                 :            : //  Return field output going to file
      63                 :            : //! \param[in] nmat Number of materials in systen
      64                 :            : //! \param[in] offset System offset specifying the position of the system of
      65                 :            : //!   PDEs among other systems
      66                 :            : //! \param[in] nunk Number of unknowns to extract
      67                 :            : //! \param[in] rdof Number of reconstructed degrees of freedom
      68                 :            : //! \param[in] U Solution vector at recent time step
      69                 :            : //! \param[in] P Vector of primitive quantities at recent time step
      70                 :            : //! \return Vector of vectors to be output to file
      71                 :            : // *****************************************************************************
      72                 :            : {
      73                 :            :   // field-output vector with:
      74                 :            :   // - nmat volume fractions
      75                 :            :   // - nmat material densities
      76                 :            :   // - 1 bulk density
      77                 :            :   // - 3 velocity components
      78                 :            :   // - nmat material pressures
      79                 :            :   // - 1 bulk pressure
      80                 :            :   // - nmat material sound-speeds
      81                 :            :   // - 1 bulk total energy density
      82                 :            :   // - 1 material indicator
      83                 :            :   // - 1 time-step
      84                 :            :   // leading to a size of 4*nmat+8
      85                 :            :   std::vector< std::vector< tk::real > >
      86 [ -  - ][ -  - ]:          0 :     out( 4*nmat+8, std::vector< tk::real >( nunk ) );
      87                 :            : 
      88                 :            :   //// mesh node coordinates
      89                 :            :   //const auto& x = coord[0];
      90                 :            :   //const auto& y = coord[1];
      91                 :            :   //const auto& z = coord[2];
      92                 :            : 
      93                 :            :   // material volume-fractions
      94         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k) {
      95         [ -  - ]:          0 :     for (std::size_t i=0; i<nunk; ++i)
      96                 :          0 :       out[k][i] = U(i, volfracDofIdx(nmat, k, rdof, 0), offset);
      97                 :            :   }
      98                 :            : 
      99                 :            :   // material densities
     100         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k) {
     101         [ -  - ]:          0 :     for (std::size_t i=0; i<nunk; ++i) {
     102         [ -  - ]:          0 :       out[nmat+k][i] = U(i, densityDofIdx(nmat, k, rdof, 0), offset) /
     103         [ -  - ]:          0 :         std::max(1e-16, U(i, volfracDofIdx(nmat, k, rdof, 0), offset));
     104                 :            :     }
     105                 :            :   }
     106                 :            : 
     107                 :            :   // bulk density
     108         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t i=0; i<nunk; ++i) {
     109         [ -  - ]:          0 :     for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k)
     110                 :          0 :       out[2*nmat][i] += U(i, densityDofIdx(nmat, k, rdof, 0), offset);
     111                 :            :   }
     112                 :            : 
     113                 :            :   // velocity components
     114         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t i=0; i<nunk; ++i) {
     115                 :          0 :     out[2*nmat+1][i] = P(i, velocityDofIdx(nmat, 0, rdof, 0), offset);
     116                 :          0 :     out[2*nmat+2][i] = P(i, velocityDofIdx(nmat, 1, rdof, 0), offset);
     117                 :          0 :     out[2*nmat+3][i] = P(i, velocityDofIdx(nmat, 2, rdof, 0), offset);
     118                 :            :   }
     119                 :            : 
     120                 :            :   // material pressures
     121         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k) {
     122         [ -  - ]:          0 :     for (std::size_t i=0; i<nunk; ++i) {
     123                 :          0 :       out[2*nmat+4+k][i] =
     124                 :          0 :         P(i, pressureDofIdx(nmat, k, rdof, 0), offset) /
     125         [ -  - ]:          0 :         std::max(1e-16, U(i, volfracDofIdx(nmat, k, rdof, 0), offset));
     126                 :            :     }
     127                 :            :   }
     128                 :            : 
     129                 :            :   // bulk pressure
     130         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t i=0; i<nunk; ++i) {
     131         [ -  - ]:          0 :     for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k)
     132                 :          0 :       out[3*nmat+4][i] += P(i, pressureDofIdx(nmat, k, rdof, 0), offset);
     133                 :            :   }
