Branch data Line data Source code
1 : : // *****************************************************************************
2 : : /*!
3 : : \file src/Control/Inciter/InputDeck/LuaParser.cpp
4 : : \copyright 2019-2021 Triad National Security, LLC.
5 : : All rights reserved. See the LICENSE file for details.
6 : : \brief Inciter's lua input deck file parser
7 : : \details This file defines the input deck, i.e., control file, parser for
8 : : the computational shock hydrodynamics tool, Inciter.
9 : : */
10 : : // *****************************************************************************
11 : :
12 : : #include <ostream>
13 : : #include <type_traits>
14 : :
15 : : #include "QuinoaConfig.hpp"
16 : :
17 : : #include "NoWarning/pegtl.hpp"
18 : :
19 : : #include "Print.hpp"
20 : : #include "Exception.hpp"
21 : : #include "Inciter/InputDeck/InputDeck.hpp"
22 : : #include "Inciter/InputDeck/LuaParser.hpp"
23 : : #include "PDE/MultiMat/MultiMatIndexing.hpp"
24 : : #include "PDE/MultiSpecies/MultiSpeciesIndexing.hpp"
25 : :
26 : : namespace tk {
27 : : namespace grm {
28 : :
29 : : //! \brief Case-insensitive character comparison functor
30 : : struct CaseInsensitiveCharLess {
31 : : //! Function call operator
32 : : //! \param[in] lhs Left character of the comparitor operand
33 : : //! \param[in] rhs Right character of the comparitor operand
34 : : //! \return Boolean indicating the result of the comparison
35 : : bool operator() ( char lhs, char rhs ) const {
36 [ - + ][ - + ]: 3 : return std::tolower( lhs ) < std::tolower( rhs );
[ + - ]
37 : : }
38 : : };
39 : :
40 : : //! \brief Parser-lifetime storage for dependent variables selected.
41 : : //! \details Used to track the dependent variable of differential equations
42 : : //! (i.e., models) assigned during parsing. It needs to be case insensitive
43 : : //! since we only care about whether the variable is selected or not and not
44 : : //! whether it denotes a full variable (upper case) or a fluctuation (lower
45 : : //! case). This is true for both inserting variables into the set as well as
46 : : //! at matching terms of products in parsing requested statistics.
47 : : static std::set< char, CaseInsensitiveCharLess > depvars;
48 : :
49 : : } // grm::
50 : : } // tk::
51 : :
52 : : using inciter::LuaParser;
53 : :
54 : 193 : LuaParser::LuaParser( const tk::Print& /*print*/,
55 : : const ctr::CmdLine& cmdline,
56 : : ctr::InputDeck& inputdeck ) :
57 : 193 : m_filename( cmdline.get< tag::io, tag::control >() )
58 : : // *****************************************************************************
59 : : // Constructor
60 : : // //! \param[in] print Pretty printer
61 : : //! \param[in] cmdline Command line stack
62 : : //! \param[in,out] inputdeck Input deck stack where data is stored during
63 : : //! parsing
64 : : // *****************************************************************************
65 : : {
66 : : // Make sure there is a filename
67 : : Assert( !m_filename.empty(), "No filename specified" );
68 : :
69 : : // Local file stream handle
70 [ + - ]: 386 : std::ifstream q;
71 : :
72 : : // Check if file exists, throw exception if it does not
73 [ + - ]: 193 : q.open( m_filename, std::ifstream::in );
74 [ - + ][ - - ]: 193 : ErrChk( q.good(), "Failed to open file: " + m_filename );
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
75 : :
76 : : // Attempt to read a character, throw if it fails
77 : : // It is curious that on some systems opening a directory instead of a file
78 : : // with the above ifstream::open() call does not set the failbit. Thus we get
79 : : // here fine, so we try to read a character from it. If it is a directory or
80 : : // an empty file the read will fail, so we throw. Read more at: http://
81 : : // stackoverflow.com/questions/9591036/
82 : : // ifstream-open-doesnt-set-error-bits-when-argument-is-a-directory.
83 [ + - ]: 193 : q.get();
84 [ - + ][ - - ]: 193 : ErrChk( q.good(), "Failed to read from file: " + m_filename );
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
85 : :
86 : : // Close it
87 [ + - ]: 193 : q.close();
88 [ - + ][ - - ]: 193 : ErrChk( !q.fail(), "Failed to close file: " + m_filename );
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
89 : :
90 : : // Create InputDeck (a tagged tuple) to store parsed input
91 [ + - ]: 193 : ctr::InputDeck ideck( cmdline );
92 : :
93 : : // Read lua file into sol object
94 [ + - ]: 386 : sol::state lua_deck;
95 [ + - ][ + - ]: 193 : lua_deck.open_libraries(sol::lib::base);
96 [ + - ]: 193 : lua_deck.script_file(m_filename);
97 : :
98 : : // Store inputdeck parameters from sol object into tagged tuple
99 [ + - ]: 386 : storeInputDeck(lua_deck["inciter"], ideck);
100 : :
101 : : inputdeck = std::move( ideck );
102 : 193 : }
103 : :
104 : : void
105 : 193 : LuaParser::storeInputDeck(
106 : : const sol::table& lua_ideck,
107 : : ctr::InputDeck& gideck )
108 : : // *****************************************************************************
109 : : // Store lua inputdeck in custom struct
110 : : //! \param[in] lua_ideck Lua inputdeck parsed by sol2
111 : : //! \param[in,out] gideck Inciter's inputdeck storage
112 : : // *****************************************************************************
113 : : {
114 : : // TODO: explore replacing storeIfSpecd() and storeOptIfSpecd with sol::get_or()
115 : :
116 [ + - ][ + - ]: 579 : storeIfSpecd< std::string >(
[ + - ][ - + ]
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
117 : : lua_ideck, "title", gideck.get< tag::title >(), "No title");
118 : :
119 : : // time stepping options
120 : : // ---------------------------------------------------------------------------
121 [ + - ][ + - ]: 579 : storeIfSpecd< uint64_t >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
122 : : lua_ideck, "nstep", gideck.get< tag::nstep >(),
123 : : std::numeric_limits< uint64_t >::max());
124 [ + - ][ + - ]: 579 : storeIfSpecd< tk::real >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
125 : : lua_ideck, "term", gideck.get< tag::term >(),
126 : : std::numeric_limits< tk::real >::max());
127 [ + - ][ + - ]: 579 : storeIfSpecd< tk::real >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
128 : : lua_ideck, "t0", gideck.get< tag::t0 >(), 0.0);
129 [ + - ][ + - ]: 579 : storeIfSpecd< tk::real >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
130 : : lua_ideck, "dt", gideck.get< tag::dt >(), 0.0);
131 [ + - ][ + - ]: 579 : storeIfSpecd< tk::real >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
132 : : lua_ideck, "cfl", gideck.get< tag::cfl >(), 0.0);
133 [ + - ][ + - ]: 579 : storeIfSpecd< uint32_t >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
134 : : lua_ideck, "ttyi", gideck.get< tag::ttyi >(), 1);
135 [ + - ][ + - ]: 579 : storeIfSpecd< bool >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
136 : : lua_ideck, "steady_state", gideck.get< tag::steady_state >(), false);
137 [ + - ][ + - ]: 579 : storeIfSpecd< tk::real >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
138 : : lua_ideck, "residual", gideck.get< tag::residual >(), 1.0e-8);
139 [ + - ][ + - ]: 579 : storeIfSpecd< uint32_t >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
140 : : lua_ideck, "rescomp", gideck.get< tag::rescomp >(), 1);
141 [ + - ][ + - ]: 772 : storeIfSpecd< uint32_t >(
[ + - ][ + - ]
[ - - ]
142 : : lua_ideck, "imex_runge_kutta", gideck.get< tag::imex_runge_kutta >(), 0);
143 [ + - ][ + - ]: 579 : storeIfSpecd< uint32_t >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
144 : : lua_ideck, "imex_maxiter", gideck.get< tag::imex_maxiter >(), 50);
145 [ + - ][ + - ]: 579 : storeIfSpecd< tk::real >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
146 : : lua_ideck, "imex_reltol", gideck.get< tag::imex_reltol >(), 1.0e-02);
147 [ + - ][ + - ]: 579 : storeIfSpecd< tk::real >(
[ - + ][ - - ]
148 : : lua_ideck, "imex_abstol", gideck.get< tag::imex_abstol >(), 1.0e-04);
149 : :
150 [ + + ][ - + ]: 193 : if (gideck.get< tag::dt >() < 1e-12 && gideck.get< tag::cfl >() < 1e-12)
151 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("No time step calculation policy has been selected in the "
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
152 : : "preceeding block. Use keyword 'dt' to set a constant or 'cfl' to set an "
153 : : "adaptive time step size calculation policy.");
154 : :
155 : : // partitioning/reordering options
156 : : // ---------------------------------------------------------------------------
157 : : storeOptIfSpecd< tk::ctr::PartitioningAlgorithmType,
158 [ + - ][ + - ]: 579 : tk::ctr::PartitioningAlgorithm >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
159 : : lua_ideck, "partitioning", gideck.get< tag::partitioning >(),
160 : : tk::ctr::PartitioningAlgorithmType::RCB);
161 [ + - ][ + - ]: 579 : storeIfSpecd< bool >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
162 : : lua_ideck, "pelocal_reorder", gideck.get< tag::pelocal_reorder >(),
163 : : false);
164 [ + - ][ + - ]: 772 : storeIfSpecd< bool >(
[ + - ][ + - ]
[ - - ]
165 : : lua_ideck, "operator_reorder", gideck.get< tag::operator_reorder >(),
166 : : false);
167 : :
168 : : // discretization scheme options
169 : : // ---------------------------------------------------------------------------
170 : : using inciter::ctr::SchemeType;
171 [ + - ][ + - ]: 579 : storeOptIfSpecd< SchemeType, inciter::ctr::Scheme >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
172 : : lua_ideck, "scheme", gideck.get< tag::scheme >(), SchemeType::ALECG);
173 [ + - ][ + - ]: 579 : storeOptIfSpecd< inciter::ctr::LimiterType, inciter::ctr::Limiter >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
174 : : lua_ideck, "limiter", gideck.get< tag::limiter >(),
175 : : inciter::ctr::LimiterType::NOLIMITER);
176 [ + - ][ + - ]: 579 : storeIfSpecd< tk::real >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
177 : : lua_ideck, "cweight", gideck.get< tag::cweight >(), 1.0);
178 [ + - ][ + - ]: 772 : storeIfSpecd< tk::real >(
[ + - ][ + - ]
[ - - ]
179 : : lua_ideck, "shock_detector_coeff",
180 : : gideck.get< tag::shock_detector_coeff >(), 1.0);
181 [ + - ][ + - ]: 579 : storeIfSpecd< bool >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
182 : : lua_ideck, "accuracy_test", gideck.get< tag::accuracy_test >(), false);
183 [ + - ][ + - ]: 772 : storeIfSpecd< bool >(
[ + - ][ + - ]
[ - - ]
184 : : lua_ideck, "limsol_projection", gideck.get< tag::limsol_projection >(),
185 : : true);
186 [ + - ][ + - ]: 579 : storeIfSpecd< tk::real >(
[ - + ][ - - ]
187 : : lua_ideck, "lowspeed_kp", gideck.get< tag::lowspeed_kp >(), 0.0);
188 : :
189 : : // configure solutions DOFs
190 : 193 : auto scheme = gideck.get< tag::scheme >();
191 : : auto& ndof = gideck.get< tag::ndof >();
192 : : auto& rdof = gideck.get< tag::rdof >();
193 : 193 : ndof = rdof = 1;
