Quinoa regression test code coverage report
Current view: top level - PDE/CompFlow/Physics - CGNavierStokes.cpp (source / functions) Hit Total Coverage
Commit: Quinoa_v0.3-957-gb4f0efae0 Lines: 0 84 0.0 %
Date: 2021-11-11 13:17:06 Functions: 0 4 0.0 %
Legend: Lines: hit not hit | Branches: + taken - not taken # not executed Branches: 0 50 0.0 %

           Branch data     Line data    Source code
       1                 :            : // *****************************************************************************
       2                 :            : /*!
       3                 :            :   \file      src/PDE/CompFlow/Physics/CGNavierStokes.cpp
       4                 :            :   \copyright 2012-2015 J. Bakosi,
       5                 :            :              2016-2018 Los Alamos National Security, LLC.,
       6                 :            :              2019-2021 Triad National Security, LLC.
       7                 :            :              All rights reserved. See the LICENSE file for details.
       8                 :            :   \brief     Physics policy for the Navier-Stokes equation using continuous
       9                 :            :     Galerkin discretization
      10                 :            :   \details   This file defines a Physics policy class for solving the
      11                 :            :     compressible single-material viscous flow equations using continuous
      12                 :            :     Galerkin discretization, defined in PDE/CompFlow/CGCompFlow.h. The class
      13                 :            :     defined here is used to configure the behavior of CGCompFlow. See
      14                 :            :     PDE/CompFlow/Physics/CG.h for general requirements on Physics policy classes
      15                 :            :     for CGCompFlow.
      16                 :            : */
      17                 :            : // *****************************************************************************
      18                 :            : 
      19                 :            : #include "CGNavierStokes.hpp"
      20                 :            : #include "EoS/EoS.hpp"
      21                 :            : 
      22                 :            : namespace inciter {
      23                 :            : 
      24                 :            : extern ctr::InputDeck g_inputdeck;
      25                 :            : 
      26                 :            : } // inciter::
      27                 :            : 
      28                 :            : using inciter::cg::CompFlowPhysicsNavierStokes;
      29                 :            : 
      30                 :            : void
      31                 :          0 : CompFlowPhysicsNavierStokes::viscousRhs(
      32                 :            :   tk::real dt,
      33                 :            :   tk::real J,
      34                 :            :   const std::array< std::size_t, 4 >& N,
      35                 :            :   const std::array< std::array< tk::real, 3 >, 4 >& grad,
      36                 :            :   const std::array< std::array< tk::real, 4 >, 5 >& u,
      37                 :            :   const std::array< const tk::real*, 5 >& r,
      38                 :            :   tk::Fields& R ) const
      39                 :            : // *****************************************************************************
      40                 :            : //  Add viscous stress contribution to momentum and energy rhs
      41                 :            : //! \param[in] dt Size of time step
      42                 :            : //! \param[in] J Element Jacobi determinant
      43                 :            : //! \param[in] N Element node indices
      44                 :            : //! \param[in] grad Shape function derivatives, nnode*ndim [4][3]
      45                 :            : //! \param[in] u Solution at element nodes at recent time step
      46                 :            : //! \param[in] r Pointers to right hand side at component and offset
      47                 :            : //! \param[in,out] R Right-hand side vector contributing to
      48                 :            : // *****************************************************************************
      49                 :            : {
      50                 :            :   // dynamic viscosity
      51                 :          0 :   auto mu_d = mu< tag::compflow >(0);
      52                 :            : 
      53                 :            :   // add deviatoric viscous stress contribution to momentum rhs
      54                 :          0 :   auto c = dt * J/6.0 * mu_d;
      55         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t i=0; i<3; ++i)
      56         [ -  - ]:          0 :     for (std::size_t j=0; j<3; ++j)
      57         [ -  - ]:          0 :       for (std::size_t k=0; k<4; ++k) {
      58                 :          0 :         R.var(r[i+1],N[0]) -= c * grad[0][j]*(grad[k][j]*u[i+1][k] +
      59                 :          0 :                                               grad[k][i]*u[j+1][k])/u[0][k];
      60                 :          0 :         R.var(r[i+1],N[1]) -= c * grad[1][j]*(grad[k][j]*u[i+1][k] +
      61                 :          0 :                                               grad[k][i]*u[j+1][k])/u[0][k];
      62                 :          0 :         R.var(r[i+1],N[2]) -= c * grad[2][j]*(grad[k][j]*u[i+1][k] +
      63                 :          0 :                                               grad[k][i]*u[j+1][k])/u[0][k];
      64                 :          0 :         R.var(r[i+1],N[3]) -= c * grad[3][j]*(grad[k][j]*u[i+1][k] +
      65                 :          0 :                                               grad[k][i]*u[j+1][k])/u[0][k];
