Quinoa all test code coverage report
Current view: top level - PDE/Integrate - SolidTerms.cpp (source / functions) Hit Total Coverage
Commit: -128-NOTFOUND Lines: 0 52 0.0 %
Date: 2024-11-22 08:51:48 Functions: 0 2 0.0 %
Legend: Lines: hit not hit | Branches: + taken - not taken # not executed Branches: 0 50 0.0 %

           Branch data     Line data    Source code
       1                 :            : // *****************************************************************************
       2                 :            : /*!
       3                 :            :   \file      src/PDE/Integrate/SolidTerms.cpp
       4                 :            :   \copyright 2012-2015 J. Bakosi,
       5                 :            :              2016-2018 Los Alamos National Security, LLC.,
       6                 :            :              2019-2021 Triad National Security, LLC.
       7                 :            :              All rights reserved. See the LICENSE file for details.
       8                 :            :   \brief     Functions for computing integrals for the RHS terms
       9                 :            :              of the inverse deformation equations in the multi-material
      10                 :            :              solid dynamics solver
      11                 :            :   \details   This file contains routines to integrate right hand side terms
      12                 :            :              to the inverse deformation equations for the multi-material
      13                 :            :              solid dynamics solver.
      14                 :            : */
      15                 :            : // *****************************************************************************
      16                 :            : 
      17                 :            : #include <array>
      18                 :            : #include <vector>
      19                 :            : 
      20                 :            : #include "SolidTerms.hpp"
      21                 :            : #include "Vector.hpp"
      22                 :            : #include "Quadrature.hpp"
      23                 :            : #include "Reconstruction.hpp"
      24                 :            : #include "MultiMatTerms.hpp"
      25                 :            : #include "MultiMat/MultiMatIndexing.hpp"
      26                 :            : #include "MultiMat/MiscMultiMatFns.hpp"
      27                 :            : #include "Inciter/InputDeck/InputDeck.hpp"
      28                 :            : 
      29                 :            : namespace inciter {
      30                 :            : extern ctr::InputDeck g_inputdeck;
      31                 :            : }
      32                 :            : 
      33                 :            : namespace tk {
      34                 :            : 
      35                 :            : void
      36                 :          0 : solidTermsVolInt(
      37                 :            :                std::size_t nmat,
      38                 :            :                const std::vector< inciter::EOS >& mat_blk,
      39                 :            :                const std::size_t ndof,
      40                 :            :                const std::size_t rdof,
      41                 :            :                const std::size_t nelem,
      42                 :            :                const std::vector< std::size_t >& inpoel,
      43                 :            :                const UnsMesh::Coords& coord,
      44                 :            :                const Fields& geoElem,
      45                 :            :                const Fields& U,
      46                 :            :                const Fields& P,
      47                 :            :                const std::vector< std::size_t >& ndofel,
      48                 :            :                const tk::real dt,
      49                 :            :                Fields& R,
      50                 :            :                int intsharp )
      51                 :            : // *****************************************************************************
      52                 :            : //  Compute all RHS volume terms in the inverse deformation equations to
      53                 :            : //  satisfy the condition curl(g) = 0.
      54                 :            : //! \param[in] nmat Number of materials in this PDE system
      55                 :            : //! \param[in] mat_blk EOS material block
      56                 :            : //! \param[in] ndof Maximum number of degrees of freedom
      57                 :            : //! \param[in] rdof Maximum number of reconstructed degrees of freedom
      58                 :            : //! \param[in] nelem Maximum number of elements
      59                 :            : //! \param[in] inpoel Element-node connectivity
      60                 :            : //! \param[in] coord Array of nodal coordinates
      61                 :            : //! \param[in] geoElem Element geometry array
      62                 :            : //! \param[in] U Solution vector at recent time step
      63                 :            : //! \param[in] P Vector of primitives at recent time step
      64                 :            : //! \param[in] ndofel Vector of local number of degrees of freedom
      65                 :            : //! \param[in] dt Delta time
      66                 :            : //! \param[in,out] R Right-hand side vector computed
      67                 :            : //! \param[in] intsharp Interface compression tag, an optional argument, with
      68                 :            : //!   default 0, so that it is unused for single-material and transport.
