Quinoa all test code coverage report
Current view: top level - PDE/MultiMat - MiscMultiMatFns.cpp (source / functions) Hit Total Coverage
Commit: -128-NOTFOUND Lines: 225 310 72.6 %
Date: 2024-11-22 08:51:48 Functions: 9 11 81.8 %
Legend: Lines: hit not hit | Branches: + taken - not taken # not executed Branches: 164 348 47.1 %

           Branch data     Line data    Source code
       1                 :            : // *****************************************************************************
       2                 :            : /*!
       3                 :            :   \file      src/PDE/MultiMat/MiscMultiMatFns.hpp
       4                 :            :   \copyright 2012-2015 J. Bakosi,
       5                 :            :              2016-2018 Los Alamos National Security, LLC.,
       6                 :            :              2019-2021 Triad National Security, LLC.
       7                 :            :              All rights reserved. See the LICENSE file for details.
       8                 :            :   \brief     Misc multi-material system functions
       9                 :            :   \details   This file defines functions that required for multi-material
      10                 :            :     compressible hydrodynamics.
      11                 :            : */
      12                 :            : // *****************************************************************************
      13                 :            : 
      14                 :            : #include <iostream>
      15                 :            : 
      16                 :            : #include "MiscMultiMatFns.hpp"
      17                 :            : #include "Inciter/InputDeck/InputDeck.hpp"
      18                 :            : #include "Integrate/Basis.hpp"
      19                 :            : #include "MultiMat/MultiMatIndexing.hpp"
      20                 :            : #include "EoS/GetMatProp.hpp"
      21                 :            : 
      22                 :            : namespace inciter {
      23                 :            : 
      24                 :            : extern ctr::InputDeck g_inputdeck;
      25                 :            : 
      26                 :        204 : void initializeMaterialEoS( std::vector< EOS >& mat_blk )
      27                 :            : // *****************************************************************************
      28                 :            : //  Initialize the material block with configured EOS
      29                 :            : //! \param[in,out] mat_blk Material block that gets initialized
      30                 :            : // *****************************************************************************
      31                 :            : {
      32                 :            :   // EoS initialization
      33                 :            :   // ---------------------------------------------------------------------------
      34                 :        204 :   auto nmat = g_inputdeck.get< tag::multimat, tag::nmat >();
      35                 :        204 :   const auto& matprop = g_inputdeck.get< tag::material >();
      36                 :        204 :   const auto& matidxmap = g_inputdeck.get< tag::matidxmap >();
      37         [ +  + ]:        763 :   for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k) {
      38                 :        559 :     auto mateos = matprop[matidxmap.get< tag::eosidx >()[k]].get<tag::eos>();
      39         [ +  - ]:        559 :     mat_blk.emplace_back(mateos, EqType::multimat, k);
      40                 :            :   }
      41                 :            : 
      42                 :            :   // set rho0 for all materials
      43                 :            :   // ---------------------------------------------------------------------------
      44         [ +  - ]:        408 :   std::vector< tk::real > rho0mat( nmat, 0.0 );
      45                 :        204 :   const auto& ic = g_inputdeck.get< tag::ic >();
      46                 :        204 :   const auto& icbox = ic.get< tag::box >();
      47                 :        204 :   const auto& icmbk = ic.get< tag::meshblock >();
      48                 :            :   // Get background properties
      49                 :        204 :   std::size_t k = ic.get< tag::materialid >() - 1;
      50                 :        204 :   tk::real pr = ic.get< tag::pressure >();
      51                 :        204 :   tk::real tmp = ic.get< tag::temperature >();
      52         [ +  - ]:        204 :   rho0mat[k] = mat_blk[k].compute< EOS::density >(pr, tmp);
      53                 :            : 
      54                 :            :   // Check inside used defined box
      55         [ -  + ]:        204 :   if (!icbox.empty())
      56                 :            :   {
      57         [ -  - ]:          0 :     for (const auto& b : icbox) {   // for all boxes
      58                 :          0 :       k = b.get< tag::materialid >() - 1;
      59                 :          0 :       auto boxmas = b.get< tag::mass >();
      60                 :            :       // if mass and volume are given, compute density as mass/volume
      61         [ -  - ]:          0 :       if (boxmas > 0.0) {
      62                 :            :         std::vector< tk::real > box
      63                 :          0 :           { b.get< tag::xmin >(), b.get< tag::xmax >(),
      64                 :          0 :             b.get< tag::ymin >(), b.get< tag::ymax >(),
      65         [ -  - ]:          0 :             b.get< tag::zmin >(), b.get< tag::zmax >() };
      66                 :          0 :         auto V_ex = (box[1]-box[0]) * (box[3]-box[2]) * (box[5]-box[4]);
      67                 :          0 :         rho0mat[k] = boxmas / V_ex;
      68                 :            :       }
      69                 :            :       // else compute density from eos
      70                 :            :       else {
      71                 :          0 :         pr = b.get< tag::pressure >();
      72                 :          0 :         tmp = b.get< tag::temperature >();
      73         [ -  - ]:          0 :         rho0mat[k] = mat_blk[k].compute< EOS::density >(pr, tmp);
      74                 :            :       }
      75                 :            :     }
      76                 :            :   }
      77                 :            : 
      78                 :            :   // Check inside user-specified mesh blocks
      79         [ +  + ]:        204 :   if (!icmbk.empty())
      80                 :            :   {
      81         [ +  + ]:         20 :     for (const auto& b : icmbk) { // for all blocks
      82                 :         10 :       k = b.get< tag::materialid >() - 1;
      83                 :         10 :       auto boxmas = b.get< tag::mass >();
      84                 :            :       // if mass and volume are given, compute density as mass/volume
      85         [ +  - ]:         10 :       if (boxmas > 0.0) {
      86                 :         10 :         auto V_ex = b.get< tag::volume >();
      87                 :         10 :         rho0mat[k] = boxmas / V_ex;
      88                 :            :       }
      89                 :            :       // else compute density from eos
      90                 :            :       else {
      91                 :          0 :         pr = b.get< tag::pressure >();
      92                 :          0 :         tmp = b.get< tag::temperature >();