194 [ + + ]: 193 : if (scheme == SchemeType::P0P1 || scheme == SchemeType::FV) {
195 : 29 : ndof = 1; rdof = 4;
196 [ + + ]: 164 : } else if (scheme == SchemeType::DGP1) {
197 : 17 : ndof = rdof = 4;
198 [ + + ]: 147 : } else if (scheme == SchemeType::DGP2) {
199 : 8 : ndof = rdof = 10;
200 [ + + ]: 139 : } else if (scheme == SchemeType::PDG) {
201 : 12 : ndof = rdof = 10;
202 : 12 : gideck.get< tag::pref, tag::pref >() = true;
203 : 127 : } else if (scheme != SchemeType::DG &&
204 [ + + ][ - + ]: 127 : scheme != SchemeType::ALECG &&
205 : : scheme != SchemeType::OversetFE) {
206 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Scheme type not configured in configure_scheme");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
207 : : }
208 : :
209 : : // PDE options
210 : : // ---------------------------------------------------------------------------
211 : :
212 : 193 : char depvar_cnt = 'a';
213 : 193 : gideck.get< tag::depvar >().resize(1);
214 : :
215 : : // check transport
216 [ + + ]: 193 : if (lua_ideck["transport"].valid()) {
217 : :
218 [ + - ][ + - ]: 276 : checkBlock< inciter::ctr::transportList::Keys >(lua_ideck["transport"],
[ - + ][ - - ]
219 : : "transport");
220 : :
221 [ + - ]: 92 : gideck.get< tag::pde >() = inciter::ctr::PDEType::TRANSPORT;
222 [ + - ][ + - ]: 276 : storeIfSpecd< std::size_t >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
223 : : lua_ideck["transport"], "ncomp",
224 : : gideck.get< tag::transport, tag::ncomp >(), 1);
225 [ + - ][ + - ]: 276 : storeIfSpecd< int >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
226 : : lua_ideck["transport"], "intsharp",
227 : : gideck.get< tag::transport, tag::intsharp >(), 0);
228 [ + - ][ + - ]: 276 : storeIfSpecd< tk::real >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
229 : : lua_ideck["transport"], "intsharp_param",
230 : : gideck.get< tag::transport, tag::intsharp_param >(), 1.8);
231 [ + - ][ + - ]: 276 : storeOptIfSpecd< inciter::ctr::ProblemType, inciter::ctr::Problem >(
[ - + ][ - - ]
232 : : lua_ideck["transport"], "problem",
233 : : gideck.get< tag::transport, tag::problem >(),
234 : : inciter::ctr::ProblemType::USER_DEFINED);
235 [ + - ][ + - ]: 276 : storeVecIfSpecd< tk::real >(
[ + - ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
236 : : lua_ideck["transport"], "diffusivity",
237 : : gideck.get< tag::transport, tag::diffusivity >(), {0.0, 0.0, 0.0});
238 [ + - ][ + - ]: 276 : storeVecIfSpecd< tk::real >(
[ + - ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
239 : : lua_ideck["transport"], "u0",
240 : : gideck.get< tag::transport, tag::u0 >(), {0.0, 0.0, 0.0});
241 [ + - ][ + - ]: 276 : storeVecIfSpecd< tk::real >(
[ + - ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
242 : : lua_ideck["transport"], "lambda",
243 : : gideck.get< tag::transport, tag::lambda >(), {0.0, 0.0, 0.0});
244 [ + - ]: 92 : gideck.get< tag::depvar >()[0] = 'c';
245 [ + - ][ + - ]: 276 : storeOptIfSpecd< inciter::ctr::FluxType, inciter::ctr::Flux >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
246 : : lua_ideck, "flux", gideck.get< tag::flux >(),
247 : : inciter::ctr::FluxType::UPWIND);
248 [ + - ][ + - ]: 276 : storeOptIfSpecd< inciter::ctr::PhysicsType, inciter::ctr::Physics >(
[ - + ][ - - ]
249 : : lua_ideck["transport"], "physics",
250 : : gideck.get< tag::transport, tag::physics >(),
251 : : inciter::ctr::PhysicsType::ADVECTION);
252 : :
253 : : // store number of equations in PDE system
254 : 92 : gideck.get< tag::ncomp >() =
255 : 92 : gideck.get< tag::transport, tag::ncomp >();
256 : : }
257 : :
258 : : // check compflow
259 [ + + ]: 193 : if (lua_ideck["compflow"].valid()) {
260 : :
261 [ + - ][ + - ]: 189 : checkBlock< inciter::ctr::compflowList::Keys >(lua_ideck["compflow"],
[ - + ][ - - ]
262 : : "compflow");
263 : :
264 [ + - ]: 63 : gideck.get< tag::pde >() = inciter::ctr::PDEType::COMPFLOW;
265 [ + - ][ + - ]: 189 : storeOptIfSpecd< inciter::ctr::ProblemType, inciter::ctr::Problem >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
266 : : lua_ideck["compflow"], "problem",
267 : : gideck.get< tag::compflow, tag::problem >(),
268 : : inciter::ctr::ProblemType::USER_DEFINED);
269 [ + - ][ + - ]: 189 : storeOptIfSpecd< inciter::ctr::PhysicsType, inciter::ctr::Physics >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
270 : : lua_ideck["compflow"], "physics",
271 : : gideck.get< tag::compflow, tag::physics >(),
272 : : inciter::ctr::PhysicsType::EULER);
273 : :
274 : : // problem parameters for MMS
275 [ + - ][ + - ]: 189 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["compflow"], "alpha",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
276 : : gideck.get< tag::compflow, tag::alpha >(), 0.0);
277 [ + - ][ + - ]: 189 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["compflow"], "beta",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
278 : : gideck.get< tag::compflow, tag::beta >(), 0.0);
279 [ + - ][ + - ]: 189 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["compflow"], "betax",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
280 : : gideck.get< tag::compflow, tag::betax >(), 0.0);
281 [ + - ][ + - ]: 189 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["compflow"], "betay",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
282 : : gideck.get< tag::compflow, tag::betay >(), 0.0);
283 [ + - ][ + - ]: 189 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["compflow"], "betaz",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
284 : : gideck.get< tag::compflow, tag::betaz >(), 0.0);
285 [ + - ][ + - ]: 189 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["compflow"], "r0",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
286 : : gideck.get< tag::compflow, tag::r0 >(), 0.0);
287 [ + - ][ + - ]: 189 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["compflow"], "p0",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
288 : : gideck.get< tag::compflow, tag::p0 >(), 0.0);
289 [ + - ][ + - ]: 189 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["compflow"], "ce",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
290 : : gideck.get< tag::compflow, tag::ce >(), 0.0);
291 [ + - ][ + - ]: 189 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["compflow"], "kappa",
[ - + ][ - - ]
292 : : gideck.get< tag::compflow, tag::kappa >(), 0.0);
293 : :
294 [ + - ]: 63 : gideck.get< tag::depvar >()[0] = 'a';
295 [ + - ][ + - ]: 189 : storeOptIfSpecd< inciter::ctr::FluxType, inciter::ctr::Flux >(
[ - + ][ - - ]
296 : : lua_ideck, "flux", gideck.get< tag::flux >(),
297 : : inciter::ctr::FluxType::HLLC);
298 : :
299 : : // store number of equations in PDE system
300 : 63 : gideck.get< tag::ncomp >() = 5;
301 : : }
302 : :
303 : : // check multimat
304 [ + + ]: 193 : if (lua_ideck["multimat"].valid()) {
305 : :
306 [ + - ][ + - ]: 96 : checkBlock< inciter::ctr::multimatList::Keys >(lua_ideck["multimat"],
[ - + ][ - - ]
307 : : "multimat");
308 : :
309 [ + - ]: 32 : gideck.get< tag::pde >() = inciter::ctr::PDEType::MULTIMAT;
310 [ + - ][ + - ]: 96 : storeIfSpecd< std::size_t >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
311 : : lua_ideck["multimat"], "nmat",
312 : : gideck.get< tag::multimat, tag::nmat >(), 2);
313 [ + - ][ + - ]: 96 : storeIfSpecd< uint64_t >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
314 : : lua_ideck["multimat"], "prelax",
315 : : gideck.get< tag::multimat, tag::prelax >(), 1);
316 [ + - ][ + - ]: 128 : storeIfSpecd< tk::real >(
[ + - ][ + - ]
[ - - ]
317 : : lua_ideck["multimat"], "prelax_timescale",
318 : : gideck.get< tag::multimat, tag::prelax_timescale >(), 0.25);
319 [ + - ][ + - ]: 96 : storeIfSpecd< int >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
320 : : lua_ideck["multimat"], "intsharp",
321 : : gideck.get< tag::multimat, tag::intsharp >(), 0);
322 [ + - ][ + - ]: 96 : storeIfSpecd< tk::real >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
323 : : lua_ideck["multimat"], "intsharp_param",
324 : : gideck.get< tag::multimat, tag::intsharp_param >(), 1.8);
325 [ + - ][ + - ]: 96 : storeIfSpecd< uint64_t >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
326 : : lua_ideck["multimat"], "rho0constraint",
327 : : gideck.get< tag::multimat, tag::rho0constraint >(), 1);
328 [ + - ][ + - ]: 96 : storeIfSpecd< int >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
329 : : lua_ideck["multimat"], "dt_sos_massavg",
330 : : gideck.get< tag::multimat, tag::dt_sos_massavg >(), 0);
331 [ + - ][ + - ]: 96 : storeOptIfSpecd< inciter::ctr::ProblemType, inciter::ctr::Problem >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
332 : : lua_ideck["multimat"], "problem",
333 : : gideck.get< tag::multimat, tag::problem >(),
334 : : inciter::ctr::ProblemType::USER_DEFINED);
335 [ + - ][ + - ]: 96 : storeOptIfSpecd< inciter::ctr::PhysicsType, inciter::ctr::Physics >(
[ - + ][ - - ]
336 : : lua_ideck["multimat"], "physics",
337 : : gideck.get< tag::multimat, tag::physics >(),
338 : : inciter::ctr::PhysicsType::EULER);
339 [ + - ]: 32 : gideck.get< tag::depvar >()[0] = 'a';
340 [ + - ][ + - ]: 96 : storeOptIfSpecd< inciter::ctr::FluxType, inciter::ctr::Flux >(
[ - + ][ - - ]
341 : : lua_ideck, "flux", gideck.get< tag::flux >(),
342 : : inciter::ctr::FluxType::AUSM);
343 : :
344 : : // number of equations in PDE system are determined based on materials
345 : : }
346 : :
347 : : // check multispecies
348 [ + + ]: 193 : if (lua_ideck["multispecies"].valid()) {
349 : :
350 [ + - ][ + - ]: 18 : checkBlock< inciter::ctr::multispeciesList::Keys >(lua_ideck["multispecies"],
[ - + ][ - - ]
351 : : "multispecies");
352 : :
353 [ + - ]: 6 : gideck.get< tag::pde >() = inciter::ctr::PDEType::MULTISPECIES;
354 [ + - ][ + - ]: 18 : storeIfSpecd< std::size_t >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
355 : : lua_ideck["multispecies"], "nspec",
356 : : gideck.get< tag::multispecies, tag::nspec >(), 1);
357 [ + - ][ + - ]: 18 : storeOptIfSpecd< inciter::ctr::ProblemType, inciter::ctr::Problem >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
358 : : lua_ideck["multispecies"], "problem",
359 : : gideck.get< tag::multispecies, tag::problem >(),
360 : : inciter::ctr::ProblemType::USER_DEFINED);
361 [ + - ][ + - ]: 18 : storeOptIfSpecd< inciter::ctr::PhysicsType, inciter::ctr::Physics >(
[ - + ][ - - ]
362 : : lua_ideck["multispecies"], "physics",
363 : : gideck.get< tag::multispecies, tag::physics >(),
364 : : inciter::ctr::PhysicsType::EULER);
365 [ + - ]: 6 : gideck.get< tag::depvar >()[0] = 'a';
366 [ + - ][ + - ]: 18 : storeOptIfSpecd< inciter::ctr::FluxType, inciter::ctr::Flux >(
[ - + ][ - - ]
367 : : lua_ideck, "flux", gideck.get< tag::flux >(),
368 : : inciter::ctr::FluxType::AUSM);
369 : :
370 : : // store number of equations in PDE system
371 : : // nspec: species mass conservation equations,
372 : : // 3: momentum equations,
373 : : // 1: total energy equation.
