Branch data     Line data    Source code

       1                 :            : // *****************************************************************************
       2                 :            : /*!
       3                 :            :   \file      src/Inciter/Sorter.hpp
       4                 :            :   \copyright 2012-2015 J. Bakosi,
       5                 :            :              2016-2018 Los Alamos National Security, LLC.,
       6                 :            :              2019-2021 Triad National Security, LLC.
       7                 :            :              All rights reserved. See the LICENSE file for details.
       8                 :            :   \brief     Mesh sorter for global distributed mesh reordering
       9                 :            :   \details   Mesh sorter is Charm++ chare array and is used to do global
      10                 :            :     distributed mesh node reordering that yields consecutive unique global node
      11                 :            :     IDs with increasing PE IDs in asynchronous distributed-memory parallel
      12                 :            :     fashion.
      13                 :            : */
      14                 :            : // *****************************************************************************
      15                 :            : #ifndef Sorter_h
      16                 :            : #define Sorter_h
      17                 :            : 
      18                 :            : #include <vector>
      19                 :            : #include <map>
      20                 :            : #include <unordered_map>
      21                 :            : 
      22                 :            : #include "TaggedTuple.hpp"
      23                 :            : #include "Tags.hpp"
      24                 :            : #include "Callback.hpp"
      25                 :            : #include "UnsMesh.hpp"
      26                 :            : #include "UnsMesh.hpp"
      27                 :            : #include "Scheme.hpp"
      28                 :            : #include "CommMap.hpp"
      29                 :            : 
      30                 :            : #include "NoWarning/transporter.decl.h"
      31                 :            : #include "NoWarning/sorter.decl.h"
      32                 :            : 
      33                 :            : namespace inciter {
      34                 :            : 
      35                 :            : //! Mesh sorter for global distributed mesh node reordering
      36                 :            : class Sorter : public CBase_Sorter {
      37                 :            : 
      38                 :            :   #if defined(__clang__)
      39                 :            :     #pragma clang diagnostic push
      40                 :            :     #pragma clang diagnostic ignored "-Wunused-parameter"
      41                 :            :     #pragma clang diagnostic ignored "-Wdeprecated-declarations"
      42                 :            :   #elif defined(STRICT_GNUC)
      43                 :            :     #pragma GCC diagnostic push
      44                 :            :     #pragma GCC diagnostic ignored "-Wunused-parameter"
      45                 :            :     #pragma GCC diagnostic ignored "-Wdeprecated-declarations"
      46                 :            :   #elif defined(__INTEL_COMPILER)
      47                 :            :     #pragma warning( push )
      48                 :            :     #pragma warning( disable: 1478 )
      49                 :            :   #endif
      50                 :            :   // Include Charm++ SDAG code. See http://charm.cs.illinois.edu/manuals/html/
      51                 :            :   // charm++/manual.html, Sec. "Structured Control Flow: Structured Dagger".
      52                 :            :   Sorter_SDAG_CODE
      53                 :            :   #if defined(__clang__)
      54                 :            :     #pragma clang diagnostic pop
      55                 :            :   #elif defined(STRICT_GNUC)
      56                 :            :     #pragma GCC diagnostic pop
      57                 :            :   #elif defined(__INTEL_COMPILER)
      58                 :            :     #pragma warning( pop )
      59                 :            :   #endif
      60                 :            : 
      61                 :            :   public:
      62                 :            :     //! Constructor
      63                 :            :     explicit Sorter( std::size_t meshid,
      64                 :            :                      const CProxy_Transporter& transporter,
      65                 :            :                      const tk::CProxy_MeshWriter& meshwriter,
      66                 :            :                      const tk::SorterCallback& cbs,
      67                 :            :                      const std::vector< Scheme >& scheme,
      68                 :            :                      CkCallback reorderRefiner,
      69                 :            :                      const std::vector< std::size_t >& ginpoel,
      70                 :            :                      const tk::UnsMesh::CoordMap& coordmap,
      71                 :            :                      const tk::UnsMesh::Chunk& el,
      72                 :            :                      const std::map< int, std::vector< std::size_t > >& bface,
      73                 :            :                      const std::vector< std::size_t >& triinpoel,
      74                 :            :                      const std::map< int, std::vector< std::size_t > >& bnode,
      75                 :            :                      const std::unordered_map< std::size_t, std::set< std::size_t > >&
      76                 :            :                        elemblockid,
      77                 :            :                      int nchare );
      78                 :            : 
      79                 :            :     #if defined(__clang__)
      80                 :            :       #pragma clang diagnostic push
      81                 :            :       #pragma clang diagnostic ignored "-Wundefined-func-template"
      82                 :            :     #endif
      83                 :            :     //! Migrate constructor
      84                 :            :     // cppcheck-suppress uninitMemberVarPrivate
      85 [ +  - ][ +  - ]:       7815 :     explicit Sorter( CkMigrateMessage* ) {}
      86                 :            :     #if defined(__clang__)
      87                 :            :       #pragma clang diagnostic pop
