Quinoa regression test code coverage report
Current view: top level - DiffEq/Velocity - VelocityCoeffPolicy.cpp (source / functions) Hit Total Coverage
Commit: Quinoa_v0.3-957-gb4f0efae0 Lines: 24 35 68.6 %
Date: 2021-11-09 13:40:20 Functions: 4 6 66.7 %
Legend: Lines: hit not hit | Branches: + taken - not taken # not executed Branches: 4 18 22.2 %

           Branch data     Line data    Source code
       1                 :            : // *****************************************************************************
       2                 :            : /*!
       3                 :            :   \file      src/DiffEq/Velocity/VelocityCoeffPolicy.cpp
       4                 :            :   \copyright 2012-2015 J. Bakosi,
       5                 :            :              2016-2018 Los Alamos National Security, LLC.,
       6                 :            :              2019-2021 Triad National Security, LLC.
       7                 :            :              All rights reserved. See the LICENSE file for details.
       8                 :            :   \brief     Velocity coefficients policies
       9                 :            :   \details   This file defines coefficients policy classes for the velocity
      10                 :            :              SDE, defined in DiffEq/Velocity/Velocity.h. For general 
      11                 :            :              requirements on velocity SDE coefficients policy classes see the
      12                 :            :              header file.
      13                 :            : */
      14                 :            : // *****************************************************************************
      15                 :            : 
      16                 :            : #include "VelocityCoeffPolicy.hpp"
      17                 :            : #include "Table.hpp"
      18                 :            : 
      19                 :         18 : walker::VelocityCoeffConstShear::VelocityCoeffConstShear(
      20                 :            :   kw::sde_c0::info::expect::type C0_,
      21                 :            :   kw::sde_c0::info::expect::type& C0,
      22                 :         18 :   std::array< tk::real, 9 >& dU ) : m_dU( {{ 0.0, 1.0, 0.0,
      23                 :            :                                              0.0, 0.0, 0.0,
      24                 :         18 :                                              0.0, 0.0, 0.0 }} )
      25                 :            : // *****************************************************************************
      26                 :            : // Constructor: initialize coefficients
      27                 :            : //! \param[in] C0_ Value of C0 parameter in the Langevin model
      28                 :            : //! \param[in,out] C0 Value of to set the C0 parameter in the Langevin model
      29                 :            : //! \param[in,out] dU Prescribed mean velocity gradient
      30                 :            : // *****************************************************************************
      31                 :            : {
      32                 :         18 :   C0 = C0_;
      33                 :         18 :   dU = m_dU;
      34                 :         18 : }
      35                 :            : 
      36                 :            : void
      37                 :       6750 : walker::VelocityCoeffConstShear::update(
      38                 :            :   char depvar,
      39                 :            :   char dissipation_depvar,
      40                 :            :   const std::map< tk::ctr::Product, tk::real >& moments,
      41                 :            :   const tk::Table<1>&,
      42                 :            :   ctr::DepvarType solve,
      43                 :            :   ctr::VelocityVariantType variant,
      44                 :            :   kw::sde_c0::info::expect::type C0,
      45                 :            :   tk::real,
      46                 :            :   tk::real& eps,
      47                 :            :   std::array< tk::real, 9 >& G ) const
      48                 :            : // *****************************************************************************
      49                 :            : //  Update the model coefficients prescribing shear
      50                 :            : //! \param[in] depvar Dependent variable for of this SDE
      51                 :            : //! \param[in] dissipation_depvar Dependent variable for coupled dissipation eq
      52                 :            : //! \param[in] moments Map of statistical moments
      53                 :            : //! \param[in] solve Configured dependent variable to solve for
      54                 :            : //! \param[in] variant Velocity model variant configured
      55                 :            : //! \param[in] C0 Coefficient C0 in the Langevin model
      56                 :            : //! \param[in,out] eps Dissipation rate of turbulent kinetic energy
      57                 :            : //! \param[in,out] G Coefficient tensor (3x3) in the Langevin equation
      58                 :            : //! \details Update the dissipation rate (eps) and G_{ij} based on the
      59                 :            : //!   turbulent kinetic energy (k) for a prescribed honmogeneous shear flow.