374 : 6 : gideck.get< tag::ncomp >() =
375 : 6 : gideck.get< tag::multispecies, tag::nspec >() + 3 + 1;
376 : : }
377 : :
378 : : // number of species, for future use
379 : : std::size_t nspec(1);
380 [ + + ]: 193 : if (gideck.get< tag::pde >() == inciter::ctr::PDEType::MULTISPECIES)
381 : 6 : nspec = gideck.get< tag::multispecies, tag::nspec >();
382 : :
383 : : // add depvar to deck::depvars so it can be selected as outvar later
384 : 193 : tk::grm::depvars.insert( gideck.get< tag::depvar >()[0] );
385 : :
386 : : // Assemble material blocks
387 : : // ---------------------------------------------------------------------------
388 : :
389 : : // solid counters
390 : : std::size_t tmat(0), imatcntr(0), mtypei(0), isolcntr(0);
391 : : bool is_solid(false);
392 : : std::set< std::size_t > matidset;
393 : :
394 : : // material vector
395 [ + - ][ + + ]: 193 : if (lua_ideck["material"].valid()) {
396 : :
397 : : // size material map vectors
398 : : std::size_t nmat(1);
399 [ + + ]: 101 : if (gideck.get< tag::pde >() == inciter::ctr::PDEType::MULTIMAT)
400 : 32 : nmat = gideck.get< tag::multimat, tag::nmat >();
401 [ + - ]: 101 : gideck.get< tag::matidxmap, tag::eosidx >().resize(nmat);
402 [ + - ]: 101 : gideck.get< tag::matidxmap, tag::matidx >().resize(nmat);
403 [ + - ]: 101 : gideck.get< tag::matidxmap, tag::solidx >().resize(nmat);
404 : :
405 : : // size material vector appropriately
406 : : // size of the material vector is the number of distinct types of materials
407 : : sol::table sol_mat = lua_ideck["material"];
408 [ + - ][ + - ]: 101 : gideck.get< tag::material >().resize(sol_mat.size());
409 : : // species vector size is one, since all species are only of one type for now
410 [ + - ]: 101 : gideck.get< tag::species >().resize(1);
411 : :
412 : : // store material properties
413 [ + + ]: 202 : for (std::size_t i=0; i<gideck.get< tag::material >().size(); ++i) {
414 : :
415 [ + - ][ + - ]: 303 : checkBlock< inciter::ctr::materialList::Keys >(sol_mat[i+1], "material");
[ + - ][ - + ]
[ - - ]
416 : :
417 [ + - ]: 101 : auto& mati_deck = gideck.get< tag::material >()[i];
418 : : // eos
419 [ + - ][ + - ]: 303 : storeOptIfSpecd< inciter::ctr::MaterialType, inciter::ctr::Material >(
[ - + ][ - - ]
420 : : sol_mat[i+1], "eos", mati_deck.get< tag::eos >(),
421 : : inciter::ctr::MaterialType::STIFFENEDGAS);
422 : :
423 : : // material ids in this eos (default is for compflow i.e. single mat)
424 [ + - ][ + - ]: 303 : storeVecIfSpecd< uint64_t >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
425 : : sol_mat[i+1], "id", mati_deck.get< tag::id >(),
426 [ + - ]: 101 : std::vector< uint64_t >(1,1));
427 : :
428 : : // Track total number of materials in multiple material blocks (eos's)
429 : 101 : tmat += mati_deck.get< tag::id >().size();
430 : :
431 : : // Check for repeating user specified material ids
432 [ + + ]: 254 : for (auto midx : mati_deck.get< tag::id >()) {
433 : : if (!matidset.count(midx))
434 : : matidset.insert(midx);
435 : : else
436 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Repeating material id specified");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
437 : : }
438 : :
439 [ + - ]: 101 : std::size_t ntype = mati_deck.get< tag::id >().size();
440 : : // cv
441 [ + - ][ + + ]: 101 : if (!sol_mat[i+1]["cv"].valid())
442 [ + - ][ - + ]: 150 : sol_mat[i+1]["cv"] = std::vector< tk::real >(ntype, 717.5);
[ - - ]
443 [ + - ][ + - ]: 303 : checkStoreMatProp(sol_mat[i+1], "cv", ntype, mati_deck.get< tag::cv >());
[ - + ][ - - ]
444 : :
445 : : // reset solid-marker
446 : : is_solid = false;
447 : :
448 : : // Stiffened-gas materials
449 [ + + ]: 101 : if (mati_deck.get< tag::eos >() ==
450 : : inciter::ctr::MaterialType::STIFFENEDGAS) {
451 : : // gamma
452 [ + - ][ + - ]: 285 : checkStoreMatProp(sol_mat[i+1], "gamma", ntype,
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
453 : : mati_deck.get< tag::gamma >());
454 : :
455 : : // pstiff
456 [ + - ][ + + ]: 95 : if (!sol_mat[i+1]["pstiff"].valid())
457 [ + - ][ - + ]: 184 : sol_mat[i+1]["pstiff"] = std::vector< tk::real >(ntype, 0.0);
[ - - ]
458 [ + - ][ + - ]: 285 : checkStoreMatProp(sol_mat[i+1], "pstiff", ntype,
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
459 : : mati_deck.get< tag::pstiff >());
460 : :
461 : : // mu (dynamic viscosity) and 'viscous' keyword
462 [ + - ][ + - ]: 95 : if (!sol_mat[i+1]["mu"].valid())
463 [ + - ][ - + ]: 190 : sol_mat[i+1]["mu"] = std::vector< tk::real >(ntype, 0.0);
[ - - ]
464 : 0 : else gideck.get< tag::multimat, tag::viscous >() = true;
465 [ + - ][ + - ]: 285 : checkStoreMatProp(sol_mat[i+1], "mu", ntype, mati_deck.get< tag::mu >());
[ - + ][ - - ]
466 : : }
467 : : // Small-shear solid materials
468 [ - + ]: 6 : else if (mati_deck.get< tag::eos >() ==
469 : : inciter::ctr::MaterialType::SMALLSHEARSOLID) {
470 : : // gamma
471 [ - - ][ - - ]: 0 : checkStoreMatProp(sol_mat[i+1], "gamma", ntype,
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
472 : : mati_deck.get< tag::gamma >());
473 : :
474 : : // pstiff
475 [ - - ][ - - ]: 0 : if (!sol_mat[i+1]["pstiff"].valid())
476 [ - - ][ - - ]: 0 : sol_mat[i+1]["pstiff"] = std::vector< tk::real >(ntype, 0.0);
[ - - ]
477 [ - - ][ - - ]: 0 : checkStoreMatProp(sol_mat[i+1], "pstiff", ntype,
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
478 : : mati_deck.get< tag::pstiff >());
479 : :
480 : : // mu
481 [ - - ][ - - ]: 0 : checkStoreMatProp(sol_mat[i+1], "mu", ntype,
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
482 : : mati_deck.get< tag::mu >());
483 : :
484 : : // yield_stress
485 [ - - ][ - - ]: 0 : if (!sol_mat[i+1]["yield_stress"].valid())
486 : : sol_mat[i+1]["yield_stress"] =
487 [ - - ][ - - ]: 0 : std::vector< tk::real >(ntype, 300.0e+06);
[ - - ]
488 [ - - ][ - - ]: 0 : checkStoreMatProp(sol_mat[i+1], "yield_stress", ntype,
[ - - ][ - - ]
489 : : mati_deck.get< tag::yield_stress >());
490 : :
491 : : // assign solid
492 : : is_solid = true;
493 : : }
494 : : // Godunov-Romenski aluminum materials
495 [ - + ]: 6 : else if (mati_deck.get< tag::eos >() ==
496 : : inciter::ctr::MaterialType::GODUNOVROMENSKIALUMINUM) {
497 : : // gamma
498 [ - - ][ - - ]: 0 : checkStoreMatProp(sol_mat[i+1], "gamma", ntype,
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
499 : : mati_deck.get< tag::gamma >());
500 : :
501 : : // mu
502 [ - - ][ - - ]: 0 : checkStoreMatProp(sol_mat[i+1], "mu", ntype,
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
503 : : mati_deck.get< tag::mu >());
504 : :
505 : : // yield_stress
506 [ - - ][ - - ]: 0 : if (!sol_mat[i+1]["yield_stress"].valid())
507 : : sol_mat[i+1]["yield_stress"] =
508 [ - - ][ - - ]: 0 : std::vector< tk::real >(ntype, 300.0e+06);
[ - - ]
509 [ - - ][ - - ]: 0 : checkStoreMatProp(sol_mat[i+1], "yield_stress", ntype,
[ - - ][ - - ]
510 : : mati_deck.get< tag::yield_stress >());
511 : :
512 : : // assign solid
513 : : is_solid = true;
514 : : }
515 : : // JWL materials
516 [ - + ]: 6 : else if (mati_deck.get< tag::eos >() == inciter::ctr::MaterialType::JWL) {
517 : : // w_gru
518 [ - - ][ - - ]: 0 : checkStoreMatProp(sol_mat[i+1], "w_gru", ntype,
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
519 : : mati_deck.get< tag::w_gru >());
520 : :
521 : : // a_jwl
522 [ - - ][ - - ]: 0 : checkStoreMatProp(sol_mat[i+1], "A_jwl", ntype,
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
523 : : mati_deck.get< tag::A_jwl >());
524 : :
525 : : // b_jwl
526 [ - - ][ - - ]: 0 : checkStoreMatProp(sol_mat[i+1], "B_jwl", ntype,
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
527 : : mati_deck.get< tag::B_jwl >());
528 : :
529 : : // R1_jwl
530 [ - - ][ - - ]: 0 : checkStoreMatProp(sol_mat[i+1], "R1_jwl", ntype,
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
531 : : mati_deck.get< tag::R1_jwl >());
532 : :
533 : : // R2_jwl
534 [ - - ][ - - ]: 0 : checkStoreMatProp(sol_mat[i+1], "R2_jwl", ntype,
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
535 : : mati_deck.get< tag::R2_jwl >());
536 : :
537 : : // rho0_jwl
538 [ - - ][ - - ]: 0 : checkStoreMatProp(sol_mat[i+1], "rho0_jwl", ntype,
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
539 : : mati_deck.get< tag::rho0_jwl >());
540 : :
541 : : // de_jwl
542 [ - - ][ - - ]: 0 : checkStoreMatProp(sol_mat[i+1], "de_jwl", ntype,
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
543 : : mati_deck.get< tag::de_jwl >());
544 : :
545 : : // Pr_jwl
546 [ - - ][ - - ]: 0 : checkStoreMatProp(sol_mat[i+1], "Pr_jwl", ntype,
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
547 : : mati_deck.get< tag::Pr_jwl >());
548 : :
549 : : // rhor_jwl
550 [ - - ][ - - ]: 0 : if (sol_mat[i+1]["rhor_jwl"].valid()) {
551 [ - - ][ - - ]: 0 : checkStoreMatProp(sol_mat[i+1], "rhor_jwl", ntype,
[ - - ][ - - ]
552 : : mati_deck.get< tag::rhor_jwl >());
553 : : }
554 : : // Tr_jwl
555 [ - - ][ - - ]: 0 : else if (sol_mat[i+1]["Tr_jwl"].valid()) {
556 [ - - ][ - - ]: 0 : checkStoreMatProp(sol_mat[i+1], "Tr_jwl", ntype,
[ - - ][ - - ]
557 : : mati_deck.get< tag::Tr_jwl >());
558 : : }
559 : : else
560 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Either reference density or reference temperature must be "
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
561 : : "specified for JWL equation of state (EOS).");
562 : : }
563 : : // Thermally-perfect gas materials
564 [ + - ]: 6 : else if (mati_deck.get< tag::eos >() ==
565 : : inciter::ctr::MaterialType::THERMALLYPERFECTGAS) {
566 : :
567 [ + - ][ - + ]: 6 : if (!lua_ideck["species"].valid())
[ - - ]
568 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Species block must be specified for thermally perfect gas");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
569 : : sol::table sol_spc = lua_ideck["species"];
570 : :
571 : : // We have assumed that nmat == 1 always for multi species, and that
572 : : // all species are of a single type, so that the outer species vector
573 : : // is of size one
574 : 6 : auto& spci_deck = gideck.get< tag::species >()[0];
575 : :
576 : : // species ids (default is for single species)
577 [ + - ][ + - ]: 18 : storeVecIfSpecd< uint64_t >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
578 : : sol_spc[i+1], "id", spci_deck.get< tag::id >(),
579 [ + - ][ + - ]: 12 : std::vector< uint64_t >(1,1));
[ - - ]
580 : :
581 : : Assert(nspec == spci_deck.get< tag::id >().size(),
582 : : "Number of ids in species-block not equal to number of species");
583 : :
584 : : // gamma
585 [ + - ][ + - ]: 18 : checkStoreMatProp(sol_spc[i+1], "gamma", nspec,
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
586 : : spci_deck.get< tag::gamma >());
587 : : // R
588 [ + - ][ + - ]: 18 : checkStoreMatProp(sol_spc[i+1], "R", nspec,
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
589 : : spci_deck.get< tag::R >());
590 : : // cp_coeff
591 [ + - ][ + - ]: 18 : checkStoreMatPropVecVec(sol_spc[i+1], "cp_coeff", nspec, 3, 8,
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
592 : : spci_deck.get< tag::cp_coeff >());
593 : : // t_range
594 [ + - ][ + - ]: 18 : checkStoreMatPropVec(sol_spc[i+1], "t_range", nspec, 4,
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
595 : : spci_deck.get< tag::t_range >());
596 : : // dH_ref
597 [ + - ][ + - ]: 18 : checkStoreMatProp(sol_spc[i+1], "dH_ref", nspec,
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
598 : : spci_deck.get< tag::dH_ref >());
599 : : }
600 : :
601 : : // Generate mapping between material index and eos parameter index
602 : : auto& eosmap = gideck.get< tag::matidxmap, tag::eosidx >();
603 : : auto& idxmap = gideck.get< tag::matidxmap, tag::matidx >();
604 : : auto& solidxmap = gideck.get< tag::matidxmap, tag::solidx >();
605 [ + + ]: 254 : for (auto midx : mati_deck.get< tag::id >()) {
606 : 153 : midx -= 1;
607 [ - + ]: 153 : eosmap[midx] = mtypei;
608 : 153 : idxmap[midx] = imatcntr;
609 [ - + ]: 153 : if (is_solid) {
610 : : // add to solid-counter
611 : 0 : ++isolcntr;
612 : 0 : solidxmap[midx] = isolcntr;
613 : : }
614 : 153 : ++imatcntr;
615 : : }
616 : : // end of materials for this eos, thus reset index counter
617 : : imatcntr = 0;
618 : : // increment material-type/eos-type index counter
619 : : ++mtypei;
620 : : }
621 : :
622 : : // Error checking on material ids
623 : : // -------------------------------------------------------------------------
624 : :
625 : : // Total number of materials
626 [ - + ]: 101 : if (tmat != nmat)
627 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("The total number of materials in all the material blocks (" +
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
628 : : std::to_string(tmat) +
629 : : ") is not equal to the number of materials specified 'nmat'.");
630 : :
631 : : // Contiguous and 1-based material ids
