Quinoa all test code coverage report
Current view: top level - PDE/MultiSpecies - MiscMultiSpeciesFns.cpp (source / functions) Hit Total Coverage
Commit: -128-NOTFOUND Lines: 8 57 14.0 %
Date: 2024-12-11 15:55:14 Functions: 1 2 50.0 %
Legend: Lines: hit not hit | Branches: + taken - not taken # not executed Branches: 3 58 5.2 %

           Branch data     Line data    Source code
       1                 :            : // *****************************************************************************
       2                 :            : /*!
       3                 :            :   \file      src/PDE/MultiSpecies/MiscMultiSpeciesFns.hpp
       4                 :            :   \copyright 2012-2015 J. Bakosi,
       5                 :            :              2016-2018 Los Alamos National Security, LLC.,
       6                 :            :              2019-2021 Triad National Security, LLC.
       7                 :            :              All rights reserved. See the LICENSE file for details.
       8                 :            :   \brief     Misc multi-species system functions
       9                 :            :   \details   This file defines functions that required for multi-species
      10                 :            :     compressible fluid dynamics.
      11                 :            : */
      12                 :            : // *****************************************************************************
      13                 :            : 
      14                 :            : #include <iostream>
      15                 :            : 
      16                 :            : #include "MiscMultiSpeciesFns.hpp"
      17                 :            : #include "Inciter/InputDeck/InputDeck.hpp"
      18                 :            : #include "Integrate/Basis.hpp"
      19                 :            : #include "MultiSpecies/MultiSpeciesIndexing.hpp"
      20                 :            : #include "EoS/GetMatProp.hpp"
      21                 :            : 
      22                 :            : namespace inciter {
      23                 :            : 
      24                 :            : extern ctr::InputDeck g_inputdeck;
      25                 :            : 
      26                 :         12 : void initializeSpeciesEoS( std::vector< EOS >& mat_blk )
      27                 :            : // *****************************************************************************
      28                 :            : //  Initialize the species block with configured EOS
      29                 :            : //! \param[in,out] mat_blk Material block that gets initialized
      30                 :            : // *****************************************************************************
      31                 :            : {
      32                 :            :   // EoS initialization
      33                 :            :   // ---------------------------------------------------------------------------
      34                 :         12 :   auto nspec = g_inputdeck.get< tag::multispecies, tag::nspec >();
      35                 :         12 :   const auto& matprop = g_inputdeck.get< tag::material >();
      36                 :         12 :   const auto& matidxmap = g_inputdeck.get< tag::matidxmap >();
      37                 :            :   // assume only one type of species
      38                 :         12 :   auto mateos = matprop[matidxmap.get< tag::eosidx >()[0]].get<tag::eos>();
      39         [ +  + ]:         36 :   for (std::size_t k=0; k<nspec; ++k) {
      40         [ +  - ]:         24 :     mat_blk.emplace_back(mateos, EqType::multispecies, k);
      41                 :            :   }
      42                 :         12 : }
      43                 :            : 
      44                 :            : tk::real
      45                 :          0 : timeStepSizeMultiSpecies(
      46                 :            :   const std::vector< EOS >& mat_blk,
      47                 :            :   const std::vector< int >& esuf,
      48                 :            :   const tk::Fields& geoFace,
      49                 :            :   const tk::Fields& geoElem,
      50                 :            :   const std::size_t nelem,
      51                 :            :   std::size_t nspec,
      52                 :            :   const tk::Fields& U,
      53                 :            :   const tk::Fields& /*P*/ )
      54                 :            : // *****************************************************************************
      55                 :            : //  Time step restriction for multi species cell-centered schemes
      56                 :            : //! \param[in] mat_blk EOS species block
      57                 :            : //! \param[in] esuf Elements surrounding elements array
      58                 :            : //! \param[in] geoFace Face geometry array
      59                 :            : //! \param[in] geoElem Element geometry array
      60                 :            : //! \param[in] nelem Number of elements
      61                 :            : //! \param[in] nspec Number of speciess in this PDE system
      62                 :            : //! \param[in] U High-order solution vector
      63                 :            : // //! \param[in] P High-order vector of primitives
      64                 :            : //! \return Maximum allowable time step based on cfl criterion
      65                 :            : // *****************************************************************************
      66                 :            : {
      67                 :          0 :   const auto ndof = g_inputdeck.get< tag::ndof >();
      68                 :          0 :   const auto rdof = g_inputdeck.get< tag::rdof >();
      69                 :          0 :   std::size_t ncomp = U.nprop()/rdof;
      70                 :            : 
      71                 :            :   tk::real u, v, w, a, vn, dSV_l, dSV_r;
      72         [ -  - ]:          0 :   std::vector< tk::real > delt(U.nunk(), 0.0);
      73         [ -  - ]:          0 :   std::vector< tk::real > ugp(ncomp, 0.0);