      60                 :            : // *****************************************************************************
      61                 :            : {
      62                 :            :   using tk::ctr::lookup;
      63                 :            :   using tk::ctr::mean;
      64                 :            : 
      65                 :            :   // Compute turbulent kinetic energy
      66                 :       6750 :   auto rs = reynoldsStress( depvar, solve, moments );
      67                 :            : 
      68                 :            :   // Compute turbulent kinetic energy
      69                 :       6750 :   auto k = (rs[0] + rs[1] + rs[2]) / 2.0;
      70                 :            : 
      71                 :            :   // Access mean turbulence frequency
      72         [ +  - ]:       6750 :   tk::real O = lookup( mean(dissipation_depvar,0), moments );
      73                 :            : 
      74                 :            :   // compute turbulent kinetic energy dissipation rate
      75                 :       6750 :   eps = O*k;
      76                 :            : 
      77                 :            :   // update drift tensor based on the Langevin model variant configured
      78         [ +  + ]:       6750 :   if (variant == ctr::VelocityVariantType::SLM)     // simplified
      79                 :       3375 :     G = slm( O, C0 );
      80         [ +  - ]:       3375 :   else if (variant == ctr::VelocityVariantType::GLM)// generalized
      81                 :       3375 :     G = glm( O, C0, rs, m_dU );
      82 [ -  - ][ -  - ]:          0 :   else Throw( "Velocity variant type not implemented" );
         [ -  - ][ -  - ]
         [ -  - ][ -  - ]
      83                 :       6750 : }
      84                 :            : 
      85                 :          4 : walker::VelocityCoeffStationary::VelocityCoeffStationary(
      86                 :            :   kw::sde_c0::info::expect::type C0_,
      87                 :            :   kw::sde_c0::info::expect::type& C0,
      88                 :            :   std::array< tk::real, 9 >& dU )
      89                 :            : // *****************************************************************************
      90                 :            : // Constructor: initialize coefficients
      91                 :            : //! \param[in] C0_ Value of C0 parameter in the Langevin model
      92                 :            : //! \param[in,out] C0 Value of to set the C0 parameter in the Langevin model
      93                 :            : //! \param[in,out] dU Prescribed mean velocity gradient
      94                 :            : //! \details Prescribe no shear. The value of C0 is insignificant for a forced
      95                 :            : //!   stationary velocity PDF because drift and diffusion are in balance, so
      96                 :            : //!   that dk/dt = 0.
      97                 :            : // *****************************************************************************
      98                 :            : {
      99                 :          4 :   C0 = C0_;
     100                 :          4 :   dU = { 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0 };
     101                 :          4 : }
     102                 :            : 
     103                 :            : void
     104                 :        396 : walker::VelocityCoeffStationary::update(
     105                 :            :   char,
     106                 :            :   char,
     107                 :            :   const std::map< tk::ctr::Product, tk::real >&,
     108                 :            :   const tk::Table<1>&,
     109                 :            :   ctr::DepvarType,
     110                 :            :   ctr::VelocityVariantType,
     111                 :            :   kw::sde_c0::info::expect::type C0,
     112                 :            :   tk::real,
     113                 :            :   tk::real& eps,
     114                 :            :   std::array< tk::real, 9 >& G ) const
     115                 :            : // *****************************************************************************
     116                 :            : //  Update the model coefficients forcing a statistically stationary PDF
     117                 :            : //! \param[in] C0 Coefficient C0 in the Langevin model, should not affect the
     118                 :            : //!   solution for forced velocity PDF
     119                 :            : //! \param[in,out] eps Dissipation rate of turbulent kinetic energy, force = 1
     120                 :            : //! \param[in,out] G Coefficient tensor (3x3) in the Langevin equation
     121                 :            : //! \details Update the dissipation rate (eps) and G_{ij} so that the velocity
     122                 :            : //!   PDF is stationary. The value of C0 is insignificant for a forced
     123                 :            : //!   stationary velocity PDF because drift and diffusion are in balance, so
     124                 :            : //!   that dk/dt = 0.
     125                 :            : // *****************************************************************************
     126                 :            : {
     127                 :            :   // Override turbulent kinetic energy to keep the velocity PDF exactly
     128                 :            :   // stationary
     129                 :            :   tk::real k = 1.0;
     130                 :            : 
     131                 :            :   // Do not couple a dissipation eq for forced velocity PDF, but set to unity
     132                 :            :   // and keep the PDF stationary.