      88                 :            :     #endif
      89                 :            : 
      90                 :            :     //! Configure Charm++ reduction types
      91                 :            :     static void registerReducers();
      92                 :            : 
      93                 :            :     //! Setup chare mesh boundary node communication map
      94                 :            :     void setup( std::size_t npoin );
      95                 :            :     //! \brief Incoming query for a list mesh nodes for which this chare
      96                 :            :     //!   compiles communication maps
      97                 :            :     void query( int fromch, const tk::AllCommMaps& bnd );
      98                 :            :     //! Report receipt of boundary node lists
      99                 :            :     void recvquery();
     100                 :            :     //! Respond to boundary node list queries
     101                 :            :     void response();
     102                 :            :     //! Receive boundary node communication maps for our mesh chunk
     103                 :            :     void bnd( int fromch, const tk::CommMaps& msum );
     104                 :            :     //! Receive receipt of boundary node communication map
     105                 :            :     void recvbnd();
     106                 :            : 
     107                 :            :     //! Start reordering (if user enabled it)
     108                 :            :     void start();
     109                 :            : 
     110                 :            :     //! \brief Receive number of uniquely assigned global mesh node IDs from
     111                 :            :     //!   chares with lower indices
     112                 :            :     void offset( int c, std::size_t u );
     113                 :            : 
     114                 :            :     //! Request new global node IDs for old node IDs
     115                 :            :     void request( int c, const std::unordered_set< std::size_t >& nd );
     116                 :            : 
     117                 :            :     //! Receive lower bound of node IDs our PE operates on after reordering
     118                 :            :     void lower( std::size_t low );
     119                 :            : 
     120                 :            :     //! Receive new (reordered) global node IDs and coordinates
     121                 :            :     void neworder( const std::unordered_map< std::size_t,
     122                 :            :            std::tuple< std::size_t, tk::UnsMesh::Coord > >& nodes );
     123                 :            : 
     124                 :            :     //! Create worker chare array elements on this PE
     125                 :            :     void createWorkers();
     126                 :            : 
     127                 :            :     //! Update mesh data we hold for whoever calls this function
     128                 :            :     void mesh( std::vector< std::size_t >& ginpoel,
     129                 :            :                tk::UnsMesh::CoordMap& coordmap,
     130                 :            :                std::vector< std::size_t >& triinpoel,
     131                 :            :                std::map< int, std::vector< std::size_t > >& bnode );
     132                 :            : 
     133                 :            :     /** @name Charm++ pack/unpack serializer member functions */
     134                 :            :     ///@{
     135                 :            :     //! \brief Pack/Unpack serialize member function
     136                 :            :     //! \param[in,out] p Charm++'s PUP::er serializer object reference
     137                 :      24215 :     void pup( PUP::er &p ) override {
     138                 :      24215 :       p | m_meshid;
     139                 :      24215 :       p | m_host;
     140                 :      24215 :       p | m_meshwriter;
     141                 :      24215 :       p | m_cbs;
     142                 :      24215 :       p | m_scheme;
     143                 :      24215 :       p | m_reorderRefiner;
     144                 :      24215 :       p | m_ginpoel;
     145                 :      24215 :       p | m_coordmap;
     146                 :      24215 :       p | m_el;
     147                 :      24215 :       p | m_nbnd;
     148                 :      24215 :       p | m_bface;
     149                 :      24215 :       p | m_triinpoel;
     150                 :      24215 :       p | m_bnode;
     151                 :      24215 :       p | m_elemblockid;
     152                 :      24215 :       p | m_nchare;
     153                 :      24215 :       p | m_nodeset;
     154                 :      24215 :       p | m_noffset;
     155                 :      24215 :       p | m_nodech;
     156                 :      24215 :       p | m_chnode;
     157                 :      24215 :       p | m_edgech;
     158                 :      24215 :       p | m_chedge;
     159                 :      24215 :       p | m_msum;
     160                 :      24215 :       p | m_reordcomm;
     161                 :      24215 :       p | m_start;
     162                 :      24215 :       p | m_newnodes;
     163                 :      24215 :       p | m_newcoordmap;
     164                 :      24215 :       p | m_reqnodes;
     165                 :      24215 :       p | m_lower;
     166                 :      24215 :       p | m_upper;
     167                 :      24215 :     }
     168                 :            :     //! \brief Pack/Unpack serialize operator|
     169                 :            :     //! \param[in,out] p Charm++'s PUP::er serializer object reference
     170                 :            :     //! \param[in,out] s Sorter object reference
     171                 :            :     friend void operator|( PUP::er& p, Sorter& s ) { s.pup(p); }
     172                 :            :     //@}
     173                 :            : 
     174                 :            :   private:
     175                 :            :     //! Mesh ID
     176                 :            :     std::size_t m_meshid;
     177                 :            :     //! Host proxy
     178                 :            :     CProxy_Transporter m_host;
     179                 :            :     //! MeshWriter proxy
     180                 :            :     tk::CProxy_MeshWriter m_meshwriter;
     181                 :            :     //! Charm++ callbacks associated to compile-time tags for sorter