      74                 :            : 
      75                 :            :   // compute maximum characteristic speed at all internal element faces
      76         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t f=0; f<esuf.size()/2; ++f)
      77                 :            :   {
      78                 :          0 :     std::size_t el = static_cast< std::size_t >(esuf[2*f]);
      79                 :          0 :     auto er = esuf[2*f+1];
      80                 :            : 
      81                 :            :     std::array< tk::real, 3 > fn;
      82         [ -  - ]:          0 :     fn[0] = geoFace(f,1);
      83         [ -  - ]:          0 :     fn[1] = geoFace(f,2);
      84         [ -  - ]:          0 :     fn[2] = geoFace(f,3);
      85                 :            : 
      86                 :            :     // left element
      87                 :            : 
      88                 :            :     // Compute the basis function for the left element
      89         [ -  - ]:          0 :     std::vector< tk::real > B_l(rdof, 0.0);
      90                 :          0 :     B_l[0] = 1.0;
      91                 :            : 
      92                 :            :     // get conserved quantities
      93         [ -  - ]:          0 :     ugp = eval_state(ncomp, rdof, ndof, el, U, B_l);
      94                 :            : 
      95                 :            :     // mixture density
      96                 :          0 :     tk::real rhob(0.0);
      97         [ -  - ]:          0 :     for (std::size_t k=0; k<nspec; ++k)
      98                 :          0 :       rhob += ugp[multispecies::densityIdx(nspec, k)];
      99                 :            : 
     100                 :            :     // advection velocity
     101                 :          0 :     u = ugp[multispecies::momentumIdx(nspec, 0)]/rhob;
     102                 :          0 :     v = ugp[multispecies::momentumIdx(nspec, 1)]/rhob;
     103                 :          0 :     w = ugp[multispecies::momentumIdx(nspec, 2)]/rhob;
     104                 :            : 
     105 [ -  - ][ -  - ]:          0 :     vn = u*geoFace(f,1) + v*geoFace(f,2) + w*geoFace(f,3);
                 [ -  - ]
     106                 :            : 
     107                 :            :     // acoustic speed
     108         [ -  - ]:          0 :     auto p = mat_blk[0].compute< EOS::pressure >( rhob, u, v, w,
     109                 :          0 :       ugp[multispecies::energyIdx(nspec, 0)] );
     110         [ -  - ]:          0 :     a = mat_blk[0].compute< EOS::soundspeed >( rhob, p );
     111                 :            : 
     112         [ -  - ]:          0 :     dSV_l = geoFace(f,0) * (std::fabs(vn) + a);
     113                 :            : 
     114                 :            :     // right element
     115         [ -  - ]:          0 :     if (er > -1) {
     116                 :          0 :       std::size_t eR = static_cast< std::size_t >( er );
     117                 :            : 
     118                 :            :       // Compute the basis function for the right element
     119         [ -  - ]:          0 :       std::vector< tk::real > B_r(rdof, 0.0);
     120                 :          0 :       B_r[0] = 1.0;
     121                 :            : 
     122                 :            :       // get conserved quantities
     123         [ -  - ]:          0 :       ugp = eval_state( ncomp, rdof, ndof, eR, U, B_r);
     124                 :            : 
     125                 :            :       // mixture density
     126                 :          0 :       rhob = 0.0;
     127         [ -  - ]:          0 :       for (std::size_t k=0; k<nspec; ++k)
     128                 :          0 :         rhob += ugp[multispecies::densityIdx(nspec, k)];
     129                 :            : 
     130                 :            :       // advection velocity
     131                 :          0 :       u = ugp[multispecies::momentumIdx(nspec, 0)]/rhob;
     132                 :          0 :       v = ugp[multispecies::momentumIdx(nspec, 1)]/rhob;
     133                 :          0 :       w = ugp[multispecies::momentumIdx(nspec, 2)]/rhob;
     134                 :            : 
     135 [ -  - ][ -  - ]:          0 :       vn = u*geoFace(f,1) + v*geoFace(f,2) + w*geoFace(f,3);
                 [ -  - ]
     136                 :            : 
     137                 :            :       // acoustic speed
     138         [ -  - ]:          0 :       p = mat_blk[0].compute< EOS::pressure >( rhob, u, v, w,
     139                 :          0 :         ugp[multispecies::energyIdx(nspec, 0)] );
     140         [ -  - ]:          0 :       a = mat_blk[0].compute< EOS::soundspeed >( rhob, p );
     141                 :            : 
     142         [ -  - ]:          0 :       dSV_r = geoFace(f,0) * (std::fabs(vn) + a);
     143                 :            : 
     144                 :          0 :       delt[eR] += std::max( dSV_l, dSV_r );
     145                 :            :     } else {
     146                 :          0 :       dSV_r = dSV_l;
     147                 :            :     }
     148                 :            : 
     149                 :          0 :     delt[el] += std::max( dSV_l, dSV_r );
     150                 :            :   }
     151                 :            : 
     152                 :          0 :   tk::real mindt = std::numeric_limits< tk::real >::max();
     153                 :            : 
     154                 :            :   // compute allowable dt
     155         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t e=0; e<nelem; ++e)
     156                 :            :   {
     157         [ -  - ]:          0 :     mindt = std::min( mindt, geoElem(e,0)/delt[e] );
     158                 :            :   }
     159                 :            : 
     160                 :          0 :   return mindt;
     161                 :            : }
     162                 :            : 
     163                 :            : } //inciter::

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