Quinoa regression test code coverage report
Current view: top level - PDE/Integrate - Mass.cpp (source / functions) Hit Total Coverage
Commit: Quinoa_v0.3-957-gb4f0efae0 Lines: 45 45 100.0 %
Date: 2021-11-11 13:17:06 Functions: 2 2 100.0 %
Legend: Lines: hit not hit | Branches: + taken - not taken # not executed Branches: 31 56 55.4 %

           Branch data     Line data    Source code
       1                 :            : // *****************************************************************************
       2                 :            : /*!
       3                 :            :   \file      src/PDE/Integrate/Mass.cpp
       4                 :            :   \copyright 2012-2015 J. Bakosi,
       5                 :            :              2016-2018 Los Alamos National Security, LLC.,
       6                 :            :              2019-2021 Triad National Security, LLC.
       7                 :            :              All rights reserved. See the LICENSE file for details.
       8                 :            :   \brief     Functions for computing the mass matrix for a system of PDEs
       9                 :            :   \details   This file contains functionality for computing the mass matrix for
      10                 :            :      a system of PDEs used in discontinuous and continuous Galerkin methods for
      11                 :            :      various orders of numerical representation.
      12                 :            : */
      13                 :            : // *****************************************************************************
      14                 :            : 
      15                 :            : #include "Mass.hpp"
      16                 :            : #include "Vector.hpp"
      17                 :            : 
      18                 :            : void
      19                 :       1158 : tk::mass( ncomp_t ncomp,
      20                 :            :           ncomp_t offset,
      21                 :            :           ncomp_t ndof,
      22                 :            :           const Fields& geoElem,
      23                 :            :           Fields& l )
      24                 :            : // *****************************************************************************
      25                 :            : //  Compute the block-diagonal mass matrix for DG
      26                 :            : //! \param[in] ncomp Number of scalar components in this PDE system
      27                 :            : //! \param[in] offset Offset this PDE system operates from
      28                 :            : //! \param[in] ndof Number of solution degrees of freedom
      29                 :            : //! \param[in] geoElem Element geometry array
      30                 :            : //! \param[in,out] l Block diagonal mass matrix
      31                 :            : // *****************************************************************************
      32                 :            : {
      33 [ -  + ][ -  - ]:       1158 :   Assert( geoElem.nunk() == l.nunk(), "Size mismatch" );
         [ -  - ][ -  - ]
      34                 :       1158 :   const auto nelem = geoElem.nunk();
      35 [ -  + ][ -  - ]:       1158 :   Assert( l.nprop() == ndof*ncomp, "lhs mass matrix size incorrect" );
         [ -  - ][ -  - ]
      36                 :            : 
      37                 :            :   // Compute LHS for DG(P0)
      38         [ +  + ]:    1622610 :   for (std::size_t e=0; e<nelem; ++e)
      39         [ +  + ]:    4100724 :     for (ncomp_t c=0; c<ncomp; ++c)
      40                 :    2479272 :       l(e, c*ndof, offset) = geoElem(e,0,0);
      41                 :            : 
      42                 :            :   // Augment LHS for DG(P1)
      43         [ +  + ]:       1158 :   if (ndof > 1) {
      44         [ +  + ]:     140344 :     for (std::size_t e=0; e<nelem; ++e) {
      45         [ +  + ]:     710032 :       for (ncomp_t c=0; c<ncomp; ++c) {
      46                 :     570032 :         const auto mark = c * ndof;
      47                 :     570032 :         l(e, mark+1, offset) = geoElem(e,0,0) / 10.0;
      48                 :     570032 :         l(e, mark+2, offset) = geoElem(e,0,0) * 3.0/10.0;
      49                 :     570032 :         l(e, mark+3, offset) = geoElem(e,0,0) * 3.0/5.0;
      50                 :            :       }
      51                 :            :     }
      52                 :            :   }