      66                 :            :       }
      67                 :            :   // add isotropic viscous stress contribution to momentum rhs
      68                 :          0 :   c = dt * J/6.0 * mu_d * 2.0/3.0;
      69         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t i=0; i<3; ++i)
      70         [ -  - ]:          0 :     for (std::size_t j=0; j<3; ++j)
      71         [ -  - ]:          0 :       for (std::size_t k=0; k<4; ++k) {
      72                 :          0 :         R.var(r[i+1],N[0]) += c * grad[0][i]*grad[k][j]*u[j+1][k]/u[0][k];
      73                 :          0 :         R.var(r[i+1],N[1]) += c * grad[1][i]*grad[k][j]*u[j+1][k]/u[0][k];
      74                 :          0 :         R.var(r[i+1],N[2]) += c * grad[2][i]*grad[k][j]*u[j+1][k]/u[0][k];
      75                 :          0 :         R.var(r[i+1],N[3]) += c * grad[3][i]*grad[k][j]*u[j+1][k]/u[0][k];
      76                 :            :       }
      77                 :            :   // add deviatoric viscous stress contribution to energy rhs
      78                 :          0 :   c = dt * J/24.0 * mu_d;
      79         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t i=0; i<3; ++i)
      80         [ -  - ]:          0 :     for (std::size_t j=0; j<3; ++j)
      81         [ -  - ]:          0 :       for (std::size_t k=0; k<4; ++k) {
      82                 :          0 :         R.var(r[4],N[0]) -= c * u[i+1][k]/u[0][k] *
      83                 :          0 :                             grad[0][j]*(grad[k][j]*u[i+1][k] +
      84                 :          0 :                                         grad[k][i]*u[j+1][k])/u[0][k];
      85                 :          0 :         R.var(r[4],N[1]) -= c * u[i+1][k]/u[0][k] *
      86                 :          0 :                             grad[1][j]*(grad[k][j]*u[i+1][k] +
      87                 :          0 :                                         grad[k][i]*u[j+1][k])/u[0][k];
      88                 :          0 :         R.var(r[4],N[2]) -= c * u[i+1][k]/u[0][k] *
      89                 :          0 :                             grad[2][j]*(grad[k][j]*u[i+1][k] +
      90                 :          0 :                                         grad[k][i]*u[j+1][k])/u[0][k];
      91                 :          0 :         R.var(r[4],N[3]) -= c * u[i+1][k]/u[0][k] *
      92                 :          0 :                             grad[3][j]*(grad[k][j]*u[i+1][k] +
      93                 :          0 :                                         grad[k][i]*u[j+1][k])/u[0][k];
      94                 :            :       }
      95                 :            :   // add isotropic viscous stress contribution to energy rhs
      96                 :          0 :   c = dt * J/24.0 * mu_d * 2.0/3.0;
      97         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t i=0; i<3; ++i)
      98         [ -  - ]:          0 :     for (std::size_t j=0; j<3; ++j)
      99         [ -  - ]:          0 :       for (std::size_t k=0; k<4; ++k) {
     100                 :          0 :         R.var(r[4],N[0]) += c * u[i+1][k]/u[0][k] *
     101                 :          0 :                             grad[0][i]*grad[k][j]*u[j+1][k]/u[0][k];
     102                 :          0 :         R.var(r[4],N[1]) += c * u[i+1][k]/u[0][k] *
     103                 :          0 :                             grad[1][i]*grad[k][j]*u[j+1][k]/u[0][k];
     104                 :          0 :         R.var(r[4],N[2]) += c * u[i+1][k]/u[0][k] *
     105                 :          0 :                             grad[2][i]*grad[k][j]*u[j+1][k]/u[0][k];
     106                 :          0 :         R.var(r[4],N[3]) += c * u[i+1][k]/u[0][k] *
     107                 :          0 :                             grad[3][i]*grad[k][j]*u[j+1][k]/u[0][k];
     108                 :            :       }
     109                 :          0 : }
     110                 :            : 
     111                 :            : tk::real
     112                 :          0 : CompFlowPhysicsNavierStokes::viscous_dt(
     113                 :            :   tk::real L,
     114                 :            :   const std::array< std::array< tk::real, 4 >, 5 >& u ) const
     115                 :            : // *****************************************************************************
     116                 :            : //  Compute the minimum time step size based on the viscous force
     117                 :            : //! \param[in] L Characteristic length scale
     118                 :            : //! \param[in] u Solution at element nodes at recent time step
     119                 :            : //! \return Minimum time step size based on viscous force
     120                 :            : // *****************************************************************************
     121                 :            : {
     122                 :            :   // dynamic viscosity
     123                 :          0 :   auto mu_d = mu< tag::compflow >(0);
     124                 :            : 
     125                 :            :   // compute the minimum viscous time step size across the four nodes
     126                 :          0 :   tk::real mindt = std::numeric_limits< tk::real >::max();
     127         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t j=0; j<4; ++j) {
     128                 :          0 :     auto& r = u[0][j];              // rho
     129                 :          0 :     auto dt = L * L * r / (2.0*mu_d); // dt ~ dx^2/nu = dx^2*rho/(2mu)
     130         [ -  - ]:          0 :     if (dt < mindt) mindt = dt;
     131                 :            :   }