632 [ - + ]: 101 : if (*matidset.begin() != 1)
633 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Material ids specified in material blocks not one-based. "
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
634 : : "Material ids must begin with one.");
635 : : std::size_t icount(1);
636 [ + + ]: 254 : for (auto midx : matidset) {
637 [ - + ]: 153 : if (midx != icount)
638 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Material ids specified in material blocks have a gap. "
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
639 : : "Material ids must be contiguous.");
640 : 153 : ++icount;
641 : : }
642 : :
643 : : // Set up number of PDEs for multimat
644 [ + + ]: 101 : if (gideck.get< tag::pde >() == inciter::ctr::PDEType::MULTIMAT) {
645 : 32 : auto ntot = nmat + nmat + 3 + nmat;
646 : : // if solid EOS, add components
647 : : const auto& solidx = gideck.get< tag::matidxmap, tag::solidx >();
648 [ + + ]: 116 : for (std::size_t i=0; i<solidx.size(); ++i) {
649 [ - + ]: 84 : if (solidx[i] > 0)
650 : 0 : ntot += 9;
651 : : }
652 : 32 : gideck.get< tag::ncomp >() = ntot;
653 : : }
654 : : }
655 : :
656 : : // Mesh specification block (for overset)
657 : : // ---------------------------------------------------------------------------
658 [ + - ][ + + ]: 193 : if (lua_ideck["mesh"].valid()) {
659 : : const sol::table& lua_mesh = lua_ideck["mesh"];
660 : : auto& mesh_deck = gideck.get< tag::mesh >();
661 [ + - ][ + - ]: 11 : mesh_deck.resize(lua_mesh.size());
662 : :
663 [ + + ]: 23 : for (std::size_t i=0; i<mesh_deck.size(); ++i) {
664 : :
665 [ + - ][ + - ]: 36 : checkBlock< inciter::ctr::meshList::Keys >(lua_mesh[i+1], "mesh");
[ + - ][ - + ]
[ - - ]
666 : :
667 : : // filename
668 [ + - ][ + - ]: 48 : storeIfSpecd< std::string >(lua_mesh[i+1], "filename",
[ + - ][ - + ]
[ - + ][ - - ]
669 [ + - ]: 12 : mesh_deck[i].get< tag::filename >(), "");
670 : :
671 : : // location
672 [ + - ][ + - ]: 48 : storeVecIfSpecd< tk::real >(lua_mesh[i+1], "location",
[ + - ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
673 [ + - ]: 12 : mesh_deck[i].get< tag::location >(), {0.0, 0.0, 0.0});
674 [ - + ]: 12 : if (mesh_deck[i].get< tag::location >().size() != 3)
675 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Mesh location requires 3 coordinates.");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
676 : :
677 : : // orientation
678 [ + - ][ + - ]: 48 : storeVecIfSpecd< tk::real >(lua_mesh[i+1], "orientation",
[ + - ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
679 [ + - ]: 12 : mesh_deck[i].get< tag::orientation >(), {0.0, 0.0, 0.0});
680 [ - + ]: 12 : if (mesh_deck[i].get< tag::orientation >().size() != 3)
681 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Mesh orientation requires 3 rotation angles.");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
682 : :
683 : : // mass
684 [ + - ][ + - ]: 36 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_mesh[i+1], "mass",
[ + - ][ - + ]
[ - - ]
685 : : mesh_deck[i].get< tag::mass >(), 0.0);
686 : :
687 : : // Transfer object
688 [ + + ]: 12 : if (i > 0) {
689 [ + - ][ - - ]: 1 : gideck.get< tag::transfer >().emplace_back( 0, i );
690 : :
691 : : // assign depvar
692 : 1 : ++depvar_cnt;
693 [ + - ]: 1 : gideck.get< tag::depvar >().push_back(depvar_cnt);
694 : :
695 : : // add depvar to deck::depvars so it can be selected as outvar later
696 : : tk::grm::depvars.insert(depvar_cnt);
697 : : }
698 : : }
699 : : }
700 : : else {
701 : : // TODO: remove double-specification of defaults
702 : : auto& mesh_deck = gideck.get< tag::mesh >();
703 [ + - ]: 182 : mesh_deck.resize(1);
704 [ + - ]: 182 : mesh_deck[0].get< tag::filename >() =
705 : : gideck.get< tag::cmd, tag::io, tag::input >();
706 [ + - ]: 182 : mesh_deck[0].get< tag::location >() = {0.0, 0.0, 0.0};
707 [ + - ]: 182 : mesh_deck[0].get< tag::orientation >() = {0.0, 0.0, 0.0};
708 : 182 : mesh_deck[0].get< tag::mass >() = 0.0;
709 : : }
710 : :
711 : : Assert(gideck.get< tag::mesh >().size() == gideck.get< tag::depvar >().size(),
712 : : "Number of depvar not equal to the number of meshes.");
713 : :
714 : : // Rigid body motion block for overset meshes
715 : : // ---------------------------------------------------------------------------
716 [ + - ][ - + ]: 193 : if (lua_ideck["rigid_body_motion"].valid()) {
717 : :
718 : : Assert(gideck.get< tag::mesh >().size() > 1,
719 : : "Multiple meshes (overset) needed for rigid body motion.");
720 : :
721 : : // check that rigid body mass is provided
722 [ - - ]: 0 : const auto mesh_deck = gideck.get< tag::mesh >();
723 [ - - ]: 0 : for (std::size_t i=1; i<mesh_deck.size(); ++i) {
724 : : Assert(mesh_deck[i].get< tag::mass >() > 1e-10,
725 : : "Mass of body required for overset meshes with rigid body motion.");
726 : : }
727 : :
728 : : auto& rbm_deck = gideck.get< tag::rigid_body_motion >();
729 : :
730 [ - - ]: 0 : rbm_deck.get< tag::rigid_body_movt >() = true;
731 : :
732 : : // degrees of freedom
733 [ - - ][ - - ]: 0 : storeIfSpecd< std::size_t >(
[ - - ][ - - ]
734 : : lua_ideck["rigid_body_motion"], "rigid_body_dof",
735 : : rbm_deck.get< tag::rigid_body_dof >(), 3);
736 [ - - ][ - - ]: 0 : if (rbm_deck.get< tag::rigid_body_dof >() != 3 &&
737 : : rbm_deck.get< tag::rigid_body_dof >() != 6)
738 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Only 3 or 6 rigid body DOFs supported.");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
739 : :
740 : : // symmetry plane
741 [ - - ][ - - ]: 0 : storeIfSpecd< std::size_t >(
[ - - ][ - - ]
742 : : lua_ideck["rigid_body_motion"], "symmetry_plane",
743 : : rbm_deck.get< tag::symmetry_plane >(), 0);
744 [ - - ]: 0 : if (rbm_deck.get< tag::symmetry_plane >() > 3)
745 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Rigid body motion symmetry plane must be 1(x), 2(y), or 3(z).");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
746 [ - - ]: 0 : if (rbm_deck.get< tag::symmetry_plane >() == 0 &&
747 [ - - ]: 0 : rbm_deck.get< tag::rigid_body_dof >() == 3)
748 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw(
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
749 : : "Rigid body motion symmetry plane must be specified for 3 DOF motion.");
750 : : // reset to 0-based indexing
751 : 0 : rbm_deck.get< tag::symmetry_plane >() -= 1;
752 : : }
753 : : else {
754 : : // TODO: remove double-specification of defaults
755 : : auto& rbm_deck = gideck.get< tag::rigid_body_motion >();
756 : 193 : rbm_deck.get< tag::rigid_body_movt >() = false;
757 : 193 : rbm_deck.get< tag::rigid_body_dof >() = 0;
758 : 193 : rbm_deck.get< tag::symmetry_plane >() = 0;
759 : : }
760 : :
761 : : // Field output block
762 : : // ---------------------------------------------------------------------------
763 [ + - ][ + - ]: 193 : if (lua_ideck["field_output"].valid()) {
764 : :
765 [ + - ][ + - ]: 579 : checkBlock< inciter::ctr::fieldOutputList::Keys >(lua_ideck["field_output"],
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
766 : : "field_output");
767 : :
768 : : auto& fo_deck = gideck.get< tag::field_output >();
769 : :
770 : : // interval iteration
771 [ + - ][ + - ]: 579 : storeIfSpecd< uint32_t >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
772 : : lua_ideck["field_output"], "interval",
773 : : fo_deck.get< tag::interval >(),
774 : : std::numeric_limits< uint32_t >::max());
775 : :
776 : : // interval physical time
777 [ + - ][ + - ]: 579 : storeIfSpecd< tk::real >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
778 : : lua_ideck["field_output"], "time_interval",
779 : : fo_deck.get< tag::time_interval >(),
780 : : std::numeric_limits< tk::real >::max());
781 : :
782 : : // interval time range
783 [ + - ][ + - ]: 579 : storeVecIfSpecd< tk::real >(
[ - + ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
784 : : lua_ideck["field_output"], "time_range",
785 : : fo_deck.get< tag::time_range >(), {});
786 : :
787 : : // refined mesh field output
788 [ + - ][ + - ]: 579 : storeIfSpecd< bool >(
[ - + ][ - - ]
789 : : lua_ideck["field_output"], "refined", fo_deck.get< tag::refined >(),
790 : : false);
791 [ + - ]: 193 : gideck.get< tag::cmd, tag::io, tag::refined >() = fo_deck.get< tag::refined >();
792 : :
793 : : // filetype
794 [ + - ][ + - ]: 579 : storeOptIfSpecd< tk::ctr::FieldFileType, tk::ctr::FieldFile >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
795 : : lua_ideck["field_output"], "filetype", fo_deck.get< tag::filetype >(),
796 : : tk::ctr::FieldFileType::EXODUSII);
797 : :
798 : : // sidesets for field output
799 [ + - ][ + - ]: 579 : storeVecIfSpecd< uint64_t >(
[ - + ][ - + ]
[ + + ][ - - ]
800 : : lua_ideck["field_output"], "sideset", fo_deck.get< tag::sideset >(), {});
801 : :
802 : : // Assign outvar
803 : : auto& foutvar = fo_deck.get< tag::outvar >();
804 : : std::size_t nevar(0), nnvar(0), tensorcompvar(0);
805 : : std::size_t nmat(1);
806 [ + + ]: 193 : if (gideck.get< tag::pde >() == inciter::ctr::PDEType::MULTIMAT)
807 : 32 : nmat = gideck.get< tag::multimat, tag::nmat >();
808 : :
809 : : // elem aliases
810 : 193 : std::vector< std::string > elemalias;
811 [ + - ][ + + ]: 193 : if (lua_ideck["field_output"]["elemvar"].valid())
812 [ + - ]: 178 : nevar = sol::table(lua_ideck["field_output"]["elemvar"]).size();
813 [ + - ][ + - ]: 579 : storeVecIfSpecd< std::string >(
[ - + ][ - - ]
814 : : lua_ideck["field_output"], "elemalias", elemalias,
815 [ + - ][ + - ]: 386 : std::vector< std::string >(nevar, ""));
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
816 : :
817 : : // node aliases
818 : 193 : std::vector< std::string > nodealias;
819 [ + - ][ + + ]: 193 : if (lua_ideck["field_output"]["nodevar"].valid())
820 [ + - ]: 78 : nnvar = sol::table(lua_ideck["field_output"]["nodevar"]).size();
821 [ + - ][ + - ]: 579 : storeVecIfSpecd< std::string >(
[ - + ][ - - ]
822 : : lua_ideck["field_output"], "nodealias", nodealias,
823 [ + - ][ + - ]: 386 : std::vector< std::string >(nnvar, ""));
[ - + ][ - - ]
824 : :
825 : : // error check on aliases
826 [ - + ]: 193 : if (elemalias.size() != nevar)
827 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("elemalias should have the same size as elemvar.");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
828 [ - + ]: 193 : if (nodealias.size() != nnvar)
829 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("nodealias should have the same size as nodevar.");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
830 : :
831 : : // element variables
832 [ + - ][ + + ]: 193 : if (lua_ideck["field_output"]["elemvar"].valid()) {
833 [ + + ]: 510 : for (std::size_t i=0; i<nevar; ++i) {
834 [ + - ]: 421 : std::string varname(lua_ideck["field_output"]["elemvar"][i+1]);
835 [ + - ]: 421 : std::string alias(elemalias[i]);
836 : : // add extra outvars for tensor components
837 : : if (varname.find("_tensor") != std::string::npos) tensorcompvar += 8;
838 [ + - ]: 421 : addOutVar(varname, alias, gideck.get< tag::depvar >(), nmat,
839 : : nspec, gideck.get< tag::pde >(), tk::Centering::ELEM, foutvar);
840 : : }
841 : : }
842 : :
843 : : // node variables
844 [ + - ][ + + ]: 193 : if (lua_ideck["field_output"]["nodevar"].valid()) {
845 [ + + ]: 252 : for (std::size_t i=0; i<nnvar; ++i) {
846 [ + - ]: 213 : std::string varname(lua_ideck["field_output"]["nodevar"][i+1]);
847 [ + - ]: 213 : std::string alias(nodealias[i]);
848 : : // add extra outvars for tensor components
849 : : if (varname.find("_tensor") != std::string::npos) tensorcompvar += 8;
850 [ + - ]: 213 : addOutVar(varname, alias, gideck.get< tag::depvar >(), nmat,
851 : : nspec, gideck.get< tag::pde >(), tk::Centering::NODE, foutvar);
852 : : }
853 : : }
854 : :
855 : : Assert(foutvar.size() == (nevar + nnvar + tensorcompvar),
856 : : "Incorrectly sized outvar vector.");
857 : : }
858 : : else {
859 : : // TODO: remove double-specification of defaults
860 : : auto& fo_deck = gideck.get< tag::field_output >();
861 : 0 : fo_deck.get< tag::interval >() =
862 : : std::numeric_limits< uint32_t >::max();
863 [ - - ]: 0 : fo_deck.get< tag::time_interval >() =
864 : : std::numeric_limits< tk::real >::max();
865 : : fo_deck.get< tag::time_range >() = {};
866 : 0 : fo_deck.get< tag::refined >() = false;
867 [ - - ]: 0 : fo_deck.get< tag::filetype >() = tk::ctr::FieldFileType::EXODUSII;
868 : : fo_deck.get< tag::sideset >() = {};
869 : : }
870 : :
871 : : // Diagnostics output block
872 : : // ---------------------------------------------------------------------------
873 [ + - ][ + + ]: 193 : if (lua_ideck["diagnostics"].valid()) {
874 : :
875 [ + - ][ + - ]: 312 : checkBlock< inciter::ctr::diagnosticsList::Keys >(lua_ideck["diagnostics"],
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
876 : : "diagnostics");
877 : :
878 : : auto& diag_deck = gideck.get< tag::diagnostics >();