      93         [ -  - ]:          0 :         rho0mat[k] = mat_blk[k].compute< EOS::density >(pr, tmp);
      94                 :            :       }
      95                 :            :     }
      96                 :            :   }
      97                 :            : 
      98                 :            :   // Store computed rho0's in the EOS-block
      99         [ +  + ]:        763 :   for (std::size_t i=0; i<nmat; ++i) {
     100         [ +  - ]:        559 :     mat_blk[i].set< EOS::setRho0 >(rho0mat[i]);
     101                 :            :   }
     102                 :        204 : }
     103                 :            : 
     104                 :            : bool
     105                 :       6873 : cleanTraceMultiMat(
     106                 :            :   tk::real t,
     107                 :            :   std::size_t nelem,
     108                 :            :   const std::vector< EOS >& mat_blk,
     109                 :            :   const tk::Fields& geoElem,
     110                 :            :   std::size_t nmat,
     111                 :            :   tk::Fields& U,
     112                 :            :   tk::Fields& P )
     113                 :            : // *****************************************************************************
     114                 :            : //  Clean up the state of trace materials for multi-material PDE system
     115                 :            : //! \param[in] t Physical time
     116                 :            : //! \param[in] nelem Number of elements
     117                 :            : //! \param[in] mat_blk EOS material block
     118                 :            : //! \param[in] geoElem Element geometry array
     119                 :            : //! \param[in] nmat Number of materials in this PDE system
     120                 :            : //! \param[in/out] U High-order solution vector which gets modified
     121                 :            : //! \param[in/out] P High-order vector of primitives which gets modified
     122                 :            : //! \return Boolean indicating if an unphysical material state was found
     123                 :            : // *****************************************************************************
     124                 :            : {
     125                 :       6873 :   const auto ndof = g_inputdeck.get< tag::ndof >();
     126                 :       6873 :   const auto rdof = g_inputdeck.get< tag::rdof >();
     127                 :       6873 :   const auto& solidx = g_inputdeck.get< tag::matidxmap, tag::solidx >();
     128                 :       6873 :   std::size_t ncomp = U.nprop()/rdof;
     129                 :       6873 :   auto neg_density = false;
     130                 :            : 
     131         [ +  - ]:       6873 :   std::vector< tk::real > ugp(ncomp, 0.0);
     132                 :            : 
     133         [ +  + ]:    2465113 :   for (std::size_t e=0; e<nelem; ++e)
     134                 :            :   {
     135                 :            :     // find material in largest quantity.
     136                 :    2458240 :     auto almax(0.0);
     137                 :    2458240 :     std::size_t kmax = 0;
     138         [ +  + ]:    8520180 :     for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k)
     139                 :            :     {
     140         [ +  - ]:    6061940 :       auto al = U(e, volfracDofIdx(nmat, k, rdof, 0));
     141         [ +  + ]:    6061940 :       if (al > almax)
     142                 :            :       {
     143                 :    3776824 :         almax = al;
     144                 :    3776824 :         kmax = k;
     145                 :            :       }
     146                 :            :     }
     147                 :            : 
     148                 :            :     // get conserved quantities
     149         [ +  - ]:    4916480 :     std::vector< tk::real > B(rdof, 0.0);
     150                 :    2458240 :     B[0] = 1.0;
     151         [ +  - ]:    2458240 :     ugp = eval_state(ncomp, rdof, ndof, e, U, B);
     152                 :            : 
     153         [ +  - ]:    2458240 :     auto u = P(e, velocityDofIdx(nmat, 0, rdof, 0));
     154         [ +  - ]:    2458240 :     auto v = P(e, velocityDofIdx(nmat, 1, rdof, 0));
     155         [ +  - ]:    2458240 :     auto w = P(e, velocityDofIdx(nmat, 2, rdof, 0));
     156         [ +  - ]:    2458240 :     auto pmax = P(e, pressureDofIdx(nmat, kmax, rdof, 0))/almax;
     157         [ +  - ]:    2458240 :     auto gmax = getDeformGrad(nmat, kmax, ugp);
     158                 :    2458240 :     auto tmax = mat_blk[kmax].compute< EOS::temperature >(
     159 [ +  - ][ +  - ]:    2458240 :       U(e, densityDofIdx(nmat, kmax, rdof, 0)), u, v, w,
     160         [ +  - ]:    2458240 :       U(e, energyDofIdx(nmat, kmax, rdof, 0)), almax, gmax );
     161                 :            : 
     162                 :    2458240 :     tk::real p_target(0.0), d_al(0.0), d_arE(0.0);
     163                 :            :     //// get equilibrium pressure
     164                 :            :     //std::vector< tk::real > kmat(nmat, 0.0);
     165                 :            :     //tk::real ratio(0.0);
     166                 :            :     //for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k)
     167                 :            :     //{
     168                 :            :     //  auto arhok = U(e, densityDofIdx(nmat,k,rdof,0));
     169                 :            :     //  auto alk = U(e, volfracDofIdx(nmat,k,rdof,0));
     170                 :            :     //  auto apk = P(e, pressureDofIdx(nmat,k,rdof,0)3);
     171                 :            :     //  auto ak = mat_blk[k].compute< EOS::soundspeed >(arhok, apk, alk, k);
     172                 :            :     //  kmat[k] = arhok * ak * ak;
     173                 :            : 
     174                 :            :     //  p_target += alk * apk / kmat[k];
     175                 :            :     //  ratio += alk * alk / kmat[k];
     176                 :            :     //}
     177                 :            :     //p_target /= ratio;
     178                 :            :     //p_target = std::max(p_target, 1e-14);
     179                 :    2458240 :     p_target = std::max(pmax, 1e-14);
     180                 :            : 
     181                 :            :     // 1. Correct minority materials and store volume/energy changes
     182         [ +  + ]:    8520180 :     for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k)
     183                 :            :     {
     184         [ +  - ]:    6061940 :       auto alk = U(e, volfracDofIdx(nmat, k, rdof, 0));
     185         [ +  - ]:    6061940 :       auto pk = P(e, pressureDofIdx(nmat, k, rdof, 0)) / alk;
     186                 :            :       // for positive volume fractions
     187 [ +  - ][ +  - ]:    6061940 :       if (solidx[k] == 0 && solidx[kmax] == 0 && matExists(alk))
         [ +  + ][ +  + ]
     188                 :            :       {
     189                 :            :         // check if volume fraction is lesser than threshold (volfracPRelaxLim)
     190                 :            :         // and if the material (effective) pressure is negative. If either of
     191                 :            :         // these conditions is true, perform pressure relaxation.