     132                 :          0 :   return mindt;
     133                 :            : }
     134                 :            : 
     135                 :            : void
     136                 :          0 : CompFlowPhysicsNavierStokes::conductRhs(
     137                 :            :   tk::real dt,
     138                 :            :   tk::real J,
     139                 :            :   const std::array< std::size_t, 4 >& N,
     140                 :            :   const std::array< std::array< tk::real, 3 >, 4 >& grad,
     141                 :            :   const std::array< std::array< tk::real, 4 >, 5 >& u,
     142                 :            :   const std::array< const tk::real*, 5 >& r,
     143                 :            :   tk::Fields& R ) const
     144                 :            : // *****************************************************************************
     145                 :            : //! Add heat conduction contribution to the energy rhs
     146                 :            : //! \param[in] dt Size of time step
     147                 :            : //! \param[in] J Element Jacobi determinant
     148                 :            : //! \param[in] N Element node indices
     149                 :            : //! \param[in] grad Shape function derivatives, nnode*ndim [4][3]
     150                 :            : //! \param[in] u Solution at element nodes at recent time step
     151                 :            : //! \param[in] r Pointers to right hand side at component and offset
     152                 :            : //! \param[in,out] R Right-hand side vector contributing to
     153                 :            : // *****************************************************************************
     154                 :            : {
     155                 :            :   // specific heat at constant volume
     156         [ -  - ]:          0 :   auto c_v = cv< tag::compflow >(0);
     157                 :            :   // thermal conductivity
     158         [ -  - ]:          0 :   auto kc = k< tag::compflow >(0);
     159                 :            : 
     160                 :            :   // compute temperature
     161                 :            :   std::array< tk::real, 4 > T;
     162         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t i=0; i<4; ++i)
     163                 :          0 :     T[i] = c_v*(u[4][i] - (u[1][i]*u[1][i] +
     164                 :          0 :                           u[2][i]*u[2][i] +
     165                 :          0 :                           u[3][i]*u[3][i])/2.0/u[0][i]) / u[0][i];
     166                 :            :   // add heat conduction contribution to energy rhs
     167                 :          0 :   auto c = dt * J/24.0 * kc;
     168         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t i=0; i<3; ++i)
     169         [ -  - ]:          0 :     for (std::size_t k=0; k<4; ++k) {
     170         [ -  - ]:          0 :       R.var(r[4],N[0]) += c * grad[k][i] * T[k];
     171         [ -  - ]:          0 :       R.var(r[4],N[1]) += c * grad[k][i] * T[k];
     172         [ -  - ]:          0 :       R.var(r[4],N[2]) += c * grad[k][i] * T[k];
     173         [ -  - ]:          0 :       R.var(r[4],N[3]) += c * grad[k][i] * T[k];
     174                 :            :     }
     175                 :          0 : }
     176                 :            : 
     177                 :            : tk::real
     178                 :          0 : CompFlowPhysicsNavierStokes::conduct_dt(
     179                 :            :   tk::real L,
     180                 :            :   tk::real g,
     181                 :            :   const std::array< std::array< tk::real, 4 >, 5 >& u ) const
     182                 :            : // *****************************************************************************
     183                 :            : //! Compute the minimum time step size based on thermal diffusion
     184                 :            : //! \param[in] L Characteristic length scale
     185                 :            : //! \param[in] g Ratio of specific heats
     186                 :            : //! \param[in] u Solution at element nodes at recent time step
     187                 :            : //! \return Minimum time step size based on thermal diffusion
     188                 :            : // *****************************************************************************
     189                 :            : {
     190                 :            :   // specific heat at constant volume
     191                 :          0 :   auto c_v = cv< tag::compflow >(0);
     192                 :            :   // thermal conductivity
     193                 :          0 :   auto kc = k< tag::compflow >(0);
     194                 :            :   // specific heat at constant pressure
     195                 :          0 :   auto cp = g * c_v;
     196                 :            : 
     197                 :            :   // compute the minimum conduction time step size across the four nodes
     198                 :          0 :   tk::real mindt = std::numeric_limits< tk::real >::max();
     199         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t j=0; j<4; ++j) {
     200                 :          0 :     auto& r = u[0][j];               // rho
     201                 :          0 :     auto dt = L * L * r * cp / kc;   // dt ~ dx^2/alpha = dx^2*rho*C_p/kc
     202         [ -  - ]:          0 :     if (dt < mindt) mindt = dt;
     203                 :            :   }
     204                 :          0 :   return mindt;
     205                 :            : }

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