      69                 :            : // *****************************************************************************
      70                 :            : {
      71                 :            : 
      72                 :            :   using inciter::velocityDofIdx;
      73                 :            :   using inciter::volfracDofIdx;
      74                 :            :   using inciter::deformDofIdx;
      75                 :            : 
      76                 :            :   const auto& solidx =
      77                 :          0 :     inciter::g_inputdeck.get< tag::matidxmap, tag::solidx >();
      78                 :            : 
      79                 :          0 :   auto ncomp = R.nprop()/ndof;
      80                 :          0 :   auto nprim = P.nprop()/rdof;
      81                 :          0 :   const auto& cx = coord[0];
      82                 :          0 :   const auto& cy = coord[1];
      83                 :          0 :   const auto& cz = coord[2];
      84                 :            : 
      85         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t e=0; e<nelem; ++e)
      86                 :            :   {
      87                 :            : 
      88                 :            :     // Relaxation coefficient
      89                 :          0 :     tk::real eta = 1.0/(6.0*dt);
      90                 :            : 
      91         [ -  - ]:          0 :     auto ng = tk::NGvol(ndofel[e]);
      92                 :            : 
      93                 :            :     // arrays for quadrature points
      94                 :          0 :     std::array< std::vector< real >, 3 > coordgp;
      95                 :          0 :     std::vector< real > wgp;
      96                 :            : 
      97         [ -  - ]:          0 :     coordgp[0].resize( ng );
      98         [ -  - ]:          0 :     coordgp[1].resize( ng );
      99         [ -  - ]:          0 :     coordgp[2].resize( ng );
     100         [ -  - ]:          0 :     wgp.resize( ng );
     101                 :            : 
     102         [ -  - ]:          0 :     GaussQuadratureTet( ng, coordgp, wgp );
     103                 :            : 
     104                 :            :     // Extract the element coordinates
     105                 :            :     std::array< std::array< real, 3>, 4 > coordel {{
     106                 :          0 :       {{ cx[ inpoel[4*e  ] ], cy[ inpoel[4*e  ] ], cz[ inpoel[4*e  ] ] }},
     107                 :          0 :       {{ cx[ inpoel[4*e+1] ], cy[ inpoel[4*e+1] ], cz[ inpoel[4*e+1] ] }},
     108                 :          0 :       {{ cx[ inpoel[4*e+2] ], cy[ inpoel[4*e+2] ], cz[ inpoel[4*e+2] ] }},
     109                 :          0 :       {{ cx[ inpoel[4*e+3] ], cy[ inpoel[4*e+3] ], cz[ inpoel[4*e+3] ] }}}};
     110                 :            : 
     111         [ -  - ]:          0 :     for (std::size_t igp=0; igp<ng; ++igp)
     112                 :            :     {
     113                 :            :       // Compute the coordinates of quadrature point at physical domain
     114         [ -  - ]:          0 :       auto gp = eval_gp( igp, coordel, coordgp );
     115                 :            : 
     116                 :            :       // Compute the basis function
     117                 :            :       auto B =
     118         [ -  - ]:          0 :         eval_basis(rdof,coordgp[0][igp],coordgp[1][igp],coordgp[2][igp]);
     119                 :            : 
     120                 :            :       // Get state
     121                 :          0 :       std::vector< real > state;
     122         [ -  - ]:          0 :       state = evalPolynomialSol(mat_blk, intsharp, ncomp, nprim, rdof,
     123                 :          0 :         nmat, e, rdof, inpoel, coord, geoElem, gp, B, U, P);
     124                 :            : 
     125                 :            :       // Loop through materials
     126         [ -  - ]:          0 :       for (std::size_t k=0; k<nmat; ++k)
     127                 :            :       {
     128         [ -  - ]:          0 :         if (solidx[k] > 0)
     129                 :            :         {
     130                 :          0 :           tk::real alpha = state[inciter::volfracIdx(nmat, k)];