     192         [ +  + ]:    5221332 :         if ((alk < volfracPRelaxLim()) ||
     193 [ -  + ][ +  + ]:    7730879 :           (pk < mat_blk[k].compute< EOS::min_eff_pressure >(1e-12,
     194 [ +  - ][ +  - ]:    2509547 :           U(e, densityDofIdx(nmat, k, rdof, 0)), alk))
     195                 :            :           /*&& (std::fabs((pk-pmax)/pmax) > 1e-08)*/)
     196                 :            :         {
     197                 :            :           // determine target relaxation pressure
     198                 :     202238 :           auto prelax = mat_blk[k].compute< EOS::min_eff_pressure >(1e-10,
     199 [ +  - ][ +  - ]:     202238 :             U(e, densityDofIdx(nmat, k, rdof, 0)), alk);
     200                 :     202238 :           prelax = std::max(prelax, p_target);
     201                 :            : 
     202                 :            :           // energy change
     203         [ +  - ]:     202238 :           auto rhomat = U(e, densityDofIdx(nmat, k, rdof, 0))
     204                 :     202238 :             / alk;
     205         [ +  - ]:     202238 :           auto gmat = getDeformGrad(nmat, k, ugp);
     206         [ +  - ]:     202238 :           auto rhoEmat = mat_blk[k].compute< EOS::totalenergy >(rhomat, u, v, w,
     207                 :            :             prelax, gmat);
     208                 :            : 
     209                 :            :           // total energy flux into majority material
     210         [ +  - ]:     202238 :           d_arE += (U(e, energyDofIdx(nmat, k, rdof, 0))
     211                 :     202238 :             - alk * rhoEmat);
     212                 :            : 
     213                 :            :           // update state of trace material
     214         [ +  - ]:     202238 :           U(e, volfracDofIdx(nmat, k, rdof, 0)) = alk;
     215         [ +  - ]:     202238 :           U(e, energyDofIdx(nmat, k, rdof, 0)) = alk*rhoEmat;
     216         [ +  - ]:     202238 :           P(e, pressureDofIdx(nmat, k, rdof, 0)) = alk*prelax;
     217                 :            :         }
     218                 :            :       }
     219                 :            :       // check for unbounded volume fractions
     220 [ +  - ][ -  + ]:    3350155 :       else if (alk < 0.0 || !std::isfinite(alk))
                 [ -  + ]
     221                 :            :       {
     222         [ -  - ]:          0 :         auto rhok = mat_blk[k].compute< EOS::density >(p_target,
     223                 :          0 :           std::max(1e-8,tmax));
     224         [ -  - ]:          0 :         if (std::isfinite(alk)) d_al += (alk - 1e-14);
     225                 :            :         // update state of trace material
     226         [ -  - ]:          0 :         U(e, volfracDofIdx(nmat, k, rdof, 0)) = 1e-14;
     227         [ -  - ]:          0 :         U(e, densityDofIdx(nmat, k, rdof, 0)) = 1e-14 * rhok;
     228                 :          0 :         auto gk = std::array< std::array< tk::real, 3 >, 3 >
     229                 :            :           {{ {{1, 0, 0}},
     230                 :            :              {{0, 1, 0}},
     231                 :            :              {{0, 0, 1}} }};
     232         [ -  - ]:          0 :         U(e, energyDofIdx(nmat, k, rdof, 0)) = 1e-14
     233         [ -  - ]:          0 :           * mat_blk[k].compute< EOS::totalenergy >(rhok, u, v, w, p_target,
     234                 :            :           gk);
     235         [ -  - ]:          0 :         P(e, pressureDofIdx(nmat, k, rdof, 0)) = 1e-14 *
     236                 :            :           p_target;
     237         [ -  - ]:          0 :         resetSolidTensors(nmat, k, e, U, P);
     238         [ -  - ]:          0 :         for (std::size_t i=1; i<rdof; ++i) {
     239         [ -  - ]:          0 :           U(e, volfracDofIdx(nmat, k, rdof, i)) = 0.0;
     240         [ -  - ]:          0 :           U(e, densityDofIdx(nmat, k, rdof, i)) = 0.0;
     241         [ -  - ]:          0 :           U(e, energyDofIdx(nmat, k, rdof, i)) = 0.0;
     242         [ -  - ]:          0 :           P(e, pressureDofIdx(nmat, k, rdof, i)) = 0.0;
     243                 :            :         }
     244                 :            :       }
     245         [ +  - ]:    3350155 :       else if (!matExists(alk)) {  // condition so that else-branch not exec'ed for solids
     246                 :            :         // determine target relaxation pressure
     247                 :    3350155 :         auto prelax = mat_blk[k].compute< EOS::min_eff_pressure >(1e-10,
     248 [ +  - ][ +  - ]:    3350155 :           U(e, densityDofIdx(nmat, k, rdof, 0)), alk);
     249                 :    3350155 :         prelax = std::max(prelax, p_target);
     250         [ +  - ]:    3350155 :         auto rhok = U(e, densityDofIdx(nmat, k, rdof, 0)) / alk;
     251                 :    3350155 :         auto gk = std::array< std::array< tk::real, 3 >, 3 >
     252                 :            :           {{ {{1, 0, 0}},
     253                 :            :              {{0, 1, 0}},
     254                 :            :              {{0, 0, 1}} }};
     255                 :            :         // update state of trace material
     256         [ +  - ]:    3350155 :         U(e, energyDofIdx(nmat, k, rdof, 0)) = alk
     257         [ +  - ]:    3350155 :           * mat_blk[k].compute< EOS::totalenergy >( rhok, u, v, w, prelax, gk );
     258         [ +  - ]:    3350155 :         P(e, pressureDofIdx(nmat, k, rdof, 0)) = alk *
     259                 :            :           prelax;
     260         [ +  - ]:    3350155 :         resetSolidTensors(nmat, k, e, U, P);
     261         [ +  + ]:    6580054 :         for (std::size_t i=1; i<rdof; ++i) {
     262         [ +  - ]:    3229899 :           U(e, energyDofIdx(nmat, k, rdof, i)) = 0.0;
     263         [ +  - ]:    3229899 :           P(e, pressureDofIdx(nmat, k, rdof, i)) = 0.0;
     264                 :            :         }
     265                 :            :       }
     266                 :            :     }
     267                 :            : 
     268         [ +  - ]:    2458240 :     U(e, volfracDofIdx(nmat, kmax, rdof, 0)) += d_al;
     269                 :            : 
     270                 :            :     // 2. Flux energy change into majority material
     271         [ +  - ]:    2458240 :     U(e, energyDofIdx(nmat, kmax, rdof, 0)) += d_arE;
     272         [ +  - ]:    2458240 :     P(e, pressureDofIdx(nmat, kmax, rdof, 0)) =
     273                 :    4916480 :       mat_blk[kmax].compute< EOS::pressure >(