879 : :
880 : : // interval iteration
881 [ + - ][ + - ]: 312 : storeIfSpecd< uint32_t >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
882 : : lua_ideck["diagnostics"], "interval",
883 : : diag_deck.get< tag::interval >(), 1);
884 : :
885 : : // error norm
886 [ + - ][ + - ]: 312 : storeOptIfSpecd< tk::ctr::ErrorType, tk::ctr::Error >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
887 : : lua_ideck["diagnostics"], "error", diag_deck.get< tag::error >(),
888 : : tk::ctr::ErrorType::L2);
889 : :
890 : : // float format
891 [ + - ][ + - ]: 312 : storeOptIfSpecd< tk::ctr::TxtFloatFormatType, tk::ctr::TxtFloatFormat >(
[ - + ][ - - ]
892 : : lua_ideck["diagnostics"], "format", diag_deck.get< tag::format >(),
893 : : tk::ctr::TxtFloatFormatType::DEFAULT);
894 : :
895 : : // precision
896 [ + - ][ + - ]: 312 : storeIfSpecd< std::streamsize >(
[ - + ][ - - ]
897 : : lua_ideck["diagnostics"], "precision",
898 : : diag_deck.get< tag::precision >(), std::cout.precision());
899 : : }
900 : : else {
901 : : // TODO: remove double-specification of defaults
902 : : auto& diag_deck = gideck.get< tag::diagnostics >();
903 : 89 : diag_deck.get< tag::interval >() = 1;
904 : 89 : diag_deck.get< tag::error >() = tk::ctr::ErrorType::L2;
905 : 89 : diag_deck.get< tag::format >() = tk::ctr::TxtFloatFormatType::DEFAULT;
906 : 89 : diag_deck.get< tag::precision >() = std::cout.precision();
907 : : }
908 : :
909 : : // History output block
910 : : // ---------------------------------------------------------------------------
911 [ + - ][ + + ]: 193 : if (lua_ideck["history_output"].valid()) {
912 : :
913 [ + - ][ + - ]: 12 : checkBlock< inciter::ctr::historyOutputList::Keys >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
914 : : lua_ideck["history_output"], "history_output");
915 : :
916 : : auto& hist_deck = gideck.get< tag::history_output >();
917 : :
918 : : // interval iteration
919 [ + - ][ + - ]: 12 : storeIfSpecd< uint32_t >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
920 : : lua_ideck["history_output"], "interval",
921 : : hist_deck.get< tag::interval >(),
922 : : std::numeric_limits< uint32_t >::max());
923 : :
924 : : // interval time
925 [ + - ][ + - ]: 12 : storeIfSpecd< tk::real >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
926 : : lua_ideck["history_output"], "time_interval",
927 : : hist_deck.get< tag::time_interval >(),
928 : : std::numeric_limits< tk::real >::max());
929 : :
930 : : // interval time range
931 [ + - ][ + - ]: 12 : storeVecIfSpecd< tk::real >(
[ - + ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
932 : : lua_ideck["history_output"], "time_range",
933 : : hist_deck.get< tag::time_range >(), {});
934 : :
935 : : // point probes
936 [ + - ][ + - ]: 4 : if (lua_ideck["history_output"]["point"].valid()) {
937 : : const sol::table& sol_pt = lua_ideck["history_output"]["point"];
938 [ + - ][ + - ]: 4 : hist_deck.get< tag::point >().resize(sol_pt.size());
939 : :
940 [ + + ]: 12 : for (std::size_t i=0; i<hist_deck.get< tag::point >().size(); ++i) {
941 : : auto& pti = hist_deck.get< tag::point >()[i];
942 [ + - ][ + - ]: 24 : storeIfSpecd< std::string >(
[ + - ][ - + ]
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
943 [ + - ]: 8 : sol_pt[i+1], "id", pti.get< tag::id >(), "p");
944 [ + - ][ + - ]: 24 : storeVecIfSpecd< tk::real >(
[ - + ][ - + ]
[ - - ][ - - ]
945 : : sol_pt[i+1], "coord", pti.get< tag::coord >(), {});
946 : : }
947 : : }
948 : :
949 : : // float format
950 [ + - ][ + - ]: 12 : storeOptIfSpecd< tk::ctr::TxtFloatFormatType, tk::ctr::TxtFloatFormat >(
[ - + ][ - - ]
951 : : lua_ideck["history_output"], "format", hist_deck.get< tag::format >(),
952 : : tk::ctr::TxtFloatFormatType::DEFAULT);
953 : :
954 : : // precision
955 [ + - ][ + - ]: 12 : storeIfSpecd< std::streamsize >(
[ - + ][ - - ]
956 : : lua_ideck["history_output"], "precision",
957 : : hist_deck.get< tag::precision >(), std::cout.precision());
958 : :
959 : : // error check point
960 [ + + ]: 12 : for (std::size_t i=0; i<hist_deck.get< tag::point >().size(); ++i) {
961 [ - + ]: 8 : if (hist_deck.get< tag::point >()[i].get< tag::coord >().size() != 3)
962 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Three reals required for point coordinates in history_output.");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
963 : : }
964 : : }
965 : : else {
966 : : // TODO: remove double-specification of defaults
967 : : auto& hist_deck = gideck.get< tag::history_output >();
968 : 189 : hist_deck.get< tag::interval >() =
969 : : std::numeric_limits< uint32_t >::max();
970 [ + - ]: 189 : hist_deck.get< tag::time_interval >() =
971 : : std::numeric_limits< tk::real >::max();
972 : : hist_deck.get< tag::time_range >() = {};
973 [ + - ]: 189 : hist_deck.get< tag::precision >() = std::cout.precision();
974 [ + - ]: 189 : hist_deck.get< tag::point >().resize(0);
975 : : }
976 : :
977 : : // ALE block
978 : : // ---------------------------------------------------------------------------
979 [ + - ]: 193 : gideck.get< tag::ale, tag::ale >() = false;
980 [ + - ][ + + ]: 193 : if (lua_ideck["ale"].valid()) {
981 : : auto& ale_deck = gideck.get< tag::ale >();
982 [ + - ]: 10 : ale_deck.get< tag::ale >() = true;
983 : :
984 : : // Mesh velocity smoother
985 : : storeOptIfSpecd< inciter::ctr::MeshVelocitySmootherType,
986 [ + - ][ + - ]: 30 : inciter::ctr::MeshVelocitySmoother >(lua_ideck["ale"], "smoother",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
987 : : ale_deck.get< tag::smoother >(), inciter::ctr::MeshVelocitySmootherType::NONE);
988 : :
989 : : // Mesh velocity
990 : : storeOptIfSpecd< inciter::ctr::MeshVelocityType,
991 [ + - ][ + - ]: 30 : inciter::ctr::MeshVelocity >(lua_ideck["ale"], "mesh_velocity",
[ - + ][ - - ]
992 : : ale_deck.get< tag::mesh_velocity >(), inciter::ctr::MeshVelocityType::SINE);
993 : :
994 : : // Mesh motion direction
995 [ + - ][ + - ]: 30 : storeVecIfSpecd< std::size_t >(lua_ideck["ale"], "mesh_motion",
[ + - ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
996 : : ale_deck.get< tag::mesh_motion >(), { 0, 1, 2 });
997 : :
998 : : // Mesh force
999 [ + - ][ + - ]: 40 : storeVecIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["ale"], "meshforce",
[ + - ][ - + ]
[ + - ][ + - ]
[ - - ]
1000 : : ale_deck.get< tag::meshforce >(), { 0, 0, 0, 0 });
1001 : :
1002 : : // Dirichlet
1003 [ + - ][ + - ]: 30 : storeVecIfSpecd< std::size_t >(lua_ideck["ale"], "dirichlet",
[ - + ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
1004 : : ale_deck.get< tag::dirichlet >(), {});
1005 : :
1006 : : // Symmetry
1007 [ + - ][ + - ]: 30 : storeVecIfSpecd< std::size_t >(lua_ideck["ale"], "symmetry",
[ - + ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
1008 : : ale_deck.get< tag::symmetry >(), {});
1009 : :
1010 : : // Move sidesets with user defined function
1011 [ + - ][ + + ]: 10 : if (lua_ideck["ale"]["move"].valid()) {
1012 : : const sol::table& sol_mv = lua_ideck["ale"]["move"];
1013 [ + - ][ + - ]: 2 : ale_deck.get< tag::move >().resize(sol_mv.size());
1014 : :
1015 [ + + ]: 4 : for (std::size_t i=0; i<ale_deck.get< tag::move >().size(); ++i) {
1016 : : auto& mvi = ale_deck.get< tag::move >()[i];
1017 [ + - ][ + - ]: 6 : storeOptIfSpecd< tk::ctr::UserTableType, tk::ctr::UserTable >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1018 [ + - ]: 2 : sol_mv[i+1], "fntype", mvi.get< tag::fntype >(),
1019 : : tk::ctr::UserTableType::POSITION);
1020 [ + - ][ + - ]: 6 : storeVecIfSpecd< uint64_t >(
[ - + ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
1021 : : sol_mv[i+1], "sideset", mvi.get< tag::sideset >(), {});
1022 [ + - ][ + - ]: 6 : storeVecIfSpecd< tk::real >(
[ - + ][ - + ]
[ - - ][ - - ]
1023 : : sol_mv[i+1], "fn", mvi.get< tag::fn >(), {});
1024 : :
1025 : : // error checking on user-def function
1026 [ + - ]: 2 : if (mvi.get< tag::fn >().size() % 4 != 0)
1027 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Incomplete user-defined function for ALE sideset movement. An "
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1028 : : "R->R^3 function is expected, the number of descrete entries must be "
1029 : : "divisible by 4: one 'column' for the abscissa, and 3 for the "
1030 : : "ordinate.");
1031 : : }
1032 : : }
1033 : :
1034 : : // dv-CFL
1035 [ + - ][ + - ]: 30 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["ale"], "dvcfl", ale_deck.get< tag::dvcfl >(),
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1036 : : 0.01);
1037 : :
1038 : : // Vorticity multiplier
1039 [ + - ][ + - ]: 30 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["ale"], "vortmult",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1040 : : ale_deck.get< tag::vortmult >(), 0.0);
1041 : :
1042 : : // Mesh velocity max iterations
1043 [ + - ][ + - ]: 30 : storeIfSpecd< std::size_t >(lua_ideck["ale"], "maxit",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1044 : : ale_deck.get< tag::maxit >(), 5);
1045 : :
1046 : : // Mesh velocity max iterations
1047 [ + - ][ + - ]: 30 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["ale"], "tolerance",
[ - + ][ - - ]
1048 : : ale_deck.get< tag::tolerance >(), 1e-2);
1049 : : }
1050 : :
1051 : : // AMR block
1052 : : // ---------------------------------------------------------------------------
1053 : 193 : gideck.get< tag::amr, tag::amr >() = false;
1054 [ + - ]: 193 : gideck.get< tag::amr, tag::maxlevels >() = 2; // this is needed for outref
1055 [ + - ][ + + ]: 193 : if (lua_ideck["amr"].valid()) {
1056 : : auto& amr_deck = gideck.get< tag::amr >();
1057 [ + - ]: 20 : amr_deck.get< tag::amr >() = true;
1058 : :
1059 : : // Initial refinement toggle
1060 [ + - ][ + - ]: 60 : storeIfSpecd< bool >(lua_ideck["amr"], "t0ref", amr_deck.get< tag::t0ref >(),
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1061 : : false);
1062 : :
1063 : : // Mesh refinement during time-stepping toggle
1064 [ + - ][ + - ]: 60 : storeIfSpecd< bool >(lua_ideck["amr"], "dtref", amr_deck.get< tag::dtref >(),
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1065 : : false);
1066 : :
1067 : : // Uniform mesh refinement during time-stepping toggle
1068 [ + - ][ + - ]: 60 : storeIfSpecd< bool >(lua_ideck["amr"], "dtref_uniform",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1069 : : amr_deck.get< tag::dtref_uniform >(), false);
1070 : :
1071 : : // Mesh refinement frequency during time-stepping toggle
1072 [ + - ][ + - ]: 60 : storeIfSpecd< std::size_t >(lua_ideck["amr"], "dtfreq",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1073 : : amr_deck.get< tag::dtfreq >(), 3);
1074 : :
1075 : : // Maximum AMR levels
1076 [ + - ][ + - ]: 60 : storeIfSpecd< std::size_t >(lua_ideck["amr"], "maxlevels",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1077 : : amr_deck.get< tag::maxlevels >(), 2);
1078 : :
1079 : : // Initial AMR steps
1080 [ + - ][ + - ]: 60 : storeOptVecIfSpecd< inciter::ctr::AMRInitialType, inciter::ctr::AMRInitial >(
[ - + ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
1081 : : lua_ideck["amr"], "initial", amr_deck.get< tag::initial >(), {});
1082 : :
1083 : : // Initial AMR coordinate based
1084 [ + - ][ + + ]: 20 : if (lua_ideck["amr"]["coords"].valid()) {
1085 : : auto rmax = std::numeric_limits< tk::real >::max() / 100;
1086 : :
1087 [ + - ][ + - ]: 3 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["amr"]["coords"], "xminus",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1088 : : amr_deck.get< tag::coords, tag::xminus >(), rmax);
1089 [ + - ][ + - ]: 3 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["amr"]["coords"], "xplus",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1090 : : amr_deck.get< tag::coords, tag::xplus >(), -rmax);
1091 : :
1092 [ + - ][ + - ]: 3 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["amr"]["coords"], "yminus",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1093 : : amr_deck.get< tag::coords, tag::yminus >(), rmax);
1094 [ + - ][ + - ]: 3 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["amr"]["coords"], "yplus",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1095 : : amr_deck.get< tag::coords, tag::yplus >(), -rmax);
1096 : :
1097 [ + - ][ + - ]: 3 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["amr"]["coords"], "zminus",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1098 : : amr_deck.get< tag::coords, tag::zminus >(), rmax);
1099 [ + - ][ + - ]: 3 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["amr"]["coords"], "zplus",
[ - + ][ - - ]
1100 : : amr_deck.get< tag::coords, tag::zplus >(), -rmax);
1101 : : }
1102 : :
1103 : : // Initial AMR edgelist based
1104 [ + - ][ + - ]: 60 : storeVecIfSpecd< std::size_t >(lua_ideck["amr"], "edgelist",
[ - + ][ - + ]
[ - - ]