     182                 :            :     tk::SorterCallback m_cbs;
     183                 :            :     //! Discretization schemes (one per mesh)
     184                 :            :     std::vector< Scheme > m_scheme;
     185                 :            :     //! Callback to use to send reordered mesh to Refiner
     186                 :            :     CkCallback m_reorderRefiner;
     187                 :            :     //! Tetrtahedron element connectivity of our chunk of the mesh (global ids)
     188                 :            :     std::vector< std::size_t > m_ginpoel;
     189                 :            :     //! Coordinates associated to global node IDs of our mesh chunk
     190                 :            :     tk::UnsMesh::CoordMap m_coordmap;
     191                 :            :     //! Elements of the mesh chunk we operate on
     192                 :            :     tk::UnsMesh::Chunk m_el;
     193                 :            :     //! Counter for number of chares contributing to chare boundary nodes
     194                 :            :     std::size_t m_nbnd;
     195                 :            :     //! List of boundary faces associated to side-set IDs
     196                 :            :     std::map< int, std::vector< std::size_t > > m_bface;
     197                 :            :     //! Boundary face-node connectivity
     198                 :            :     std::vector< std::size_t > m_triinpoel;
     199                 :            :     //! List of boundary nodes associated to side-set IDs
     200                 :            :     std::map< int, std::vector< std::size_t > > m_bnode;
     201                 :            :     //! Local tet ids associated with mesh block ids
     202                 :            :     std::unordered_map< std::size_t, std::set< std::size_t > > m_elemblockid;
     203                 :            :     //! Total number of sorter chares
     204                 :            :     int m_nchare;
     205                 :            :     //! Unique global node IDs chares on our PE will contribute to
     206                 :            :     std::set< std::size_t > m_nodeset;
     207                 :            :     //! \brief Counter for the number of chares from which this chare has
     208                 :            :     //!   received node reordering offsets from
     209                 :            :     int m_noffset;
     210                 :            :     //! Node->chare map used to build boundary node communication maps
     211                 :            :     std::unordered_map< std::size_t, std::vector< int > > m_nodech;
     212                 :            :     //! Chare->node map used to build boundary node communication maps
     213                 :            :     tk::NodeCommMap m_chnode;
     214                 :            :     //! Edge->chare map used to build boundary edge communication maps
     215                 :            :     std::unordered_map< tk::UnsMesh::Edge, std::vector< int >,
     216                 :            :                         tk::UnsMesh::Hash<2>, tk::UnsMesh::Eq<2> > m_edgech;
     217                 :            :     //! Chare->edge map used to build boundary edge communication maps
     218                 :            :     tk::EdgeCommMap m_chedge;
     219                 :            :     //! Communication maps associated to chare IDs
     220                 :            :     tk::CommMaps m_msum;
     221                 :            :     //! \brief Communication map used for distributed mesh node reordering
     222                 :            :     //! \details This map associates the list of global mesh point
     223                 :            :     //!   indices to fellow chare IDs from which this chare receives new node
     224                 :            :     //!   IDs during reordering. Only data that will be received from chares
     225                 :            :     //!   with a lower index are stored, thus this is an asymmetric
     226                 :            :     //!   communication map.
     227                 :            :     std::unordered_map< int, std::unordered_set< std::size_t > > m_reordcomm;
     228                 :            :     //! \brief Starting global mesh node ID for node reordering on this chare
     229                 :            :     //!   during mesh node reordering
     230                 :            :     std::size_t m_start;
     231                 :            :     //! Map associating new node IDs (value) to old node IDs (key)
     232                 :            :     std::unordered_map< std::size_t, std::size_t > m_newnodes;
     233                 :            :     //! Coordinates associated to global (new) node IDs during reordering
     234                 :            :     tk::UnsMesh::CoordMap m_newcoordmap;
     235                 :            :     //! Queue of requested node IDs from chares
     236                 :            :     std::vector< std::pair< int, std::unordered_set<std::size_t> > > m_reqnodes;
     237                 :            :     //! Lower bound of node IDs this chare contributes to in a linear system
     238                 :            :     std::size_t m_lower;
     239                 :            :     //! Upper bound of node IDs this chare contributes to in a linear system
     240                 :            :     std::size_t m_upper;
     241                 :            : 
     242                 :            :     //! Start preparing for mesh node reordering in parallel
     243                 :            :     void mask();
     244                 :            : 
     245                 :            :     //! Reorder global mesh node IDs
     246                 :            :     void reorder();
     247                 :            : 
     248                 :            :     //! Associate new node IDs to old ones and return them to the requestor(s)
     249                 :            :     void prepare();
     250                 :            : 
     251                 :            :     //! Compute final result of reordering
     252                 :            :     void finish();
     253                 :            : 
     254                 :            :     //! Create Discretization chare array elements on this PE
     255                 :            :     void createDiscWorkers();
     256                 :            : };
     257                 :            : 
     258                 :            : } // inciter::
     259                 :            : 
     260                 :            : #endif // Sorter_h