     274 [ +  - ][ +  - ]:    2458240 :       U(e, densityDofIdx(nmat, kmax, rdof, 0)), u, v, w,
     275         [ +  - ]:    2458240 :       U(e, energyDofIdx(nmat, kmax, rdof, 0)),
     276         [ +  - ]:    2458240 :       U(e, volfracDofIdx(nmat, kmax, rdof, 0)), kmax, gmax );
     277                 :            : 
     278                 :            :     // 3. enforce unit sum of volume fractions
     279                 :    2458240 :     auto alsum = 0.0;
     280         [ +  + ]:    8520180 :     for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k)
     281         [ +  - ]:    6061940 :       alsum += U(e, volfracDofIdx(nmat, k, rdof, 0));
     282                 :            : 
     283         [ +  + ]:    8520180 :     for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k) {
     284         [ +  - ]:    6061940 :       U(e, volfracDofIdx(nmat, k, rdof, 0)) /= alsum;
     285         [ +  - ]:    6061940 :       U(e, densityDofIdx(nmat, k, rdof, 0)) /= alsum;
     286         [ +  - ]:    6061940 :       U(e, energyDofIdx(nmat, k, rdof, 0)) /= alsum;
     287         [ +  - ]:    6061940 :       P(e, pressureDofIdx(nmat, k, rdof, 0)) /= alsum;
     288         [ -  + ]:    6061940 :       if (solidx[k] > 0) {
     289         [ -  - ]:          0 :         for (std::size_t i=0; i<6; ++i)
     290         [ -  - ]:          0 :           P(e, stressDofIdx(nmat, solidx[k], i, rdof, 0)) /= alsum;
     291                 :            :       }
     292                 :            :     }
     293                 :            : 
     294         [ +  - ]:    2458240 :     pmax = P(e, pressureDofIdx(nmat, kmax, rdof, 0)) /
     295         [ +  - ]:    2458240 :       U(e, volfracDofIdx(nmat, kmax, rdof, 0));
     296                 :            : 
     297                 :            :     // check for unphysical state
     298         [ +  + ]:    8520180 :     for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k)
     299                 :            :     {
     300         [ +  - ]:    6061940 :       auto alpha = U(e, volfracDofIdx(nmat, k, rdof, 0));
     301         [ +  - ]:    6061940 :       auto arho = U(e, densityDofIdx(nmat, k, rdof, 0));
     302         [ +  - ]:    6061940 :       auto apr = P(e, pressureDofIdx(nmat, k, rdof, 0));
     303                 :            : 
     304                 :            :       // lambda for screen outputs
     305                 :          0 :       auto screenout = [&]()
     306                 :            :       {
     307                 :          0 :         std::cout << "Physical time:     " << t << std::endl;
     308                 :          0 :         std::cout << "Element centroid:  " << geoElem(e,1) << ", "
     309                 :          0 :           << geoElem(e,2) << ", " << geoElem(e,3) << std::endl;
     310                 :          0 :         std::cout << "Material-id:       " << k << std::endl;
     311                 :          0 :         std::cout << "Volume-fraction:   " << alpha << std::endl;
     312                 :          0 :         std::cout << "Partial density:   " << arho << std::endl;
     313                 :          0 :         std::cout << "Partial pressure:  " << apr << std::endl;
     314                 :          0 :         std::cout << "Major pressure:    " << pmax << " (mat " << kmax << ")"
     315                 :          0 :           << std::endl;
     316                 :          0 :         std::cout << "Major temperature: " << tmax << " (mat " << kmax << ")"
     317                 :          0 :           << std::endl;
     318                 :          0 :         std::cout << "Velocity:          " << u << ", " << v << ", " << w
     319                 :          0 :           << std::endl;
     320                 :    6061940 :       };
     321                 :            : 
     322         [ -  + ]:    6061940 :       if (arho < 0.0)
     323                 :            :       {
     324                 :          0 :         neg_density = true;
     325         [ -  - ]:          0 :         screenout();
     326                 :            :       }
     327                 :            :     }
     328                 :            :   }
     329                 :      13746 :   return neg_density;
     330                 :            : }
     331                 :            : 
     332                 :            : tk::real
     333                 :        260 : timeStepSizeMultiMat(
     334                 :            :   const std::vector< EOS >& mat_blk,
     335                 :            :   const std::vector< int >& esuf,
     336                 :            :   const tk::Fields& geoFace,
     337                 :            :   const tk::Fields& geoElem,
     338                 :            :   const std::size_t nelem,
     339                 :            :   std::size_t nmat,
     340                 :            :   const tk::Fields& U,
     341                 :            :   const tk::Fields& P )
     342                 :            : // *****************************************************************************
     343                 :            : //  Time step restriction for multi material cell-centered schemes
     344                 :            : //! \param[in] mat_blk EOS material block
     345                 :            : //! \param[in] esuf Elements surrounding elements array
     346                 :            : //! \param[in] geoFace Face geometry array
     347                 :            : //! \param[in] geoElem Element geometry array
     348                 :            : //! \param[in] nelem Number of elements
     349                 :            : //! \param[in] nmat Number of materials in this PDE system
     350                 :            : //! \param[in] U High-order solution vector
     351                 :            : //! \param[in] P High-order vector of primitives
     352                 :            : //! \return Maximum allowable time step based on cfl criterion
     353                 :            : // *****************************************************************************
     354                 :            : {
     355                 :        260 :   const auto ndof = g_inputdeck.get< tag::ndof >();
     356                 :        260 :   const auto rdof = g_inputdeck.get< tag::rdof >();
     357                 :        260 :   std::size_t ncomp = U.nprop()/rdof;
     358                 :        260 :   std::size_t nprim = P.nprop()/rdof;
     359                 :            : 
     360                 :            :   tk::real u, v, w, a, vn, dSV_l, dSV_r;
     361         [ +  - ]:        520 :   std::vector< tk::real > delt(U.nunk(), 0.0);