1105 : : amr_deck.get< tag::edgelist >(), {});
1106 [ - + ]: 20 : if (amr_deck.get< tag::edgelist >().size() % 2 != 0)
1107 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("The number of edge-nodes, marking edges as pairs of nodes, used "
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1108 : : "for explicit tagging of edges for initial mesh refineoment, is odd "
1109 : : "(it must be even).");
1110 : :
1111 : : // Error type for AMR
1112 [ + - ][ + - ]: 60 : storeOptIfSpecd< inciter::ctr::AMRErrorType, inciter::ctr::AMRError >(
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1113 : : lua_ideck["amr"], "error", amr_deck.get< tag::error >(),
1114 : : inciter::ctr::AMRErrorType::JUMP);
1115 : :
1116 : : // Tolerances for refine/de-refine
1117 [ + - ][ + - ]: 60 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["amr"], "tol_refine",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1118 : : amr_deck.get< tag::tol_refine >(), 0.2);
1119 [ + - ][ + - ]: 60 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["amr"], "tol_derefine",
[ - + ][ - - ]
1120 : : amr_deck.get< tag::tol_derefine >(), 0.05);
1121 : : }
1122 : :
1123 : : // p-refinement block
1124 : : // ---------------------------------------------------------------------------
1125 [ + - ]: 193 : gideck.get< tag::pref, tag::pref >() = false;
1126 [ + - ][ + + ]: 193 : if (lua_ideck["pref"].valid()) {
1127 : : auto& pref_deck = gideck.get< tag::pref >();
1128 [ + - ]: 12 : pref_deck.get< tag::pref >() = true;
1129 : :
1130 : : // p-ref indicator type
1131 : : storeOptIfSpecd< inciter::ctr::PrefIndicatorType,
1132 [ + - ][ + - ]: 36 : inciter::ctr::PrefIndicator >(lua_ideck["pref"], "indicator",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1133 : : pref_deck.get< tag::indicator >(),
1134 : : inciter::ctr::PrefIndicatorType::SPECTRAL_DECAY);
1135 : :
1136 : : // p-ref max degrees-of-freedom per cell
1137 [ + - ][ + - ]: 36 : storeIfSpecd< std::size_t >(lua_ideck["pref"], "ndofmax",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1138 : : pref_deck.get< tag::ndofmax >(), 10);
1139 : :
1140 : : // p-ref tolerance
1141 [ + - ][ + - ]: 36 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["pref"], "tolref",
[ - + ][ - - ]
1142 : : pref_deck.get< tag::tolref >(), 0.5);
1143 : :
1144 : : // error checking on the tolerance
1145 [ + - ][ - + ]: 12 : if (pref_deck.get< tag::tolref >() < 0.0 || pref_deck.get< tag::tolref >() > 1.0)
1146 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("The p-refinement tolerance must be a real number "
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1147 : : "between 0.0 and 1.0, both inclusive.");
1148 : : }
1149 : :
1150 : : // Boundary conditions block
1151 : : // ---------------------------------------------------------------------------
1152 [ + - ][ + + ]: 193 : if (lua_ideck["bc"].valid()) {
1153 : : std::set< std::size_t > totalmesh;
1154 : : const sol::table& sol_bc = lua_ideck["bc"];
1155 : : auto& bc_deck = gideck.get< tag::bc >();
1156 [ + - ][ + - ]: 143 : bc_deck.resize(sol_bc.size());
1157 : :
1158 [ + + ]: 287 : for (std::size_t i=0; i<bc_deck.size(); ++i) {
1159 : :
1160 [ + - ][ + - ]: 432 : checkBlock< inciter::ctr::bcList::Keys >(sol_bc[i+1], "bc");
[ + - ][ - + ]
[ - - ]
1161 : :
1162 [ + - ][ + - ]: 432 : storeVecIfSpecd< std::size_t >(sol_bc[i+1], "mesh",
[ + - ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
1163 [ + - ]: 144 : bc_deck[i].get< tag::mesh >(), {1});
1164 : : // collect meshes for error checking
1165 : : totalmesh.insert(bc_deck[i].get< tag::mesh >().begin(),
1166 : 144 : bc_deck[i].get< tag::mesh >().end());
1167 : :
1168 [ + - ][ + - ]: 432 : storeVecIfSpecd< uint64_t >(sol_bc[i+1], "dirichlet",
[ - + ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
1169 [ + - ]: 144 : bc_deck[i].get< tag::dirichlet >(), {});
1170 : :
1171 [ + - ][ + - ]: 432 : storeVecIfSpecd< uint64_t >(sol_bc[i+1], "symmetry",
[ - + ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
1172 [ + - ]: 144 : bc_deck[i].get< tag::symmetry >(), {});
1173 : :
1174 [ + - ][ + + ]: 144 : if (sol_bc[i+1]["inlet"].valid()) {
1175 : 9 : const sol::table& sol_inbc = sol_bc[i+1]["inlet"];
1176 [ + - ]: 9 : auto& inbc_deck = bc_deck[i].get< tag::inlet >();
1177 [ + - ][ + - ]: 9 : inbc_deck.resize(sol_inbc.size());
1178 : :
1179 [ + + ]: 18 : for (std::size_t j=0; j<inbc_deck.size(); ++j) {
1180 [ + - ][ + - ]: 27 : storeVecIfSpecd< uint64_t >(sol_inbc[j+1], "sideset",
[ + - ][ - + ]
[ - + ][ - - ]
1181 : : inbc_deck[j].get< tag::sideset >(), {});
1182 : :
1183 [ + - ][ + - ]: 27 : storeVecIfSpecd< tk::real >(sol_inbc[j+1], "velocity",
[ + - ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
[ - - ]
1184 [ + - ]: 9 : inbc_deck[j].get< tag::velocity >(), {0.0, 0.0, 0.0});
1185 [ - + ]: 9 : if (inbc_deck[j].get< tag::velocity >().size() != 3)
1186 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Inlet velocity requires 3 components.");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1187 : :
1188 [ + - ][ + - ]: 27 : storeIfSpecd< tk::real >(sol_inbc[j+1], "pressure",
[ - + ][ - - ]
1189 : : inbc_deck[j].get< tag::pressure >(), 0.0);
1190 : :
1191 [ + - ][ + - ]: 27 : storeIfSpecd< tk::real >(sol_inbc[j+1], "temperature",
[ - + ][ - - ]
1192 [ + - ]: 9 : inbc_deck[j].get< tag::temperature >(), 0.0);
1193 : :
1194 [ + - ][ + - ]: 27 : storeIfSpecd< std::size_t >(sol_inbc[j+1], "materialid",
[ - + ][ - - ]
1195 [ + - ]: 9 : inbc_deck[j].get< tag::materialid >(), 1);
1196 : : }
1197 : : }
1198 : :
1199 [ + - ][ + - ]: 432 : storeVecIfSpecd< uint64_t >(sol_bc[i+1], "outlet",
[ - + ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
1200 [ + - ]: 144 : bc_deck[i].get< tag::outlet >(), {});
1201 : :
1202 [ + - ][ + - ]: 432 : storeVecIfSpecd< uint64_t >(sol_bc[i+1], "farfield",
[ - + ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
1203 [ + - ]: 144 : bc_deck[i].get< tag::farfield >(), {});
1204 : :
1205 [ + - ][ + - ]: 432 : storeVecIfSpecd< uint64_t >(sol_bc[i+1], "extrapolate",
[ - + ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
1206 [ + - ]: 144 : bc_deck[i].get< tag::extrapolate >(), {});
1207 : :
1208 [ + - ][ + - ]: 432 : storeVecIfSpecd< uint64_t >(sol_bc[i+1], "noslipwall",
[ - + ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
1209 [ + - ]: 144 : bc_deck[i].get< tag::noslipwall >(), {});
1210 : :
1211 : : // Time-dependent BC
1212 [ + - ][ + + ]: 144 : if (sol_bc[i+1]["timedep"].valid()) {
1213 : 2 : const sol::table& sol_tdbc = sol_bc[i+1]["timedep"];
1214 [ + - ]: 2 : auto& tdbc_deck = bc_deck[i].get< tag::timedep >();
1215 [ + - ][ + - ]: 2 : tdbc_deck.resize(sol_tdbc.size());
1216 : :
1217 [ + + ]: 4 : for (std::size_t j=0; j<tdbc_deck.size(); ++j) {
1218 [ + - ][ + - ]: 6 : storeVecIfSpecd< uint64_t >(sol_tdbc[j+1], "sideset",
[ + - ][ - + ]
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1219 : : tdbc_deck[j].get< tag::sideset >(), {});
1220 [ + - ][ + - ]: 6 : storeVecIfSpecd< tk::real >(sol_tdbc[j+1], "fn",
[ - + ][ - + ]
[ - - ][ - - ]
1221 [ + - ]: 2 : tdbc_deck[j].get< tag::fn >(), {});
1222 : :
1223 : : // error checking on user-def function
1224 [ + - ]: 2 : if (tdbc_deck[j].get< tag::fn >().size() % 6 != 0)
1225 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Incomplete user-defined function for time-dependent BC. An "
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1226 : : "R->R^5 function is expected, the number of descrete entries must "
1227 : : "be divisible by 6: one 'column' for the abscissa, and 5 for the "
1228 : : "ordinate.");
1229 : : }
1230 : : }
1231 : :
1232 : : // Stagnation point
1233 [ + - ][ + - ]: 432 : storeVecIfSpecd< tk::real >(sol_bc[i+1], "stag_point",
[ - + ][ - + ]
[ - - ]
1234 [ + - ]: 144 : bc_deck[i].get< tag::stag_point >(), {});
1235 [ + + ]: 144 : if (!bc_deck[i].get< tag::stag_point >().empty() &&
1236 [ + - ]: 1 : bc_deck[i].get< tag::stag_point >().size() % 3 != 0)
1237 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("BC stagnation point requires 3 coordinate values for each "
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1238 : : "point. Thus, this vector must be divisible by 3.");
1239 : :
1240 : : // Stagnation radius
1241 [ + - ][ + - ]: 432 : storeIfSpecd< tk::real >(sol_bc[i+1], "radius",
[ - + ][ - - ]
1242 : : bc_deck[i].get< tag::radius >(), 0.0);
1243 : :
1244 : : // Velocity for inlet/farfield
1245 [ + - ][ + - ]: 432 : storeVecIfSpecd< tk::real >(sol_bc[i+1], "velocity",
[ + - ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
1246 [ + - ]: 144 : bc_deck[i].get< tag::velocity >(), {0.0, 0.0, 0.0});
1247 [ - + ]: 144 : if (bc_deck[i].get< tag::velocity >().size() != 3)
1248 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("BC velocity requires 3 components.");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1249 : :
1250 : : // Pressure for inlet/outlet/farfield
1251 [ + - ][ + - ]: 432 : storeIfSpecd< tk::real >(sol_bc[i+1], "pressure",
[ - + ][ - - ]
1252 : : bc_deck[i].get< tag::pressure >(), 0.0);
1253 : :
1254 : : // Density for inlet/outlet/farfield
1255 [ + - ][ + - ]: 432 : storeIfSpecd< tk::real >(sol_bc[i+1], "density",
[ - + ][ - - ]
1256 [ + - ]: 144 : bc_deck[i].get< tag::density >(), 0.0);
1257 : :
1258 : : // Temperature for inlet/outlet/farfield
1259 [ + - ][ + - ]: 432 : storeIfSpecd< tk::real >(sol_bc[i+1], "temperature",
[ - + ][ - - ]
1260 [ + - ]: 144 : bc_deck[i].get< tag::temperature >(), 0.0);
1261 : :
1262 : : // Mass fractions for inlet/farfield
1263 [ + - ][ + - ]: 432 : storeVecIfSpecd< tk::real >(sol_bc[i+1], "mass_fractions",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1264 [ + - ]: 144 : bc_deck[i].get< tag::mass_fractions >(),
1265 [ + - ][ - - ]: 144 : std::vector< tk::real >(nspec, 1.0/static_cast<tk::real>(nspec)));
1266 [ - + ]: 144 : if (bc_deck[i].get< tag::mass_fractions >().size() != nspec)
1267 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("BC mass fraction has incorrect number of species. "
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
1268 : : "Expected " + std::to_string(nspec));
1269 : :
1270 : : // Material-id for inlet/outlet/farfield
1271 [ + - ][ + - ]: 432 : storeIfSpecd< std::size_t >(sol_bc[i+1], "materialid",
[ - + ][ - - ]
1272 : : bc_deck[i].get< tag::materialid >(), 1);
1273 : : }
1274 : :
1275 : : // error checking on number of meshes
1276 [ - + ]: 143 : if (totalmesh.size() != gideck.get< tag::mesh >().size())
1277 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Total meshes (" + std::to_string(gideck.get< tag::mesh >().size()) +
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1278 : : ") not equal to the meshes on which BC's are specified (" +
1279 : : std::to_string(totalmesh.size()));
1280 : :
1281 : : // error checking on mesh ids
1282 : : std::size_t ic(1);
1283 [ + + ]: 287 : for (const auto& im : totalmesh) {
1284 [ - + ][ - - ]: 144 : if (im != ic) Throw("Non-contiguous mesh ids in BC-mesh");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
1285 : 144 : ++ic;
1286 : : }
1287 : : }
1288 [ + + ][ - + ]: 50 : else if (gideck.get< tag::scheme >() == inciter::ctr::SchemeType::ALECG ||
1289 : : gideck.get< tag::scheme >() == inciter::ctr::SchemeType::OversetFE)
1290 [ + - ]: 50 : gideck.get< tag::bc >().resize(1);
1291 : : // error checking for unspecified BC's
1292 : : else
1293 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("No boundary conditions specified in input file.");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1294 : :
1295 : : // Initial condition block
1296 : : // ---------------------------------------------------------------------------
1297 [ + - ][ + + ]: 193 : if (lua_ideck["ic"].valid()) {
1298 : : auto& ic_deck = gideck.get< tag::ic >();
1299 : :
1300 [ + - ][ + - ]: 45 : checkBlock< inciter::ctr::icList::Keys >(lua_ideck["ic"], "ic");
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1301 : :
1302 : : // background IC values
1303 [ + - ][ + - ]: 45 : storeIfSpecd< std::size_t >(lua_ideck["ic"], "materialid",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1304 : : ic_deck.get< tag::materialid >(), 1);
1305 : :
1306 [ + - ][ + - ]: 45 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["ic"], "pressure",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1307 : : ic_deck.get< tag::pressure >(), 0.0);
1308 : :
1309 [ + - ][ + - ]: 45 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["ic"], "temperature",
[ - + ][ - - ]
1310 : : ic_deck.get< tag::temperature >(), 0.0);
1311 : :
1312 [ + - ][ + - ]: 45 : storeVecIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["ic"], "mass_fractions",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1313 : : ic_deck.get< tag::mass_fractions >(),