     131                 :            :           std::array< std::array< tk::real, 3 >, 3 > g;
     132                 :            :           // Compute the source terms
     133         [ -  - ]:          0 :           for (std::size_t i=0; i<3; ++i)
     134         [ -  - ]:          0 :             for (std::size_t j=0; j<3; ++j)
     135                 :          0 :               g[i][j] = state[inciter::deformIdx(nmat,solidx[k],i,j)];
     136                 :            : 
     137                 :            :           // Compute rhs factor
     138                 :          0 :           tk::real rho = state[inciter::densityIdx(nmat, k)]/alpha;
     139         [ -  - ]:          0 :           tk::real rho0 = mat_blk[k].compute< inciter::EOS::rho0 >();
     140                 :          0 :           tk::real rfact = eta*(rho/(rho0*tk::determinant(g))-1.0);
     141                 :            : 
     142                 :            :           // Compute the source terms
     143         [ -  - ]:          0 :           std::vector< real > s(9*ndof, 0.0);
     144         [ -  - ]:          0 :           for (std::size_t i=0; i<3; ++i)
     145         [ -  - ]:          0 :             for (std::size_t j=0; j<3; ++j)
     146         [ -  - ]:          0 :               for (std::size_t idof=0; idof<ndof; ++idof)
     147                 :          0 :                 s[(i*3+j)*ndof+idof] = B[idof]*rfact*g[i][j];
     148                 :            : 
     149         [ -  - ]:          0 :           auto wt = wgp[igp] * geoElem(e, 0);
     150                 :            : 
     151         [ -  - ]:          0 :           update_rhs( nmat, ndof, wt, e, solidx[k], s, R );
     152                 :            : 
     153                 :            :         }
     154                 :            :       }
     155                 :            :      }
     156                 :            :   }
     157                 :            : 
     158                 :          0 : }
     159                 :            : 
     160                 :            : void
     161                 :          0 : update_rhs( std::size_t nmat,
     162                 :            :             const std::size_t ndof,
     163                 :            :             const tk::real wt,
     164                 :            :             const std::size_t e,
     165                 :            :             const std::size_t solidx,
     166                 :            :             const std::vector< real >& s,
     167                 :            :             Fields& R )
     168                 :            : // *****************************************************************************
     169                 :            : //  Update the rhs by adding the source term integrals
     170                 :            : //! \param[in] nmat Number of materials in this PDE system
     171                 :            : //! \param[in] rdof Maximum number of degrees of freedom
     172                 :            : //! \param[in] wt Weight of gauss quadrature point
     173                 :            : //! \param[in] e Element index
     174                 :            : //! \param[in] solidx Material index indicator
     175                 :            : //! \param[in] s Source term vector
     176                 :            : //! \param[in,out] R Right-hand side vector computed
     177                 :            : // *****************************************************************************
     178                 :            : {
     179         [ -  - ]:          0 :   for (std::size_t i=0; i<3; ++i)
     180         [ -  - ]:          0 :     for (std::size_t j=0; j<3; ++j)
     181         [ -  - ]:          0 :       for (std::size_t idof=0; idof<ndof; ++idof)
     182                 :            :       {
     183                 :          0 :         std::size_t dofId = inciter::deformDofIdx(nmat,solidx,i,j,ndof,idof);
     184                 :          0 :         std::size_t srcId = (i*3+j)*ndof+idof;
     185                 :          0 :         R(e, dofId) += wt * s[srcId];
     186                 :            :       }
     187                 :          0 : }
     188                 :            : 
     189                 :            : } // tk::

Generated by: LCOV version 1.14