     362 [ +  - ][ +  - ]:        520 :   std::vector< tk::real > ugp(ncomp, 0.0), pgp(nprim, 0.0);
     363                 :            : 
     364                 :            :   // compute maximum characteristic speed at all internal element faces
     365         [ +  + ]:     384860 :   for (std::size_t f=0; f<esuf.size()/2; ++f)
     366                 :            :   {
     367                 :     384600 :     std::size_t el = static_cast< std::size_t >(esuf[2*f]);
     368                 :     384600 :     auto er = esuf[2*f+1];
     369                 :            : 
     370                 :            :     std::array< tk::real, 3 > fn;
     371         [ +  - ]:     384600 :     fn[0] = geoFace(f,1);
     372         [ +  - ]:     384600 :     fn[1] = geoFace(f,2);
     373         [ +  - ]:     384600 :     fn[2] = geoFace(f,3);
     374                 :            : 
     375                 :            :     // left element
     376                 :            : 
     377                 :            :     // Compute the basis function for the left element
     378         [ +  - ]:     384600 :     std::vector< tk::real > B_l(rdof, 0.0);
     379                 :     384600 :     B_l[0] = 1.0;
     380                 :            : 
     381                 :            :     // get conserved quantities
     382         [ +  - ]:     384600 :     ugp = eval_state(ncomp, rdof, ndof, el, U, B_l);
     383                 :            :     // get primitive quantities
     384         [ +  - ]:     384600 :     pgp = eval_state(nprim, rdof, ndof, el, P, B_l);
     385                 :            : 
     386                 :            :     // advection velocity
     387                 :     384600 :     u = pgp[velocityIdx(nmat, 0)];
     388                 :     384600 :     v = pgp[velocityIdx(nmat, 1)];
     389                 :     384600 :     w = pgp[velocityIdx(nmat, 2)];
     390                 :            : 
     391 [ +  - ][ +  - ]:     384600 :     vn = u*geoFace(f,1) + v*geoFace(f,2) + w*geoFace(f,3);
                 [ +  - ]
     392                 :            : 
     393                 :            :     // acoustic speed
     394                 :     384600 :     a = 0.0;
     395         [ +  + ]:    1153800 :     for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k)
     396                 :            :     {
     397         [ +  + ]:     769200 :       if (ugp[volfracIdx(nmat, k)] > 1.0e-04) {
     398         [ +  - ]:     398332 :         auto gk = getDeformGrad(nmat, k, ugp);
     399         [ +  - ]:     398332 :         gk = tk::rotateTensor(gk, fn);
     400         [ +  - ]:    1194996 :         a = std::max( a, mat_blk[k].compute< EOS::soundspeed >(
     401                 :     398332 :           ugp[densityIdx(nmat, k)],
     402                 :     796664 :           pgp[pressureIdx(nmat, k)], ugp[volfracIdx(nmat, k)], k, gk ) );
     403                 :            :       }
     404                 :            :     }
     405                 :            : 
     406         [ +  - ]:     384600 :     dSV_l = geoFace(f,0) * (std::fabs(vn) + a);
     407                 :            : 
     408                 :            :     // right element
     409         [ +  + ]:     384600 :     if (er > -1) {
     410                 :     297040 :       std::size_t eR = static_cast< std::size_t >( er );
     411                 :            : 
     412                 :            :       // Compute the basis function for the right element
     413         [ +  - ]:     297040 :       std::vector< tk::real > B_r(rdof, 0.0);
     414                 :     297040 :       B_r[0] = 1.0;
     415                 :            : 
     416                 :            :       // get conserved quantities
     417         [ +  - ]:     297040 :       ugp = eval_state( ncomp, rdof, ndof, eR, U, B_r);
     418                 :            :       // get primitive quantities
     419         [ +  - ]:     297040 :       pgp = eval_state( nprim, rdof, ndof, eR, P, B_r);
     420                 :            : 
     421                 :            :       // advection velocity
     422                 :     297040 :       u = pgp[velocityIdx(nmat, 0)];
     423                 :     297040 :       v = pgp[velocityIdx(nmat, 1)];
     424                 :     297040 :       w = pgp[velocityIdx(nmat, 2)];
     425                 :            : 
     426 [ +  - ][ +  - ]:     297040 :       vn = u*geoFace(f,1) + v*geoFace(f,2) + w*geoFace(f,3);
                 [ +  - ]
     427                 :            : 
     428                 :            :       // acoustic speed
     429                 :     297040 :       a = 0.0;
     430         [ +  + ]:     891120 :       for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k)
     431                 :            :       {
     432         [ +  + ]:     594080 :         if (ugp[volfracIdx(nmat, k)] > 1.0e-04) {
     433         [ +  - ]:     307815 :           auto gk = getDeformGrad(nmat, k, ugp);
     434         [ +  - ]:     307815 :           gk = tk::rotateTensor(gk, fn);
     435         [ +  - ]:     923445 :           a = std::max( a, mat_blk[k].compute< EOS::soundspeed >(
     436                 :     307815 :             ugp[densityIdx(nmat, k)],
     437                 :     615630 :             pgp[pressureIdx(nmat, k)], ugp[volfracIdx(nmat, k)], k, gk ) );
     438                 :            :         }
     439                 :            :       }
     440                 :            : 
     441         [ +  - ]:     297040 :       dSV_r = geoFace(f,0) * (std::fabs(vn) + a);
     442                 :            : 
     443                 :     297040 :       delt[eR] += std::max( dSV_l, dSV_r );
     444                 :            :     } else {
     445                 :      87560 :       dSV_r = dSV_l;
     446                 :            :     }
     447                 :            : 
     448                 :     384600 :     delt[el] += std::max( dSV_l, dSV_r );
     449                 :            :   }
     450                 :            : 
     451                 :        260 :   tk::real mindt = std::numeric_limits< tk::real >::max();
     452                 :            : 
     453                 :            :   // compute allowable dt
     454         [ +  + ]:     167020 :   for (std::size_t e=0; e<nelem; ++e)
     455                 :            :   {
     456         [ +  - ]:     166760 :     mindt = std::min( mindt, geoElem(e,0)/delt[e] );
     457                 :            :   }
     458                 :            : 
     459                 :        520 :   return mindt;
     460                 :            : }