     134                 :            : 
     135                 :            :   // material sound speeds
     136         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k) {
     137         [ -  - ]:          0 :     for (std::size_t i=0; i<nunk; ++i) {
     138                 :          0 :       out[3*nmat+5+k][i] =
     139 [ -  - ][ -  - ]:          0 :       eos_soundspeed< tag::multimat >( 0,
     140         [ -  - ]:          0 :         std::max(1e-16, U(i, densityDofIdx(nmat,k,rdof,0), offset)),
     141                 :            :         P(i, pressureDofIdx(nmat,k,rdof,0), offset),
     142                 :            :         U(i, volfracDofIdx(nmat,k,rdof,0), offset), k );
     143                 :            :     }
     144                 :            :   }
     145                 :            : 
     146                 :            :   // bulk total energy density
     147         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t i=0; i<nunk; ++i) {
     148         [ -  - ]:          0 :     for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k)
     149                 :          0 :       out[4*nmat+5][i] += U(i, energyDofIdx(nmat, k, rdof, 0), offset);
     150                 :            :   }
     151                 :            : 
     152                 :            :   // material indicator
     153         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t i=0; i<nunk; ++i) {
     154                 :          0 :     out[4*nmat+6][i] = 0.0;
     155         [ -  - ]:          0 :     for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k) {
     156                 :          0 :       out[4*nmat+6][i] += U(i, volfracDofIdx(nmat,k,rdof,0), offset)
     157                 :          0 :         * static_cast< tk::real >(k+1);
     158                 :            :     }
     159                 :            :   }
     160                 :            : 
     161                 :            :   // time-step
     162                 :            :   //for (std::size_t i=0; i<nunk; ++i) {
     163                 :            :   //  // advection velocity
     164                 :            :   //  auto u = U(i, velocityDofIdx(nmat,0,rdof,0), offset);
     165                 :            :   //  auto v = U(i, velocityDofIdx(nmat,1,rdof,0), offset);
     166                 :            :   //  auto w = U(i, velocityDofIdx(nmat,2,rdof,0), offset);
     167                 :            : 
     168                 :            :   //  auto vn = std::sqrt(tk::dot({{u, v, w}}, {{u, v, w}}));
     169                 :            : 
     170                 :            :   //  // acoustic speed
     171                 :            :   //  auto a = 0.0;
     172                 :            :   //  for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k)
     173                 :            :   //  {
     174                 :            :   //    if (U(i, volfracDofIdx(nmat,k,rdof,0), offset) > 1.0e-04) {
     175                 :            :   //      a = std::max( a, eos_soundspeed< tag::multimat >( 0,
     176                 :            :   //        U(i, densityDofIdx(nmat,k,rdof,0), offset),
     177                 :            :   //        P(i, pressureDofIdx(nmat,k,rdof,0), offset),
     178                 :            :   //        U(i, volfracDofIdx(nmat,k,rdof,0), offset), k ) );
     179                 :            :   //    }
     180                 :            :   //  }
     181                 :            : 
     182                 :            :   //  out[4*nmat+7][i] = geoElem(i,4,0) / (std::fabs(vn) + a);
     183                 :            :   //}
     184                 :            : 
     185                 :          0 :   return out;
     186                 :            : }
     187                 :            : 
     188         [ -  - ]:          0 : std::vector< std::string > MultiMatHistNames()
     189                 :            : // *****************************************************************************
     190                 :            : // Return time history field names to be output to file
     191                 :            : //! \note Every time history point will output these fields.
     192                 :            : //! \return Vector of strings labelling time history fields output in file
     193                 :            : // *****************************************************************************
     194                 :            : {
     195                 :            :   std::vector< std::string > n;
     196                 :            : 
     197         [ -  - ]:          0 :   n.push_back( "density" );
     198         [ -  - ]:          0 :   n.push_back( "x-velocity" );
     199         [ -  - ]:          0 :   n.push_back( "y-velocity" );
     200         [ -  - ]:          0 :   n.push_back( "z-velocity" );
     201         [ -  - ]:          0 :   n.push_back( "energy" );
     202         [ -  - ]:          0 :   n.push_back( "pressure" );
     203                 :            : 
     204                 :          0 :   return n;
     205                 :            : }
     206                 :            : 
     207                 :            : } //inciter::

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