1314 [ + - ]: 15 : std::vector< tk::real >(nspec, 1.0/static_cast<tk::real>(nspec)));
1315 [ - + ]: 15 : if (ic_deck.get< tag::mass_fractions >().size() != nspec)
1316 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("IC mass fraction has incorrect number of species. "
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
1317 : : "Expected " + std::to_string(nspec));
1318 : :
1319 [ + - ][ + - ]: 45 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["ic"], "density",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1320 : : ic_deck.get< tag::density >(), 0.0);
1321 : :
1322 [ + - ][ + - ]: 45 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["ic"], "energy",
[ - + ][ - - ]
1323 : : ic_deck.get< tag::energy >(), 0.0);
1324 : :
1325 [ + - ][ + - ]: 45 : storeVecIfSpecd< tk::real >(lua_ideck["ic"], "velocity",
[ + - ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
1326 : : ic_deck.get< tag::velocity >(), {0.0, 0.0, 0.0});
1327 [ - + ]: 15 : if (ic_deck.get< tag::velocity >().size() != 3)
1328 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Velocity in IC requires 3 components.");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1329 : :
1330 : : // IC box
1331 [ + - ][ + + ]: 15 : if (lua_ideck["ic"]["box"].valid()) {
1332 : : const sol::table& lua_box = lua_ideck["ic"]["box"];
1333 : : auto& box_deck = ic_deck.get< tag::box >();
1334 [ + - ][ + - ]: 8 : box_deck.resize(lua_box.size());
1335 : :
1336 [ + + ]: 17 : for (std::size_t i=0; i<box_deck.size(); ++i) {
1337 : :
1338 [ + - ][ + - ]: 27 : checkBlock< inciter::ctr::boxList::Keys >(lua_box[i+1], "box");
[ + - ][ - + ]
[ - - ]
1339 : :
1340 [ + - ][ + - ]: 27 : storeIfSpecd< std::size_t >(lua_box[i+1], "materialid",
[ - + ][ - - ]
1341 [ + - ]: 9 : box_deck[i].get< tag::materialid >(), 1);
1342 : :
1343 [ + - ][ + - ]: 27 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_box[i+1], "volume",
[ - + ][ - - ]
1344 [ + - ]: 9 : box_deck[i].get< tag::volume >(), 0.0);
1345 : :
1346 [ + - ][ + - ]: 27 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_box[i+1], "mass",
[ - + ][ - - ]
1347 [ + - ]: 9 : box_deck[i].get< tag::mass >(), 0.0);
1348 : :
1349 [ + - ][ + - ]: 27 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_box[i+1], "density",
[ - + ][ - - ]
1350 [ + - ]: 9 : box_deck[i].get< tag::density >(), 0.0);
1351 : :
1352 [ + - ][ + - ]: 27 : storeVecIfSpecd< tk::real >(lua_box[i+1], "velocity",
[ + - ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
1353 [ + - ]: 9 : box_deck[i].get< tag::velocity >(), {0.0, 0.0, 0.0});
1354 [ - + ]: 9 : if (box_deck[i].get< tag::velocity >().size() != 3)
1355 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Velocity in IC box requires 3 components.");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1356 : :
1357 [ + - ][ + - ]: 27 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_box[i+1], "pressure",
[ - + ][ - - ]
1358 : : box_deck[i].get< tag::pressure >(), 0.0);
1359 : :
1360 [ + - ][ + - ]: 27 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_box[i+1], "energy",
[ - + ][ - - ]
1361 [ + - ]: 9 : box_deck[i].get< tag::energy >(), 0.0);
1362 : :
1363 [ + - ][ + - ]: 27 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_box[i+1], "energy_content",
[ - + ][ - - ]
1364 [ + - ]: 9 : box_deck[i].get< tag::energy_content >(), 0.0);
1365 : :
1366 [ + - ][ + - ]: 27 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_box[i+1], "temperature",
[ - + ][ - - ]
1367 [ + - ]: 9 : box_deck[i].get< tag::temperature >(), 0.0);
1368 : :
1369 [ + - ][ + - ]: 27 : storeVecIfSpecd< tk::real >(lua_box[i+1], "mass_fractions",
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1370 [ + - ]: 9 : box_deck[i].get< tag::mass_fractions >(),
1371 [ + - ]: 9 : std::vector< tk::real >(nspec, 1.0/static_cast<tk::real>(nspec)));
1372 [ - + ]: 9 : if (box_deck[i].get< tag::mass_fractions >().size() != nspec)
1373 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("IC box mass fraction has incorrect number of species. "
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
1374 : : "Expected " + std::to_string(nspec));
1375 : :
1376 [ + - ][ + - ]: 27 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_box[i+1], "xmin",
[ - + ][ - - ]
1377 : : box_deck[i].get< tag::xmin >(), 0.0);
1378 : :
1379 [ + - ][ + - ]: 27 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_box[i+1], "xmax",
[ - + ][ - - ]
1380 [ + - ]: 9 : box_deck[i].get< tag::xmax >(), 0.0);
1381 : :
1382 [ + - ][ + - ]: 27 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_box[i+1], "ymin",
[ - + ][ - - ]
1383 [ + - ]: 9 : box_deck[i].get< tag::ymin >(), 0.0);
1384 : :
1385 [ + - ][ + - ]: 27 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_box[i+1], "ymax",
[ - + ][ - - ]
1386 [ + - ]: 9 : box_deck[i].get< tag::ymax >(), 0.0);
1387 : :
1388 [ + - ][ + - ]: 27 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_box[i+1], "zmin",
[ - + ][ - - ]
1389 [ + - ]: 9 : box_deck[i].get< tag::zmin >(), 0.0);
1390 : :
1391 [ + - ][ + - ]: 27 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_box[i+1], "zmax",
[ - + ][ - - ]
1392 [ + - ]: 9 : box_deck[i].get< tag::zmax >(), 0.0);
1393 : :
1394 [ + - ][ + - ]: 27 : storeVecIfSpecd< tk::real >(lua_box[i+1], "orientation",
[ + - ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
1395 [ + - ]: 9 : box_deck[i].get< tag::orientation >(), {0.0, 0.0, 0.0});
1396 [ - + ]: 9 : if (box_deck[i].get< tag::orientation >().size() != 3)
1397 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Orientation in IC box requires 3 rotation angles.");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1398 : :
1399 [ + - ][ + - ]: 27 : storeOptIfSpecd< inciter::ctr::InitiateType, inciter::ctr::Initiate >(
[ - + ][ - - ]
1400 : : lua_box[i+1], "initiate", box_deck[i].get< tag::initiate >(),
1401 : : inciter::ctr::InitiateType::IMPULSE);
1402 : :
1403 [ + - ][ + - ]: 27 : storeVecIfSpecd< tk::real >(lua_box[i+1], "point",
[ + - ][ - + ]
[ + - ][ - - ]
[ - - ]
1404 [ + - ]: 9 : box_deck[i].get< tag::point >(), {0.0, 0.0, 0.0});
1405 [ - + ]: 9 : if (box_deck[i].get< tag::point >().size() != 3)
1406 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Point in IC box requires 3 coordinates.");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1407 : :
1408 [ + - ][ + - ]: 27 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_box[i+1], "init_time",
[ - + ][ - - ]
1409 : : box_deck[i].get< tag::init_time >(), 0.0);
1410 : :
1411 [ + - ][ + - ]: 27 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_box[i+1], "front_width",
[ - + ][ - - ]
1412 [ + - ]: 9 : box_deck[i].get< tag::front_width >(), 0.0);
1413 : :
1414 [ + - ][ + - ]: 27 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_box[i+1], "front_speed",
[ - + ][ - - ]
1415 [ + - ]: 9 : box_deck[i].get< tag::front_speed >(), 0.0);
1416 : : }
1417 : : }
1418 : :
1419 : : // IC mesh-block
1420 [ + - ][ - + ]: 15 : if (lua_ideck["ic"]["meshblock"].valid()) {
1421 : : const sol::table& lua_meshblock = lua_ideck["ic"]["meshblock"];
1422 : : auto& mblk_deck = ic_deck.get< tag::meshblock >();
1423 [ - - ][ - - ]: 0 : mblk_deck.resize(lua_meshblock.size());
1424 : :
1425 [ - - ]: 0 : for (std::size_t i=0; i<mblk_deck.size(); ++i) {
1426 : :
1427 [ - - ][ - - ]: 0 : checkBlock< inciter::ctr::meshblockList::Keys >(lua_meshblock[i+1],
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
1428 : : "meshblock");
1429 : :
1430 [ - - ][ - - ]: 0 : storeIfSpecd< std::size_t >(lua_meshblock[i+1], "blockid",
[ - - ][ - - ]
1431 [ - - ]: 0 : mblk_deck[i].get< tag::blockid >(), 0);
1432 [ - - ]: 0 : if (mblk_deck[i].get< tag::blockid >() == 0)
1433 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Each IC mesh block must specify the mesh block id.");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1434 : :
1435 [ - - ][ - - ]: 0 : storeIfSpecd< std::size_t >(lua_meshblock[i+1], "materialid",
[ - - ][ - - ]
1436 : : mblk_deck[i].get< tag::materialid >(), 1);
1437 : :
1438 [ - - ][ - - ]: 0 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_meshblock[i+1], "energy_content",
[ - - ][ - - ]
1439 [ - - ]: 0 : mblk_deck[i].get< tag::energy_content >(), 0.0);
1440 : :
1441 [ - - ][ - - ]: 0 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_meshblock[i+1], "volume",
[ - - ][ - - ]
1442 [ - - ]: 0 : mblk_deck[i].get< tag::volume >(), 0.0);
1443 [ - - ]: 0 : if (mblk_deck[i].get< tag::energy_content >() > 0.0 &&
1444 [ - - ]: 0 : mblk_deck[i].get< tag::volume >() < 1e-12)
1445 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Mesh block volume must be specified, if energy content is "
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1446 : : "used to initialize block");
1447 : :
1448 [ - - ][ - - ]: 0 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_meshblock[i+1], "mass",
[ - - ][ - - ]
1449 : : mblk_deck[i].get< tag::mass >(), 0.0);
1450 : :
1451 [ - - ][ - - ]: 0 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_meshblock[i+1], "density",
[ - - ][ - - ]
1452 [ - - ]: 0 : mblk_deck[i].get< tag::density >(), 0.0);
1453 : :
1454 [ - - ][ - - ]: 0 : storeVecIfSpecd< tk::real >(lua_meshblock[i+1], "velocity",
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1455 [ - - ]: 0 : mblk_deck[i].get< tag::velocity >(), {0.0, 0.0, 0.0});
1456 [ - - ]: 0 : if (mblk_deck[i].get< tag::velocity >().size() != 3)
1457 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Velocity in IC meshblock requires 3 components.");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1458 : :
1459 [ - - ][ - - ]: 0 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_meshblock[i+1], "pressure",
[ - - ][ - - ]
1460 : : mblk_deck[i].get< tag::pressure >(), 0.0);
1461 : :
1462 [ - - ][ - - ]: 0 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_meshblock[i+1], "energy",
[ - - ][ - - ]
1463 [ - - ]: 0 : mblk_deck[i].get< tag::energy >(), 0.0);
1464 : :
1465 [ - - ][ - - ]: 0 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_meshblock[i+1], "temperature",
[ - - ][ - - ]
1466 [ - - ]: 0 : mblk_deck[i].get< tag::temperature >(), 0.0);
1467 : :
1468 [ - - ][ - - ]: 0 : storeVecIfSpecd< tk::real >(lua_meshblock[i+1], "mass_fractions",
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
1469 [ - - ]: 0 : mblk_deck[i].get< tag::mass_fractions >(),
1470 [ - - ]: 0 : std::vector< tk::real >(nspec, 1.0/static_cast<tk::real>(nspec)));
1471 [ - - ]: 0 : if (mblk_deck[i].get< tag::mass_fractions >().size() != nspec)
1472 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("IC meshblock mass fraction has incorrect number of species. "
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
1473 : : "Expected " + std::to_string(nspec));
1474 : :
1475 [ - - ][ - - ]: 0 : storeOptIfSpecd< inciter::ctr::InitiateType, inciter::ctr::Initiate >(
[ - - ][ - - ]
1476 : : lua_meshblock[i+1], "initiate", mblk_deck[i].get< tag::initiate >(),
1477 : : inciter::ctr::InitiateType::IMPULSE);
1478 : :
1479 [ - - ][ - - ]: 0 : storeVecIfSpecd< tk::real >(lua_meshblock[i+1], "point",
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
1480 [ - - ]: 0 : mblk_deck[i].get< tag::point >(), {0.0, 0.0, 0.0});
1481 [ - - ]: 0 : if (mblk_deck[i].get< tag::point >().size() != 3)
1482 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Point in IC meshblock requires 3 coordinates.");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1483 : :
1484 [ - - ][ - - ]: 0 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_meshblock[i+1], "init_time",
[ - - ][ - - ]
1485 : : mblk_deck[i].get< tag::init_time >(), 0.0);
1486 : :
1487 [ - - ][ - - ]: 0 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_meshblock[i+1], "front_width",
[ - - ][ - - ]
1488 [ - - ]: 0 : mblk_deck[i].get< tag::front_width >(), 0.0);
1489 : :
1490 [ - - ][ - - ]: 0 : storeIfSpecd< tk::real >(lua_meshblock[i+1], "front_speed",
[ - - ][ - - ]
1491 [ - - ]: 0 : mblk_deck[i].get< tag::front_speed >(), 0.0);
1492 : : }
1493 : : }
1494 : : }
1495 : : else {
1496 : : // TODO: remove double-specification of defaults
1497 : : auto& ic_deck = gideck.get< tag::ic >();
1498 : 178 : ic_deck.get< tag::materialid >() = 1;
1499 : 178 : ic_deck.get< tag::pressure >() = 0.0;
1500 : 178 : ic_deck.get< tag::temperature >() = 1.0;
1501 : 178 : ic_deck.get< tag::density >() = 0.0;
1502 : 178 : ic_deck.get< tag::energy >() = 0.0;
1503 [ + - ]: 178 : ic_deck.get< tag::velocity >() = {0.0, 0.0, 0.0};
1504 : : ic_deck.get< tag::mass_fractions >() =
1505 [ + - ]: 356 : std::vector< tk::real >(nspec, 1.0/static_cast<tk::real>(nspec));
1506 : : }
1507 : 193 : }
1508 : :
1509 : : void
1510 : 404 : LuaParser::checkStoreMatProp(
1511 : : const sol::table table,
1512 : : const std::string key,
1513 : : std::size_t vecsize,
1514 : : std::vector< tk::real >& storage )