     461                 :            : 
     462                 :            : tk::real
     463                 :        250 : timeStepSizeMultiMatFV(
     464                 :            :   const std::vector< EOS >& mat_blk,
     465                 :            :   const tk::Fields& geoElem,
     466                 :            :   std::size_t nelem,
     467                 :            :   std::size_t nmat,
     468                 :            :   const tk::Fields& U,
     469                 :            :   const tk::Fields& P,
     470                 :            :   std::vector< tk::real >& local_dte )
     471                 :            : // *****************************************************************************
     472                 :            : //  Time step restriction for multi material cell-centered FV scheme
     473                 :            : //! \param[in] mat_blk Material EOS block
     474                 :            : //! \param[in] geoElem Element geometry array
     475                 :            : //! \param[in] nelem Number of elements
     476                 :            : //! \param[in] nmat Number of materials in this PDE system
     477                 :            : //! \param[in] U High-order solution vector
     478                 :            : //! \param[in] P High-order vector of primitives
     479                 :            : //! \param[in,out] local_dte Time step size for each element (for local
     480                 :            : //!   time stepping)
     481                 :            : //! \return Maximum allowable time step based on cfl criterion
     482                 :            : // *****************************************************************************
     483                 :            : {
     484                 :        250 :   const auto ndof = g_inputdeck.get< tag::ndof >();
     485                 :        250 :   const auto rdof = g_inputdeck.get< tag::rdof >();
     486                 :            :   const auto use_mass_avg =
     487                 :        250 :     g_inputdeck.get< tag::multimat, tag::dt_sos_massavg >();
     488                 :        250 :   std::size_t ncomp = U.nprop()/rdof;
     489                 :        250 :   std::size_t nprim = P.nprop()/rdof;
     490                 :            : 
     491 [ +  - ][ +  - ]:        500 :   std::vector< tk::real > ugp(ncomp, 0.0), pgp(nprim, 0.0);
     492                 :        250 :   tk::real mindt = std::numeric_limits< tk::real >::max();
     493                 :            : 
     494                 :            :   // loop over all elements
     495         [ +  + ]:     122250 :   for (std::size_t e=0; e<nelem; ++e)
     496                 :            :   {
     497                 :            :     // basis function at centroid
     498         [ +  - ]:     122000 :     std::vector< tk::real > B(rdof, 0.0);
     499                 :     122000 :     B[0] = 1.0;
     500                 :            : 
     501                 :            :     // get conserved quantities
     502         [ +  - ]:     122000 :     ugp = eval_state(ncomp, rdof, ndof, e, U, B);
     503                 :            :     // get primitive quantities
     504         [ +  - ]:     122000 :     pgp = eval_state(nprim, rdof, ndof, e, P, B);
     505                 :            : 
     506                 :            :     // magnitude of advection velocity
     507                 :     122000 :     auto u = pgp[velocityIdx(nmat, 0)];
     508                 :     122000 :     auto v = pgp[velocityIdx(nmat, 1)];
     509                 :     122000 :     auto w = pgp[velocityIdx(nmat, 2)];
     510                 :     122000 :     auto vmag = std::sqrt(tk::dot({u, v, w}, {u, v, w}));
     511                 :            : 
     512                 :            :     // acoustic speed
     513                 :     122000 :     tk::real a = 0.0;
     514                 :     122000 :     tk::real mixtureDensity = 0.0;
     515         [ +  + ]:     366000 :     for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k)
     516                 :            :     {
     517         [ -  + ]:     244000 :       if (use_mass_avg > 0)
     518                 :            :       {
     519                 :            :         // mass averaging SoS
     520         [ -  - ]:          0 :         a += ugp[densityIdx(nmat,k)]*mat_blk[k].compute< EOS::soundspeed >(
     521                 :          0 :           ugp[densityIdx(nmat, k)], pgp[pressureIdx(nmat, k)],
     522                 :          0 :           ugp[volfracIdx(nmat, k)], k );
     523                 :            : 
     524                 :          0 :         mixtureDensity += ugp[densityIdx(nmat,k)];
     525                 :            :       }
     526                 :            :       else
     527                 :            :       {
     528         [ +  + ]:     244000 :         if (ugp[volfracIdx(nmat, k)] > 1.0e-04)
     529                 :            :         {
     530         [ +  - ]:     424107 :           a = std::max( a, mat_blk[k].compute< EOS::soundspeed >(
     531                 :     141369 :             ugp[densityIdx(nmat, k)], pgp[pressureIdx(nmat, k)],
     532                 :     282738 :             ugp[volfracIdx(nmat, k)], k ) );
     533                 :            :         }
     534                 :            :       }
     535                 :            :     }
     536         [ -  + ]:     122000 :     if (use_mass_avg > 0) a /= mixtureDensity;
     537                 :            : 
     538                 :            :     // characteristic wave speed
     539                 :     122000 :     auto v_char = vmag + a;
     540                 :            : 
     541                 :            :     // characteristic length (radius of insphere)
     542 [ +  - ][ +  - ]:     122000 :     auto dx = std::min(std::cbrt(geoElem(e,0)), geoElem(e,4))
     543                 :     122000 :       /std::sqrt(24.0);
     544                 :            : 
     545                 :            :     // element dt
     546                 :     122000 :     local_dte[e] = dx/v_char;
     547                 :     122000 :     mindt = std::min(mindt, local_dte[e]);
     548                 :            :   }
     549                 :            : 
     550                 :        500 :   return mindt;
     551                 :            : }
     552                 :            : 
     553                 :            : tk::real
     554                 :          0 : timeStepSizeViscousFV(
     555                 :            :   const tk::Fields& geoElem,
     556                 :            :   std::size_t nelem,