     133                 :            :   tk::real O = 1.0;
     134                 :            : 
     135                 :            :   // Compute turbulent kinetic energy dissipation rate
     136                 :        396 :   eps = O*k;
     137                 :            : 
     138                 :            :   // Update drift tensor to force the velocity PDF stationary. Note that his is
     139                 :            :   // NOT the simplified or generalized Langevin model, but a modification to
     140                 :            :   // keep the PDF stationary, see Pope, Turbulent Flows, 2000, Eq.12.100.
     141                 :            :   G.fill( 0.0 );
     142                 :        396 :   G[0] = G[4] = G[8] = -0.75*C0*O;
     143                 :        396 : }
     144                 :            : 
     145                 :          0 : walker::VelocityCoeffHydroTimeScale::VelocityCoeffHydroTimeScale(
     146                 :            :   kw::sde_c0::info::expect::type C0_,
     147                 :            :   kw::sde_c0::info::expect::type& C0,
     148                 :            :   std::array< tk::real, 9 >& dU )
     149                 :            : // *****************************************************************************
     150                 :            : // Constructor: initialize coefficients
     151                 :            : //! \param[in] C0_ Value of C0 parameter in the Langevin model
     152                 :            : //! \param[in,out] C0 Value of to set the C0 parameter in the Langevin model
     153                 :            : //! \param[in,out] dU Prescribed mean velocity gradient
     154                 :            : // *****************************************************************************
     155                 :            : {
     156                 :          0 :   C0 = C0_;
     157                 :          0 :   dU = { 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0 };
     158                 :          0 : }
     159                 :            : 
     160                 :            : void
     161                 :          0 : walker::VelocityCoeffHydroTimeScale::update(
     162                 :            :   char depvar,
     163                 :            :   char,
     164                 :            :   const std::map< tk::ctr::Product, tk::real >& moments,
     165                 :            :   const tk::Table<1>& hts,
     166                 :            :   ctr::DepvarType solve,
     167                 :            :   ctr::VelocityVariantType,
     168                 :            :   kw::sde_c0::info::expect::type C0,
     169                 :            :   tk::real t,
     170                 :            :   tk::real& eps,
     171                 :            :   std::array< tk::real, 9 >& G ) const
     172                 :            : // *****************************************************************************
     173                 :            : //  Update the model coefficients sampling the hydrodynamics time scale from a
     174                 :            : //  prescribed function table
     175                 :            : //! \param[in] depvar Dependent variable for of this SDE
     176                 :            : //! \param[in] moments Map of statistical moments
     177                 :            : //! \param[in] hts Table to take hydrodynamics time scale from
     178                 :            : //! \param[in] solve Configured dependent variable to solve for
     179                 :            : //! \param[in] C0 Coefficient C0 in the Langevin model
     180                 :            : //! \param[in] t Physical time to sample hydrodynamics time scale at
     181                 :            : //! \param[in,out] eps Dissipation rate of turbulent kinetic energy
     182                 :            : //! \param[in,out] G Coefficient tensor (3x3) in the Langevin equation
     183                 :            : //! \details Update the dissipation rate (eps) based on eps/k (from DNS) and the
     184                 :            : //!   turbulent kinetic energy (k) (from the SDE)
     185                 :            : // *****************************************************************************
     186                 :            : {
     187                 :            :   // Compute turbulent kinetic energy
     188                 :          0 :   auto k = tke( depvar, solve, moments );
     189                 :            : 
     190                 :            :   // Sample the inverse hydrodynamics timescale at time t
     191                 :          0 :   auto ts = tk::sample<1>( t, hts )[ 0 ];  // eps/k
     192                 :            : 
     193                 :            :   // compute turbulent kinetic energy dissipation rate
     194                 :          0 :   eps = ts * k;
     195                 :            : 
     196                 :            :   // update drift tensor based on the simplified Langevin model
     197                 :            :   G.fill( 0.0 );
     198                 :          0 :   G[0] = G[4] = G[8] = -(0.5+0.75*C0) * ts;
     199                 :          0 : }

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