1515 : : // *****************************************************************************
1516 : : // Check and store material property into inpudeck storage
1517 : : //! \param[in] table Sol-table which contains said property
1518 : : //! \param[in] key Key for said property in Sol-table
1519 : : //! \param[in] vecsize Number of said property in Sol-table (based on number of
1520 : : //! materials that are of the same eos type
1521 : : //! \param[in,out] storage Storage space in inputdeck where said property is
1522 : : //! to be stored
1523 : : // *****************************************************************************
1524 : : {
1525 : : // check validity of table
1526 [ + - ][ - + ]: 808 : if (!table[key].valid())
1527 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Material property '" + key + "' not specified");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1528 [ + - ][ - + ]: 808 : if (sol::table(table[key]).size() != vecsize)
[ - + ][ - - ]
1529 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Incorrect number of '" + key + "'s specified. Expected " +
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
1530 : : std::to_string(vecsize));
1531 : :
1532 : : // store values from table to inputdeck
1533 [ + - ][ - + ]: 808 : storeVecIfSpecd< tk::real >(table, key, storage,
[ + - ][ - - ]
[ - - ]
1534 [ + - ]: 404 : std::vector< tk::real >(vecsize, 0.0));
1535 : 404 : }
1536 : :
1537 : : void
1538 : 6 : LuaParser::checkStoreMatPropVec(
1539 : : const sol::table table,
1540 : : const std::string key,
1541 : : std::size_t nspec,
1542 : : std::size_t vecsize,
1543 : : std::vector<std::vector< tk::real >>& storage )
1544 : : // *****************************************************************************
1545 : : // Check and store material property vector into inpudeck storage
1546 : : //! \param[in] table Sol-table which contains said property
1547 : : //! \param[in] key Key for said property in Sol-table
1548 : : //! \param[in] nspec Number of species
1549 : : //! \param[in] vecsize Number of said property in Sol-table (based on number of
1550 : : //! coefficients for the defined species)
1551 : : //! \param[in,out] storage Storage space in inputdeck where said property is
1552 : : //! to be stored
1553 : : // *****************************************************************************
1554 : : {
1555 : : // check validity of table
1556 [ + - ][ - + ]: 12 : if (!table[key].valid())
1557 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Material property '" + key + "' not specified");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1558 [ + - ][ - + ]: 12 : if (sol::table(table[key]).size() != nspec)
[ - + ][ - - ]
1559 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Incorrect number of '" + key + "' vectors specified. Expected " +
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1560 : : std::to_string(nspec) + " vectors");
1561 : :
1562 : 6 : storage.resize(nspec);
1563 : :
1564 : : const auto& tableentry = table[key];
1565 [ + + ]: 15 : for (std::size_t k=0; k < nspec; k++) {
1566 [ + - ][ + - ]: 27 : if (sol::table(tableentry[k+1]).size() != vecsize)
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1567 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Incorrect number of '" + key + "' entries in vector of species "
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
1568 : : + std::to_string(k+1) + " specified. Expected " +
1569 : : std::to_string(vecsize));
1570 : :
1571 : : // store values from table to inputdeck
1572 [ + + ]: 45 : for (std::size_t i=0; i<vecsize; ++i)
1573 [ + - ][ + - ]: 72 : storage[k].push_back(tableentry[k+1][i+1]);
[ - + ][ - + ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
1574 : : }
1575 : 6 : }
1576 : :
1577 : : void
1578 : 6 : LuaParser::checkStoreMatPropVecVec(
1579 : : const sol::table table,
1580 : : const std::string key,
1581 : : std::size_t nspec,
1582 : : std::size_t vecsize1,
1583 : : std::size_t vecsize2,
1584 : : std::vector<std::vector<std::vector< tk::real >>>& storage )
1585 : : // *****************************************************************************
1586 : : // Check and store material property vector into inpudeck storage
1587 : : //! \param[in] table Sol-table which contains said property
1588 : : //! \param[in] key Key for said property in Sol-table
1589 : : //! \param[in] nspec Number of species
1590 : : //! \param[in] vecsize1 Outer number of said property in Sol-table (based on
1591 : : //! number of coefficients for the defined species)
1592 : : //! \param[in] vecsize2 Inner number of said property in Sol-table (based on
1593 : : //! number of coefficients for the defined species)
1594 : : //! \param[in,out] storage Storage space in inputdeck where said property is
1595 : : //! to be stored
1596 : : // *****************************************************************************
1597 : : {
1598 : : // check validity of table
1599 [ + - ][ - + ]: 12 : if (!table[key].valid())
1600 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Material property '" + key + "' not specified");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1601 [ + - ][ - + ]: 12 : if (sol::table(table[key]).size() != nspec)
[ - + ][ - - ]
1602 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Incorrect number of '" + key + "' vectors specified. Expected " +
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1603 : : std::to_string(nspec) + " vectors");
1604 : :
1605 : 6 : storage.resize(nspec);
1606 : :
1607 : : const auto& tableentry = table[key];
1608 [ + + ]: 15 : for (std::size_t k=0; k < nspec; k++) {
1609 [ + - ][ + - ]: 27 : if (sol::table(tableentry[k+1]).size() != vecsize1)
[ - + ][ + - ]
[ - - ]
1610 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Incorrect outer number of '" + key + "' entries in vector of species "
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
1611 : : + std::to_string(k+1) + " specified. Expected " +
1612 : : std::to_string(vecsize1));
1613 : :
1614 : : // store values from table to inputdeck
1615 [ + + ]: 36 : for (std::size_t i=0; i<vecsize1; ++i) {
1616 [ + - ][ + - ]: 81 : if (sol::table(tableentry[k+1][i+1]).size() != vecsize2)
[ - + ][ - + ]
[ - + ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1617 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("Incorrect inner number of '" + key + "' entries in vector of species "
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
1618 : : + std::to_string(k+1) + " specified. Expected " +
1619 : : std::to_string(vecsize2));
1620 : : std::vector< tk::real > temp_storage;
1621 [ + + ]: 243 : for (std::size_t j=0; j<vecsize2; j++)
1622 [ + - ][ + - ]: 432 : temp_storage.push_back(tableentry[k+1][i+1][j+1]);
[ - + ][ - + ]
[ - + ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
1623 [ + - ]: 27 : storage[k].push_back(temp_storage);
1624 : : }
1625 : : }
1626 : 6 : }
1627 : :
1628 : : void
1629 : 634 : LuaParser::addOutVar(
1630 : : const std::string& varname,
1631 : : const std::string& alias,
1632 : : std::vector< char >& depv,
1633 : : std::size_t nmat,
1634 : : std::size_t nspec,
1635 : : inciter::ctr::PDEType pde,
1636 : : tk::Centering c,
1637 : : std::vector< inciter::ctr::OutVar >& foutvar )
1638 : : // *****************************************************************************
1639 : : // Check and store field output variables
1640 : : //! \param[in] varname Name of variable requested
1641 : : //! \param[in] alias User specified alias for output
1642 : : //! \param[in] depv List of depvars
1643 : : //! \param[in] nmat Number of materials configured
1644 : : //! \param[in] nspec Number of species configured
1645 : : //! \param[in] pde Type of PDE configured
1646 : : //! \param[in] c Variable centering requested
1647 : : //! \param[in,out] foutvar Input deck storage where output vars are stored
1648 : : // *****************************************************************************
1649 : : {
1650 : : // index-based quantity specification
1651 : : // ----------------------------------
1652 [ + + ]: 634 : if (varname.length() == 2) {
1653 : 77 : auto qty = varname.at(0);
1654 [ + - ][ - + ]: 154 : auto j = std::stoul(std::string{varname.at(1)}) - 1;
1655 : :
1656 [ + + ]: 77 : if (pde == inciter::ctr::PDEType::MULTIMAT) {
1657 : : // multimat/matvar quantities
1658 [ - + ]: 28 : if (qty == 'D') { // density
1659 : : foutvar.emplace_back(
1660 [ - - ][ - - ]: 0 : inciter::ctr::OutVar(c, varname, alias, inciter::densityIdx(nmat,j)) );
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
1661 : : }
1662 [ + - ]: 28 : else if (qty == 'F') { // volume fraction
1663 : : foutvar.emplace_back(
1664 [ + - ][ + - ]: 28 : inciter::ctr::OutVar(c, varname, alias, inciter::volfracIdx(nmat,j)) );
[ + - ][ - + ]
[ - - ]
1665 : : }
1666 [ - - ]: 0 : else if (qty == 'M') { // momentum
1667 : : foutvar.emplace_back(
1668 [ - - ][ - - ]: 0 : inciter::ctr::OutVar(c, varname, alias, inciter::momentumIdx(nmat,j)) );
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
1669 : : }
1670 [ - - ]: 0 : else if (qty == 'E') { // specific total energy
1671 : : foutvar.emplace_back(
1672 [ - - ][ - - ]: 0 : inciter::ctr::OutVar(c, varname, alias, inciter::energyIdx(nmat,j)) );
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
1673 : : }
1674 [ - - ]: 0 : else if (qty == 'U') { // velocity (primitive)
1675 : : foutvar.emplace_back(
1676 [ - - ][ - - ]: 0 : inciter::ctr::OutVar(c, varname, alias, inciter::velocityIdx(nmat,j)) );
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
1677 : : }
1678 [ - - ]: 0 : else if (qty == 'P') { // material pressure (primitive)
1679 : : foutvar.emplace_back(
1680 [ - - ][ - - ]: 0 : inciter::ctr::OutVar(c, varname, alias, inciter::pressureIdx(nmat,j)) );
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
1681 : : }
1682 : : else {
1683 : : // error out if incorrect matvar used
1684 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("field_output: matvar " + varname + " not found");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1685 : : }
1686 : : }
1687 [ + + ]: 49 : else if (pde == inciter::ctr::PDEType::MULTISPECIES) {
1688 : : // multispecies/matvar quantities
1689 [ + - ]: 12 : if (qty == 'D') { // density
1690 : : foutvar.emplace_back(
1691 [ + - ][ + - ]: 24 : inciter::ctr::OutVar(c, varname, alias,
[ - + ][ - - ]
1692 [ + - ]: 12 : inciter::multispecies::densityIdx(nspec,j)) );
1693 : : }
1694 [ - - ]: 0 : else if (qty == 'M') { // momentum
1695 : : foutvar.emplace_back(
1696 [ - - ][ - - ]: 0 : inciter::ctr::OutVar(c, varname, alias,
[ - - ][ - - ]
1697 [ - - ]: 0 : inciter::multispecies::momentumIdx(nspec,j)) );
1698 : : }
1699 [ - - ]: 0 : else if (qty == 'E') { // specific total energy
1700 : : foutvar.emplace_back(
1701 [ - - ][ - - ]: 0 : inciter::ctr::OutVar(c, varname, alias,
[ - - ][ - - ]
1702 [ - - ]: 0 : inciter::multispecies::energyIdx(nspec,j)) );
1703 : : }
1704 : : else {
1705 : : // error out if incorrect matvar used
1706 [ - - ][ - - ]: 0 : Throw("field_output: matvar " + varname + " not found");
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
1707 : : }
1708 : : }
1709 : : else {
1710 : : // quantities specified by depvar
1711 [ + + ]: 84 : for (const auto& id : depv)
1712 [ + + ]: 47 : if (std::tolower(qty) == id) {
1713 [ + - ][ + - ]: 37 : foutvar.emplace_back( inciter::ctr::OutVar(c, varname, alias, j) );
[ + - ][ - + ]
[ - - ]
1714 : : }
1715 : : }
1716 : : }
1717 : : // analytic quantity specification
1718 : : // -------------------------------
1719 [ + + ]: 557 : else if (varname.find("analytic") != std::string::npos) {
1720 [ + - ][ + - ]: 58 : foutvar.emplace_back( inciter::ctr::OutVar(c, varname, alias, 0) );
[ + - ][ - + ]
[ - - ]
1721 : : }
1722 : : // name-based tensor quantity specification
1723 : : // ----------------------------------------
1724 [ - + ]: 499 : else if (varname.find("_tensor") != std::string::npos) {
1725 : : std::string namet(varname);
1726 : : // remove the "_tensor" from the varname
1727 [ - - ]: 0 : for (std::size_t i=0; i<7; ++i) namet.pop_back();
1728 : :
1729 [ - - ]: 0 : for (std::size_t i=1; i<=3; ++i) {
1730 [ - - ]: 0 : for (std::size_t j=1; j<=3; ++j) {
1731 [ - - ][ - - ]: 0 : std::string tij(namet + std::to_string(i) + std::to_string(j));
[ - - ][ - - ]
[ - - ][ - - ]
[ - - ]
1732 [ - - ][ - - ]: 0 : foutvar.emplace_back( inciter::ctr::OutVar(c, tij, alias, 0, tij) );
[ - - ][ - - ]
1733 : : }
1734 : : }
1735 : : }
1736 : : // name-based quantity specification
1737 : : // ---------------------------------
1738 : : else {
1739 [ + - ]: 499 : foutvar.emplace_back( inciter::ctr::OutVar(c, varname, alias, 0, varname) );
1740 : : }
1741 : 634 : }
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