     557                 :            :   std::size_t nmat,
     558                 :            :   const tk::Fields& U )
     559                 :            : // *****************************************************************************
     560                 :            : //  Compute the time step size restriction based on this physics
     561                 :            : //! \param[in] geoElem Element geometry array
     562                 :            : //! \param[in] nelem Number of elements
     563                 :            : //! \param[in] nmat Number of materials
     564                 :            : //! \param[in] U Solution vector
     565                 :            : //! \return Maximum allowable time step based on viscosity
     566                 :            : // *****************************************************************************
     567                 :            : {
     568                 :          0 :   const auto& ndof = g_inputdeck.get< tag::ndof >();
     569                 :          0 :   const auto& rdof = g_inputdeck.get< tag::rdof >();
     570                 :          0 :   std::size_t ncomp = U.nprop()/rdof;
     571                 :            : 
     572                 :          0 :   auto mindt = std::numeric_limits< tk::real >::max();
     573                 :            : 
     574         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t e=0; e<nelem; ++e)
     575                 :            :   {
     576                 :            :     // get conserved quantities at centroid
     577         [ -  - ]:          0 :     std::vector< tk::real > B(rdof, 0.0);
     578                 :          0 :     B[0] = 1.0;
     579         [ -  - ]:          0 :     auto ugp = eval_state(ncomp, rdof, ndof, e, U, B);
     580                 :            : 
     581                 :            :     // Kinematic viscosity
     582                 :          0 :     tk::real nu(0.0);
     583         [ -  - ]:          0 :     for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k)
     584                 :            :     {
     585                 :          0 :       auto alk = ugp[volfracIdx(nmat, k)];
     586         [ -  - ]:          0 :       auto mu = getmatprop< tag::mu >(k);
     587         [ -  - ]:          0 :       if (alk > 1.0e-04) nu = std::max(nu, alk*mu/ugp[densityIdx(nmat,k)]);
     588                 :            :     }
     589                 :            : 
     590                 :            :     // characteristic length (radius of insphere)
     591 [ -  - ][ -  - ]:          0 :     auto dx = std::min(std::cbrt(geoElem(e,0)), geoElem(e,4))
     592                 :          0 :       /std::sqrt(24.0);
     593                 :            : 
     594                 :            :     // element dt
     595                 :          0 :     mindt = std::min(mindt, dx*dx/nu);
     596                 :            :   }
     597                 :            : 
     598                 :          0 :   return mindt;
     599                 :            : }
     600                 :            : 
     601                 :            : void
     602                 :    3350155 : resetSolidTensors(
     603                 :            :   std::size_t nmat,
     604                 :            :   std::size_t k,
     605                 :            :   std::size_t e,
     606                 :            :   tk::Fields& U,
     607                 :            :   tk::Fields& P )
     608                 :            : // *****************************************************************************
     609                 :            : //  Reset the solid tensors
     610                 :            : //! \param[in] nmat Number of materials in this PDE system
     611                 :            : //! \param[in] k Material id whose deformation gradient is required
     612                 :            : //! \param[in] e Id of element whose solution is to be limited
     613                 :            : //! \param[in/out] U High-order solution vector which gets modified
     614                 :            : //! \param[in/out] P High-order vector of primitives which gets modified
     615                 :            : // *****************************************************************************
     616                 :            : {
     617                 :    3350155 :   const auto& solidx = g_inputdeck.get< tag::matidxmap, tag::solidx >();
     618                 :    3350155 :   const auto rdof = g_inputdeck.get< tag::rdof >();
     619                 :            : 
     620         [ -  + ]:    3350155 :   if (solidx[k] > 0) {
     621         [ -  - ]:          0 :     for (std::size_t i=0; i<3; ++i) {
     622         [ -  - ]:          0 :       for (std::size_t j=0; j<3; ++j) {
     623                 :            :         // deformation gradient reset
     624         [ -  - ]:          0 :         if (i==j) U(e, deformDofIdx(nmat, solidx[k], i, j, rdof, 0)) = 1.0;
     625                 :          0 :         else U(e, deformDofIdx(nmat, solidx[k], i, j, rdof, 0)) = 0.0;
     626                 :            : 
     627                 :            :         // elastic Cauchy-stress reset
     628                 :          0 :         P(e, stressDofIdx(nmat, solidx[k], stressCmp[i][j], rdof, 0)) = 0.0;
     629                 :            : 
     630                 :            :         // high-order reset
     631         [ -  - ]:          0 :         for (std::size_t l=1; l<rdof; ++l) {
     632                 :          0 :           U(e, deformDofIdx(nmat, solidx[k], i, j, rdof, l)) = 0.0;
     633                 :          0 :           P(e, stressDofIdx(nmat, solidx[k], stressCmp[i][j], rdof, l)) = 0.0;
     634                 :            :         }
     635                 :            :       }
     636                 :            :     }
     637                 :            :   }
     638                 :    3350155 : }
     639                 :            : 
     640                 :            : std::array< std::array< tk::real, 3 >, 3 >
     641                 :   14875755 : getDeformGrad(
     642                 :            :   std::size_t nmat,
     643                 :            :   std::size_t k,
     644                 :            :   const std::vector< tk::real >& state )
     645                 :            : // *****************************************************************************
     646                 :            : //  Get the inverse deformation gradient tensor for a material at given location
     647                 :            : //! \param[in] nmat Number of materials in this PDE system