      53                 :            : 
      54                 :            :   // Augment LHS for DG(P2)
      55         [ +  + ]:       1158 :   if (ndof > 4){
      56         [ +  + ]:      83083 :     for (std::size_t e=0; e<nelem; ++e) {
      57         [ +  + ]:     465624 :       for (ncomp_t c=0; c<ncomp; ++c) {
      58                 :     382700 :         const auto mark = c * ndof;
      59                 :     382700 :         l(e, mark+4, offset) = geoElem(e,0,0) / 35.0;
      60                 :     382700 :         l(e, mark+5, offset) = geoElem(e,0,0) / 21.0;
      61                 :     382700 :         l(e, mark+6, offset) = geoElem(e,0,0) / 14.0;
      62                 :     382700 :         l(e, mark+7, offset) = geoElem(e,0,0) / 7.0;
      63                 :     382700 :         l(e, mark+8, offset) = geoElem(e,0,0) * 3.0/14.0;
      64                 :     382700 :         l(e, mark+9, offset) = geoElem(e,0,0) * 3.0/7.0;
      65                 :            :       }
      66                 :            :     }
      67                 :            :   }
      68                 :       1158 : }
      69                 :            : 
      70                 :            : tk::Fields
      71                 :        730 : tk::lump( ncomp_t ncomp,
      72                 :            :           const std::array< std::vector< tk::real >, 3 >& coord,
      73                 :            :           const std::vector< std::size_t >& inpoel )
      74                 :            : // *****************************************************************************
      75                 :            : //  Compute lumped mass matrix for CG
      76                 :            : //! \param[in] ncomp Total number of scalar components in the eq system
      77                 :            : //! \param[in] coord Mesh node coordinates
      78                 :            : //! \param[in] inpoel Mesh element connectivity
      79                 :            : //! \return Lumped mass matrix
      80                 :            : // *****************************************************************************
      81                 :            : {
      82                 :        730 :   const auto& x = coord[0];
      83                 :        730 :   const auto& y = coord[1];
      84                 :        730 :   const auto& z = coord[2];
      85                 :            : 
      86                 :        730 :   tk::Fields L( coord[0].size(), ncomp );
      87         [ +  - ]:        730 :   L.fill( 0.0 );
      88                 :            : 
      89         [ +  + ]:    1159348 :   for (std::size_t e=0; e<inpoel.size()/4; ++e) {
      90                 :    1158618 :     const std::array< std::size_t, 4 > N{{ inpoel[e*4+0], inpoel[e*4+1],
      91                 :    1158618 :                                            inpoel[e*4+2], inpoel[e*4+3] }};
      92                 :            :     // compute element Jacobi determinant
      93                 :            :     const std::array< tk::real, 3 >
      94                 :    1158618 :       ba{{ x[N[1]]-x[N[0]], y[N[1]]-y[N[0]], z[N[1]]-z[N[0]] }},
      95                 :    1158618 :       ca{{ x[N[2]]-x[N[0]], y[N[2]]-y[N[0]], z[N[2]]-z[N[0]] }},
      96                 :    1158618 :       da{{ x[N[3]]-x[N[0]], y[N[3]]-y[N[0]], z[N[3]]-z[N[0]] }};
      97                 :    1158618 :     const auto J = tk::triple( ba, ca, da ) * 5.0 / 120.0;
      98 [ -  + ][ -  - ]:    1158618 :     Assert( J > 0, "Element Jacobian non-positive" );
         [ -  - ][ -  - ]
      99                 :            : 
     100                 :            :     // access pointer to lumped mass left hand side at element nodes
     101         [ +  - ]:    2317236 :     std::vector< const tk::real* > l( ncomp );
     102 [ +  + ][ +  - ]:    3265038 :     for (ncomp_t c=0; c<ncomp; ++c) l[c] = L.cptr( c, 0 );
     103                 :            : 
     104                 :            :     // scatter-add lumped mass element contributions to lhs nodes
     105         [ +  + ]:    3265038 :     for (ncomp_t c=0; c<ncomp; ++c)
     106         [ +  + ]:   10532100 :       for (std::size_t j=0; j<4; ++j)
     107         [ +  - ]:    8425680 :         L.var(l[c],N[j]) += J;
     108                 :            :   }
     109                 :            : 
     110                 :        730 :   return L;
     111                 :            : }

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