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1 : : // ***************************************************************************** 2 : : /*! 3 : : \file src/PDE/Transport/Physics/CGAdvDiff.cpp 4 : : \copyright 2012-2015 J. Bakosi, 5 : : 2016-2018 Los Alamos National Security, LLC., 6 : : 2019-2021 Triad National Security, LLC. 7 : : All rights reserved. See the LICENSE file for details. 8 : : \brief Physics policy for the transport equations using continuous 9 : : Galerkin (CG) 10 : : \details This file defines a Physics policy class for the transport 11 : : equations, defined in PDE/Transport/CGTransport.h implementing 12 : : node-centered continuous Galerkin (CG) discretizations. 13 : : See PDE/Transport/Physics/CG.h for general requirements on Physics policy 14 : : classes for cg::Transport. 15 : : */ 16 : : // ***************************************************************************** 17 : : 18 : : #include "CGAdvDiff.hpp" 19 : : #include "Inciter/InputDeck/InputDeck.hpp" 20 : : 21 : : namespace inciter { 22 : : 23 : : extern ctr::InputDeck g_inputdeck; 24 : : 25 : : } // ::inciter 26 : : 27 : : using inciter::cg::TransportPhysicsAdvDiff; 28 : : 29 : : void 30 : 0 : TransportPhysicsAdvDiff::diffusionRhs( 31 : : ncomp_t ncomp, 32 : : tk::real deltat, 33 : : tk::real J, 34 : : const std::array< std::array< tk::real, 3 >, 4 >& grad, 35 : : const std::array< std::size_t, 4 >& N, 36 : : const std::vector< std::array< tk::real, 4 > >& u, 37 : : const std::vector< const tk::real* >& r, 38 : : tk::Fields& R ) const 39 : : // ***************************************************************************** 40 : : // Add diffusion contribution to rhs 41 : : //! \param[in] ncomp Number of components in this PDE 42 : : //! \param[in] deltat Size of time step 43 : : //! \param[in] J Element Jacobi determinant 44 : : //! \param[in] grad Shape function derivatives, nnode*ndim [4][3] 45 : : //! \param[in] N Element node indices 46 : : //! \param[in] u Solution at element nodes at recent time step 47 : : //! \param[in] r Pointers to right hand side at component 48 : : //! \param[in,out] R Right-hand side vector contributing to 49 : : // ***************************************************************************** 50 : : { 51 : : // diffusivities for all components 52 [ - - ]: 0 : auto diff = g_inputdeck.get< eq, tag::diffusivity >(); 53 : : 54 : : // add diffusion contribution to right hand side 55 : 0 : const auto d = deltat * J/6.0; 56 [ - - ]: 0 : for (std::size_t a=0; a<4; ++a) 57 [ - - ]: 0 : for (ncomp_t c=0; c<ncomp; ++c) 58 [ - - ]: 0 : for (std::size_t k=0; k<3; ++k) { 59 : 0 : const auto D = diff[ 3*c+k ]; 60 [ - - ]: 0 : for (std::size_t b=0; b<4; ++b) 61 [ - - ]: 0 : R.var(r[c],N[a]) -= d * D * grad[a][k] * grad[b][k] * u[c][b]; 62 : : } 63 : 0 : } 64 : : 65 : : tk::real 66 : 0 : TransportPhysicsAdvDiff::diffusion_dt( 67 : : ncomp_t ncomp, 68 : : tk::real L, 69 : : const std::vector< std::array< tk::real, 4 > >& ) const 70 : : // ***************************************************************************** 71 : : //! Compute the minimum time step size based on the diffusion 72 : : //! \param[in] ncomp Number of components in this PDE 73 : : //! \param[in] L Characteristic length scale 74 : : //! \return Minimum time step size based on diffusion 75 : : // ***************************************************************************** 76 : : { 77 : : // diffusivities for all components 78 [ - - ]: 0 : auto df = g_inputdeck.get< eq, tag::diffusivity >(); 79 : : 80 : : // compute the minimum diffusion time step size across the four nodes 81 : 0 : tk::real mindt = std::numeric_limits< tk::real >::max(); 82 [ - - ]: 0 : for (ncomp_t c=0; c<ncomp; ++c) { 83 : 0 : const auto di = 3*c; 84 : 0 : const auto d = std::max( df[di+2], std::max( df[di+0], df[di+1] ) ); 85 : 0 : const auto dt = L * L / (2.0*d); // dt ~ dx^2/(2D) 86 [ - - ]: 0 : if (dt < mindt) mindt = dt; 87 : : } 88 : : 89 : 0 : return mindt; 90 : : } 91 : :