     648                 :            : //! \param[in] k Material id whose deformation gradient is required
     649                 :            : //! \param[in] state State vector at location
     650                 :            : //! \return Inverse deformation gradient tensor (g_k) of material k
     651                 :            : // *****************************************************************************
     652                 :            : {
     653                 :   14875755 :   const auto& solidx = g_inputdeck.get< tag::matidxmap, tag::solidx >();
     654                 :            :   std::array< std::array< tk::real, 3 >, 3 > gk;
     655                 :            : 
     656         [ -  + ]:   14875755 :   if (solidx[k] > 0) {
     657                 :            :     // deformation gradient for solids
     658         [ -  - ]:          0 :     for (std::size_t i=0; i<3; ++i) {
     659         [ -  - ]:          0 :       for (std::size_t j=0; j<3; ++j)
     660                 :          0 :         gk[i][j] = state[deformIdx(nmat,solidx[k],i,j)];
     661                 :            :     }
     662                 :            :   }
     663                 :            :   else {
     664                 :            :     // empty vector for fluids
     665                 :   14875755 :     gk = {{}};
     666                 :            :   }
     667                 :            : 
     668                 :   14875755 :   return gk;
     669                 :            : }
     670                 :            : 
     671                 :            : std::array< std::array< tk::real, 3 >, 3 >
     672                 :     686000 : getCauchyStress(
     673                 :            :   std::size_t nmat,
     674                 :            :   std::size_t k,
     675                 :            :   std::size_t ncomp,
     676                 :            :   const std::vector< tk::real >& state )
     677                 :            : // *****************************************************************************
     678                 :            : //  Get the elastic Cauchy stress tensor for a material at given location
     679                 :            : //! \param[in] nmat Number of materials in this PDE system
     680                 :            : //! \param[in] k Material id whose deformation gradient is required
     681                 :            : //! \param[in] ncomp Number of components in the PDE system
     682                 :            : //! \param[in] state State vector at location
     683                 :            : //! \return Elastic Cauchy stress tensor (alpha * \sigma_ij) of material k
     684                 :            : // *****************************************************************************
     685                 :            : {
     686                 :     686000 :   const auto& solidx = g_inputdeck.get< tag::matidxmap, tag::solidx >();
     687                 :            :   std::array< std::array< tk::real, 3 >, 3 >
     688                 :     686000 :     asigk{{ {{0,0,0}}, {{0,0,0}}, {{0,0,0}} }};
     689                 :            : 
     690                 :            :   // elastic Cauchy stress for solids
     691         [ -  + ]:     686000 :   if (solidx[k] > 0) {
     692         [ -  - ]:          0 :     for (std::size_t i=0; i<3; ++i) {
     693         [ -  - ]:          0 :       for (std::size_t j=0; j<3; ++j)
     694                 :          0 :         asigk[i][j] = state[ncomp +
     695                 :          0 :           stressIdx(nmat, solidx[k], stressCmp[i][j])];
     696                 :            :     }
     697                 :            :   }
     698                 :            : 
     699                 :     686000 :   return asigk;
     700                 :            : }
     701                 :            : 
     702                 :            : bool
     703                 :    7379205 : haveSolid(
     704                 :            :   std::size_t nmat,
     705                 :            :   const std::vector< std::size_t >& solidx )
     706                 :            : // *****************************************************************************
     707                 :            : //  Check whether we have solid materials in our problem
     708                 :            : //! \param[in] nmat Number of materials in this PDE system
     709                 :            : //! \param[in] solidx Material index indicator
     710                 :            : //! \return true if we have at least one solid, false otherwise.
     711                 :            : // *****************************************************************************
     712                 :            : {
     713                 :    7379205 :   bool haveSolid = false;
     714         [ +  + ]:   22138365 :   for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k)
     715         [ -  + ]:   14759160 :     if (solidx[k] > 0) haveSolid = true;
     716                 :            : 
     717                 :    7379205 :   return haveSolid;
     718                 :            : }
     719                 :            : 
     720                 :    2043135 : std::size_t numSolids(
     721                 :            :   std::size_t nmat,
     722                 :            :   const std::vector< std::size_t >& solidx )
     723                 :            : // *****************************************************************************
     724                 :            : //  Count total number of solid materials in the problem
     725                 :            : //! \param[in] nmat Number of materials in this PDE system
     726                 :            : //! \param[in] solidx Material index indicator
     727                 :            : //! \return Total number of solid materials in the problem
     728                 :            : // *****************************************************************************
     729                 :            : {
     730                 :            :   // count number of solid materials
     731                 :    2043135 :   std::size_t nsld(0);
     732         [ +  + ]:    6801585 :   for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k)
     733         [ -  + ]:    4758450 :     if (solidx[k] > 0) ++nsld;
     734                 :            : 
     735                 :    2043135 :   return nsld;
     736                 :            : }
     737                 :            : 
     738                 :            : } //inciter::

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